MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 1671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011991	CGC	2	6	38704	38709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109150
502	NC_011991	CGA	2	6	38818	38823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109150
503	NC_011991	ACT	2	6	38916	38921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109150
504	NC_011991	GCG	2	6	38932	38937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109150
505	NC_011991	GCT	2	6	38964	38969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109150
506	NC_011991	CAA	2	6	38995	39000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011991	GAT	2	6	39181	39186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
508	NC_011991	CGC	2	6	39197	39202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
509	NC_011991	GCC	2	6	39243	39248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
510	NC_011991	CAG	2	6	39400	39405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
511	NC_011991	GAC	2	6	39496	39501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
512	NC_011991	TCA	2	6	39590	39595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109151
513	NC_011991	CTG	2	6	39763	39768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
514	NC_011991	ATT	2	6	39914	39919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222109151
515	NC_011991	CGC	2	6	40075	40080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
516	NC_011991	TGG	2	6	40097	40102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109151
517	NC_011991	CCG	2	6	40190	40195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
518	NC_011991	ACG	2	6	40196	40201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
519	NC_011991	TGC	2	6	40338	40343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
520	NC_011991	TCG	2	6	40424	40429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
521	NC_011991	CTT	2	6	40467	40472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109151
522	NC_011991	GTC	2	6	40519	40524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
523	NC_011991	CTG	2	6	40789	40794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
524	NC_011991	CGA	2	6	40803	40808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
525	NC_011991	CTC	2	6	40901	40906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109151
526	NC_011991	TTG	2	6	40996	41001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109151
527	NC_011991	GCG	2	6	41014	41019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109151
528	NC_011991	CCG	2	6	41192	41197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
529	NC_011991	TGC	2	6	41217	41222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
530	NC_011991	CCA	2	6	41301	41306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109151
531	NC_011991	GCT	2	6	41359	41364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
532	NC_011991	GTC	2	6	41491	41496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
533	NC_011991	AGA	2	6	41525	41530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109151
534	NC_011991	CAA	2	6	41610	41615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109151
535	NC_011991	ATC	2	6	41713	41718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109151
536	NC_011991	GGC	2	6	41856	41861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109151
537	NC_011991	TGG	2	6	41900	41905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109151
538	NC_011991	CGA	2	6	41907	41912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
539	NC_011991	CAT	3	9	41979	41987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109151
540	NC_011991	AAC	2	6	42032	42037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109151
541	NC_011991	GAT	2	6	42039	42044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
542	NC_011991	ACG	2	6	42047	42052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
543	NC_011991	TGA	2	6	42074	42079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
544	NC_011991	CTG	2	6	42181	42186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
545	NC_011991	TCG	2	6	42218	42223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
546	NC_011991	GAA	2	6	42345	42350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109151
547	NC_011991	GAT	2	6	42622	42627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
548	NC_011991	AGC	2	6	42749	42754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
549	NC_011991	TCA	2	6	42797	42802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109151
550	NC_011991	ACA	2	6	42866	42871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109151
551	NC_011991	GAT	2	6	42978	42983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
552	NC_011991	CGG	2	6	43079	43084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109151
553	NC_011991	AAG	2	6	43108	43113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109151
554	NC_011991	CCA	2	6	43230	43235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109151
555	NC_011991	AGC	2	6	43268	43273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
556	NC_011991	GCC	2	6	43399	43404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
557	NC_011991	CCG	2	6	43425	43430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
558	NC_011991	GAC	2	6	43570	43575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
559	NC_011991	CGC	2	6	43633	43638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
560	NC_011991	GAT	2	6	43698	43703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
561	NC_011991	ACG	2	6	43721	43726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109151
562	NC_011991	TGA	2	6	43751	43756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109151
563	NC_011991	GGC	2	6	43816	43821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109151
564	NC_011991	GCT	2	6	43881	43886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109151
565	NC_011991	CGC	2	6	43934	43939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109151
566	NC_011991	AAC	2	6	43988	43993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109151
567	NC_011991	CCT	2	6	44036	44041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109151
568	NC_011991	GAG	2	6	44077	44082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109151
569	NC_011991	GAA	2	6	44220	44225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011991	CTT	2	6	44256	44261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109152
571	NC_011991	CAT	2	6	44333	44338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109152
572	NC_011991	GGC	2	6	44353	44358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109152
573	NC_011991	ATC	2	6	44570	44575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109152
574	NC_011991	AGG	2	6	44586	44591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109152
575	NC_011991	GCT	2	6	44654	44659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109152
576	NC_011991	CAT	2	6	44690	44695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109152
577	NC_011991	ACC	2	6	44751	44756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_011991	CGC	2	6	44909	44914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_011991	GAT	2	6	44970	44975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011991	GCC	2	6	44982	44987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_011991	TGT	2	6	45032	45037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011991	GGA	2	6	45095	45100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011991	TTC	2	6	45114	45119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_011991	TGG	2	6	45190	45195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109153
585	NC_011991	TGG	2	6	45203	45208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109153
586	NC_011991	TCG	2	6	45253	45258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109153
587	NC_011991	ATG	2	6	45261	45266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109153
588	NC_011991	CGC	2	6	45268	45273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109153
589	NC_011991	TCG	2	6	45304	45309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109153
590	NC_011991	GTC	2	6	45369	45374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109153
591	NC_011991	TCC	2	6	45432	45437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109153
592	NC_011991	CGA	2	6	45575	45580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109153
593	NC_011991	GGC	2	6	45593	45598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109153
594	NC_011991	CCA	2	6	45599	45604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109153
595	NC_011991	GAC	2	6	45611	45616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109153
596	NC_011991	AGA	2	6	45627	45632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011991	ACC	2	6	45672	45677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109154
598	NC_011991	TCA	2	6	45691	45696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109154
599	NC_011991	GAC	2	6	45702	45707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109154
600	NC_011991	GGT	2	6	45708	45713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109154
601	NC_011991	GCC	2	6	45852	45857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109154
602	NC_011991	CGG	2	6	45995	46000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_011991	TCT	2	6	46073	46078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109155
604	NC_011991	CAG	2	6	46143	46148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109155
605	NC_011991	GTC	2	6	46233	46238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109155
606	NC_011991	GTC	2	6	46333	46338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109155
607	NC_011991	GCC	2	6	46431	46436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109155
608	NC_011991	CAC	2	6	46448	46453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109155
609	NC_011991	TTG	2	6	46689	46694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109156
610	NC_011991	GGC	2	6	46717	46722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109156
611	NC_011991	CTG	2	6	46780	46785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109156
612	NC_011991	CTT	2	6	46795	46800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109156
613	NC_011991	CCT	2	6	46982	46987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109157
614	NC_011991	CCG	2	6	47023	47028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109157
615	NC_011991	GCC	2	6	47101	47106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109157
616	NC_011991	ATC	2	6	47278	47283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109158
617	NC_011991	CAT	2	6	47329	47334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109158
618	NC_011991	GCC	2	6	47338	47343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109158
619	NC_011991	GGC	2	6	47366	47371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109158
620	NC_011991	CCG	2	6	47398	47403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109158
621	NC_011991	CGC	2	6	47419	47424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109158
622	NC_011991	CGA	2	6	47464	47469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109158
623	NC_011991	TCG	2	6	47553	47558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109158
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625	NC_011991	TGC	2	6	47643	47648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109158
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756	NC_011991	TTC	2	6	57178	57183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_011991	CGC	2	6	57232	57237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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784	NC_011991	CGC	2	6	59738	59743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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