MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4b

Total Repeats: 1671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011991	GTC	2	6	119057	119062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109213
1502	NC_011991	TCG	2	6	119195	119200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109213
1503	NC_011991	CAC	2	6	119244	119249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109213
1504	NC_011991	ACG	2	6	119288	119293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109213
1505	NC_011991	AGA	3	9	119322	119330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109213
1506	NC_011991	TCA	2	6	119366	119371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109213
1507	NC_011991	TCC	2	6	119372	119377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109213
1508	NC_011991	TCG	2	6	119476	119481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109214
1509	NC_011991	CGG	2	6	119722	119727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109214
1510	NC_011991	CGG	2	6	119737	119742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109214
1511	NC_011991	GCC	2	6	119792	119797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109214
1512	NC_011991	CGT	2	6	119801	119806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109214
1513	NC_011991	CTG	2	6	119889	119894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
1514	NC_011991	CTG	3	9	119906	119914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
1515	NC_011991	ACC	2	6	119961	119966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109215
1516	NC_011991	TGT	3	9	119971	119979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109215
1517	NC_011991	TCC	2	6	120008	120013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109215
1518	NC_011991	ATG	2	6	120177	120182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109215
1519	NC_011991	TCT	2	6	120193	120198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109215
1520	NC_011991	CCG	2	6	120205	120210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109215
1521	NC_011991	GCT	2	6	120214	120219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
1522	NC_011991	CGT	2	6	120308	120313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109215
1523	NC_011991	GCG	2	6	120379	120384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109215
1524	NC_011991	GAC	2	6	120390	120395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
1525	NC_011991	CGA	2	6	120427	120432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
1526	NC_011991	GAC	2	6	120494	120499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
1527	NC_011991	GCA	2	6	120618	120623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109215
1528	NC_011991	GCG	2	6	120796	120801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109216
1529	NC_011991	TGT	2	6	120916	120921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109216
1530	NC_011991	GTT	2	6	120983	120988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109216
1531	NC_011991	ACG	2	6	121116	121121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109216
1532	NC_011991	TCG	2	6	121125	121130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109216
1533	NC_011991	GCC	2	6	121310	121315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109216
1534	NC_011991	CGC	2	6	121340	121345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109216
1535	NC_011991	GCC	2	6	121420	121425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
1536	NC_011991	GCC	2	6	121470	121475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
1537	NC_011991	GGC	2	6	121500	121505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
1538	NC_011991	TGC	2	6	121509	121514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1539	NC_011991	CGG	2	6	121580	121585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
1540	NC_011991	GCT	2	6	121686	121691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1541	NC_011991	ACG	2	6	121708	121713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1542	NC_011991	GAT	2	6	121719	121724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109217
1543	NC_011991	GAC	2	6	121755	121760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1544	NC_011991	TTC	2	6	121794	121799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109217
1545	NC_011991	ATC	2	6	121855	121860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109217
1546	NC_011991	CCG	2	6	121939	121944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
1547	NC_011991	CCA	2	6	121988	121993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109217
1548	NC_011991	CAC	2	6	122034	122039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109217
1549	NC_011991	GAT	3	9	122052	122060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109217
1550	NC_011991	CCG	2	6	122167	122172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109217
1551	NC_011991	CGA	2	6	122198	122203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1552	NC_011991	CTG	2	6	122226	122231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1553	NC_011991	ATA	2	6	122260	122265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222109217
1554	NC_011991	CGG	2	6	122324	122329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109217
1555	NC_011991	CGA	2	6	122486	122491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1556	NC_011991	TGC	2	6	122520	122525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109217
1557	NC_011991	GTC	2	6	122579	122584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_011991	ATC	2	6	122590	122595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_011991	TCA	2	6	122607	122612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_011991	CGC	3	9	122644	122652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_011991	CGC	2	6	122736	122741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_011991	CGG	2	6	122748	122753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_011991	ACC	2	6	122806	122811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109218
1564	NC_011991	GCC	2	6	122828	122833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109218
1565	NC_011991	CGG	2	6	122843	122848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109218
1566	NC_011991	GAA	2	6	122858	122863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109218
1567	NC_011991	CAT	2	6	122924	122929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109218
1568	NC_011991	CTG	2	6	122978	122983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
1569	NC_011991	CTG	2	6	123083	123088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
1570	NC_011991	GCC	2	6	123116	123121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109218
1571	NC_011991	CGT	2	6	123232	123237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
1572	NC_011991	CTG	2	6	123272	123277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
1573	NC_011991	GCA	2	6	123352	123357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
1574	NC_011991	TGG	2	6	123399	123404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109218
1575	NC_011991	CTG	2	6	123410	123415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109218
1576	NC_011991	TTG	2	6	123471	123476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222109218
1577	NC_011991	GAC	2	6	123524	123529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
1578	NC_011991	GCA	2	6	123586	123591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109218
1579	NC_011991	GTG	2	6	123639	123644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109219
1580	NC_011991	CGA	2	6	123692	123697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
1581	NC_011991	GGC	3	9	123734	123742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
1582	NC_011991	ATG	2	6	123910	123915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109219
1583	NC_011991	CGA	2	6	123973	123978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
1584	NC_011991	CCT	2	6	124247	124252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109219
1585	NC_011991	CTT	2	6	124260	124265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109219
1586	NC_011991	GCG	2	6	124296	124301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
1587	NC_011991	ATG	3	9	124375	124383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109219
1588	NC_011991	CCG	2	6	124400	124405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109219
1589	NC_011991	CAT	2	6	124475	124480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109219
1590	NC_011991	TGC	2	6	124572	124577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109219
1591	NC_011991	CCA	2	6	124685	124690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109219
1592	NC_011991	GCG	2	6	124697	124702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
1593	NC_011991	GGC	2	6	124904	124909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
1594	NC_011991	GGC	2	6	124925	124930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
1595	NC_011991	CAT	2	6	124940	124945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109219
1596	NC_011991	GCA	2	6	125008	125013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
1597	NC_011991	AAC	2	6	125080	125085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109219
1598	NC_011991	CTT	2	6	125118	125123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109219
1599	NC_011991	ACC	2	6	125183	125188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109219
1600	NC_011991	CGG	2	6	125315	125320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109219
1601	NC_011991	TCG	2	6	125410	125415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109219
1602	NC_011991	GCC	2	6	125433	125438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109219
1603	NC_011991	ACG	2	6	125479	125484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109219
1604	NC_011991	CGC	2	6	125683	125688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_011991	TCA	2	6	125689	125694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_011991	ATC	2	6	125782	125787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_011991	AAG	2	6	125913	125918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011991	ATG	2	6	125920	125925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011991	TCC	2	6	126017	126022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109220
1610	NC_011991	CAT	2	6	126105	126110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109220
1611	NC_011991	CGA	3	9	126122	126130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109220
1612	NC_011991	GAT	2	6	126138	126143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109220
1613	NC_011991	CGG	2	6	126155	126160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109220
1614	NC_011991	TCA	2	6	126209	126214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109220
1615	NC_011991	CAG	2	6	126240	126245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109220
1616	NC_011991	CCG	2	6	126371	126376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109221
1617	NC_011991	AAG	2	6	126403	126408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109221
1618	NC_011991	ACG	2	6	126425	126430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109221
1619	NC_011991	GAC	2	6	126438	126443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109221
1620	NC_011991	CCA	2	6	126464	126469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109221
1621	NC_011991	CTG	2	6	126541	126546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109221
1622	NC_011991	ACC	2	6	126577	126582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109221
1623	NC_011991	GCA	2	6	126593	126598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109221
1624	NC_011991	CAT	3	9	126613	126621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109221
1625	NC_011991	CGA	2	6	126848	126853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109222
1626	NC_011991	GGC	2	6	126873	126878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109222
1627	NC_011991	GAG	2	6	126939	126944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222109222
1628	NC_011991	TGC	2	6	126951	126956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109222
1629	NC_011991	GAT	2	6	126978	126983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109222
1630	NC_011991	GTG	2	6	127042	127047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109222
1631	NC_011991	TTC	2	6	127063	127068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109222
1632	NC_011991	GAA	2	6	127142	127147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109222
1633	NC_011991	CCA	2	6	127183	127188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222109222
1634	NC_011991	GTG	2	6	127246	127251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109222
1635	NC_011991	TCC	2	6	127261	127266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109222
1636	NC_011991	GGT	2	6	127336	127341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109222
1637	NC_011991	TCC	2	6	127362	127367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109222
1638	NC_011991	GAT	2	6	127386	127391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109222
1639	NC_011991	CAA	2	6	127568	127573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109222
1640	NC_011991	GAC	2	6	127742	127747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1641	NC_011991	ACA	3	9	127796	127804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1642	NC_011991	CGT	2	6	127816	127821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1643	NC_011991	TGC	2	6	127855	127860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1644	NC_011991	TCT	2	6	127913	127918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1645	NC_011991	CGA	2	6	128023	128028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1646	NC_011991	GGA	2	6	128029	128034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1647	NC_011991	TAC	2	6	128068	128073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1648	NC_011991	ACG	2	6	128543	128548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109223
1649	NC_011991	GTC	2	6	128560	128565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222109223
1650	NC_011991	GCC	2	6	128577	128582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109223
1651	NC_011991	GAT	2	6	128623	128628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222109223
1652	NC_011991	GGT	2	6	128639	128644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222109223
1653	NC_011991	CAG	2	6	128722	128727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109223
1654	NC_011991	GAC	2	6	128815	128820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109223
1655	NC_011991	TCT	2	6	128859	128864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109223
1656	NC_011991	CTC	2	6	128865	128870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222109223
1657	NC_011991	AAC	2	6	128890	128895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222109223
1658	NC_011991	ATC	2	6	128921	128926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109223
1659	NC_011991	CTT	2	6	129222	129227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109224
1660	NC_011991	GAA	2	6	129293	129298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222109224
1661	NC_011991	ATT	2	6	129392	129397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222109224
1662	NC_011991	TTC	2	6	129477	129482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222109224
1663	NC_011991	TCA	2	6	129516	129521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222109224
1664	NC_011991	CCG	2	6	129573	129578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222109224
1665	NC_011991	CAG	2	6	129781	129786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222109224
1666	NC_011991	CGG	2	6	129861	129866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222109224
1667	NC_011991	GAT	2	6	129927	129932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1668	NC_011991	TTC	2	6	130084	130089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1669	NC_011991	CGA	2	6	130103	130108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1670	NC_011991	CTC	2	6	130165	130170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1671	NC_011991	AGA	2	6	130259	130264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.