MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011982	ATCC	2	8	874	881	25 %	25 %	0 %	50 %	222080118
2	NC_011982	TTGA	2	8	1519	1526	25 %	50 %	25 %	0 %	222080119
3	NC_011982	CCAG	2	8	1601	1608	25 %	0 %	25 %	50 %	222080119
4	NC_011982	GCGT	2	8	1803	1810	0 %	25 %	50 %	25 %	222080119
5	NC_011982	CGAT	2	8	1871	1878	25 %	25 %	25 %	25 %	222080119
6	NC_011982	CTGA	2	8	2059	2066	25 %	25 %	25 %	25 %	222080119
7	NC_011982	GGGA	2	8	2152	2159	25 %	0 %	75 %	0 %	222080119
8	NC_011982	TCCA	2	8	2732	2739	25 %	25 %	0 %	50 %	222080120
9	NC_011982	TCCG	2	8	2751	2758	0 %	25 %	25 %	50 %	222080120
10	NC_011982	GAAG	2	8	2990	2997	50 %	0 %	50 %	0 %	222080120
11	NC_011982	TGCG	2	8	3169	3176	0 %	25 %	50 %	25 %	222080120
12	NC_011982	CGCA	2	8	3334	3341	25 %	0 %	25 %	50 %	222080120
13	NC_011982	GCAT	2	8	3579	3586	25 %	25 %	25 %	25 %	222080120
14	NC_011982	CGGC	2	8	3613	3620	0 %	0 %	50 %	50 %	222080120
15	NC_011982	TCGG	2	8	4551	4558	0 %	25 %	50 %	25 %	222080121
16	NC_011982	AGCG	2	8	4579	4586	25 %	0 %	50 %	25 %	222080121
17	NC_011982	GAAG	2	8	6646	6653	50 %	0 %	50 %	0 %	222080123
18	NC_011982	GAGG	2	8	7338	7345	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011982	GCCG	2	8	7558	7565	0 %	0 %	50 %	50 %	222080124
20	NC_011982	GGGC	2	8	8340	8347	0 %	0 %	75 %	25 %	222080124
21	NC_011982	ACAG	2	8	8553	8560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011982	GCCG	2	8	9347	9354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011982	CGAG	2	8	9788	9795	25 %	0 %	50 %	25 %	222080125
24	NC_011982	TGGC	2	8	9837	9844	0 %	25 %	50 %	25 %	222080125
25	NC_011982	GGAT	2	8	10373	10380	25 %	25 %	50 %	0 %	222080126
26	NC_011982	TCCG	2	8	10456	10463	0 %	25 %	25 %	50 %	222080126
27	NC_011982	ATTG	2	8	10619	10626	25 %	50 %	25 %	0 %	222080126
28	NC_011982	CAGC	2	8	11643	11650	25 %	0 %	25 %	50 %	222080127
29	NC_011982	GCTG	2	8	12027	12034	0 %	25 %	50 %	25 %	222080128
30	NC_011982	TCGC	2	8	12384	12391	0 %	25 %	25 %	50 %	222080128
31	NC_011982	TCCA	2	8	12496	12503	25 %	25 %	0 %	50 %	222080128
32	NC_011982	TCCA	2	8	12546	12553	25 %	25 %	0 %	50 %	222080128
33	NC_011982	GAAC	2	8	12907	12914	50 %	0 %	25 %	25 %	222080129
34	NC_011982	AGCC	2	8	12990	12997	25 %	0 %	25 %	50 %	222080129
35	NC_011982	ATGG	2	8	13165	13172	25 %	25 %	50 %	0 %	222080130
36	NC_011982	CAGA	2	8	13413	13420	50 %	0 %	25 %	25 %	222080130
37	NC_011982	CGAT	2	8	14986	14993	25 %	25 %	25 %	25 %	222080132
38	NC_011982	GCGG	2	8	15161	15168	0 %	0 %	75 %	25 %	222080132
39	NC_011982	CCGG	2	8	15230	15237	0 %	0 %	50 %	50 %	222080132
40	NC_011982	CCGG	2	8	15782	15789	0 %	0 %	50 %	50 %	222080133
41	NC_011982	AGCG	2	8	15984	15991	25 %	0 %	50 %	25 %	222080133
42	NC_011982	CGGC	2	8	16362	16369	0 %	0 %	50 %	50 %	222080133
43	NC_011982	CCGG	2	8	16989	16996	0 %	0 %	50 %	50 %	222080133
44	NC_011982	ATCC	2	8	17458	17465	25 %	25 %	0 %	50 %	222080133
45	NC_011982	GGCG	2	8	17476	17483	0 %	0 %	75 %	25 %	222080133
46	NC_011982	CCAT	2	8	18115	18122	25 %	25 %	0 %	50 %	222080133
47	NC_011982	CGAG	2	8	19950	19957	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011982	GGGC	2	8	20511	20518	0 %	0 %	75 %	25 %	222080135
49	NC_011982	CGCT	2	8	21842	21849	0 %	25 %	25 %	50 %	222080136
50	NC_011982	GCTT	2	8	22086	22093	0 %	50 %	25 %	25 %	222080136
51	NC_011982	CCGT	2	8	22737	22744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011982	GCCG	2	8	22908	22915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011982	GCTG	2	8	24161	24168	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011982	CGGC	2	8	24221	24228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011982	TCGC	2	8	24518	24525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011982	TCCA	2	8	24630	24637	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011982	TCCA	2	8	24680	24687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011982	TCGC	2	8	25816	25823	0 %	25 %	25 %	50 %	222080138
59	NC_011982	CAAA	2	8	26161	26168	75 %	0 %	0 %	25 %	222080138
60	NC_011982	TGGA	2	8	28583	28590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011982	TGGA	2	8	28633	28640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011982	GCGA	2	8	28745	28752	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011982	GCCG	2	8	29042	29049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011982	CAGC	2	8	29102	29109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011982	GTTG	2	8	29741	29748	0 %	50 %	50 %	0 %	222080141
66	NC_011982	TCGC	2	8	29895	29902	0 %	25 %	25 %	50 %	222080141
67	NC_011982	GCAG	2	8	29988	29995	25 %	0 %	50 %	25 %	222080141
68	NC_011982	AACA	2	8	30109	30116	75 %	0 %	0 %	25 %	222080141
69	NC_011982	GACC	2	8	30162	30169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011982	CGTC	2	8	30423	30430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011982	GCAA	2	8	30522	30529	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011982	CGCA	2	8	31014	31021	25 %	0 %	25 %	50 %	222080142
73	NC_011982	GTTC	2	8	31111	31118	0 %	50 %	25 %	25 %	222080142
74	NC_011982	TTGC	2	8	31311	31318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011982	CGTC	2	8	31342	31349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011982	TCGC	2	8	31613	31620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011982	GAAC	2	8	31957	31964	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011982	TCAG	2	8	32286	32293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011982	ATTA	2	8	32519	32526	50 %	50 %	0 %	0 %	222080143
80	NC_011982	TCCG	2	8	32673	32680	0 %	25 %	25 %	50 %	222080143
81	NC_011982	TCCT	2	8	32861	32868	0 %	50 %	0 %	50 %	222080143
82	NC_011982	GCAA	2	8	32869	32876	50 %	0 %	25 %	25 %	222080143
83	NC_011982	CCAG	2	8	32977	32984	25 %	0 %	25 %	50 %	222080143
84	NC_011982	GCTG	2	8	33462	33469	0 %	25 %	50 %	25 %	222080144
85	NC_011982	CGGC	2	8	33522	33529	0 %	0 %	50 %	50 %	222080144
86	NC_011982	TCGC	2	8	33819	33826	0 %	25 %	25 %	50 %	222080144
87	NC_011982	TCCA	2	8	33931	33938	25 %	25 %	0 %	50 %	222080144
88	NC_011982	TCCA	2	8	33981	33988	25 %	25 %	0 %	50 %	222080144
89	NC_011982	GCGG	2	8	34307	34314	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011982	AGCG	2	8	34323	34330	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011982	GCAG	2	8	34573	34580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011982	TGCC	2	8	35277	35284	0 %	25 %	25 %	50 %	222080145
93	NC_011982	GCCA	2	8	35302	35309	25 %	0 %	25 %	50 %	222080145
94	NC_011982	TCTT	2	8	35558	35565	0 %	75 %	0 %	25 %	222080146
95	NC_011982	GGCC	2	8	35782	35789	0 %	0 %	50 %	50 %	222080147
96	NC_011982	GCAA	2	8	36282	36289	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011982	CATC	2	8	36577	36584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011982	CCAT	2	8	36840	36847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011982	GCGT	2	8	36894	36901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011982	CGAT	2	8	37129	37136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011982	CCCG	2	8	37335	37342	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_011982	GAAG	2	8	37475	37482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011982	CTCG	2	8	38090	38097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011982	CGTG	2	8	38441	38448	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011982	CGCA	2	8	38510	38517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011982	CAGC	2	8	38576	38583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011982	CGGT	2	8	38701	38708	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011982	ATCG	2	8	38882	38889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011982	TCGA	2	8	39063	39070	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011982	GCCG	2	8	39086	39093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011982	AAGC	2	8	39320	39327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011982	CGAG	2	8	39542	39549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011982	GGCA	2	8	40823	40830	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011982	TTGC	2	8	41724	41731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011982	TTGA	2	8	41760	41767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011982	GCGG	2	8	41807	41814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011982	GCAC	2	8	42434	42441	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011982	AGCG	2	8	42550	42557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011982	TGCC	2	8	42631	42638	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011982	ATCA	2	8	42643	42650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011982	TTAT	2	8	42748	42755	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011982	CGCC	2	8	43244	43251	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_011982	CGTC	2	8	43460	43467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011982	TCAG	2	8	43491	43498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011982	TCAG	2	8	43573	43580	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011982	GCTA	2	8	43825	43832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011982	CCCG	2	8	44843	44850	0 %	0 %	25 %	75 %	222080149
128	NC_011982	CGCT	2	8	44933	44940	0 %	25 %	25 %	50 %	222080149
129	NC_011982	GAAA	2	8	45153	45160	75 %	0 %	25 %	0 %	222080150
130	NC_011982	AATG	2	8	47116	47123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011982	ATCA	2	8	47584	47591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011982	GGCA	2	8	47895	47902	25 %	0 %	50 %	25 %	222080152
133	NC_011982	TGGA	2	8	49334	49341	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011982	TGGA	2	8	49384	49391	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011982	GCGA	2	8	49496	49503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011982	CAGC	2	8	49853	49860	25 %	0 %	25 %	50 %	222080153
137	NC_011982	CGGC	2	8	50501	50508	0 %	0 %	50 %	50 %	222080154
138	NC_011982	CTGA	2	8	51432	51439	25 %	25 %	25 %	25 %	222080155
139	NC_011982	CTTC	2	8	51729	51736	0 %	50 %	0 %	50 %	222080156
140	NC_011982	CAAA	2	8	52430	52437	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011982	GTCG	2	8	52622	52629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011982	GATG	2	8	52667	52674	25 %	25 %	50 %	0 %	222080157
143	NC_011982	GGGT	2	8	52998	53005	0 %	25 %	75 %	0 %	222080157
144	NC_011982	CCTT	2	8	53017	53024	0 %	50 %	0 %	50 %	222080158
145	NC_011982	AGGG	2	8	53380	53387	25 %	0 %	75 %	0 %	222080158
146	NC_011982	CGAA	2	8	53505	53512	50 %	0 %	25 %	25 %	222080158
147	NC_011982	CGAT	2	8	53850	53857	25 %	25 %	25 %	25 %	222080158
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