MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 2619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011312	TACAA	2	10	679927	679936	60 %	20 %	0 %	20 %	209694209
502	NC_011312	CTCGT	2	10	680195	680204	0 %	40 %	20 %	40 %	209694209
503	NC_011312	TAATT	2	10	680424	680433	40 %	60 %	0 %	0 %	209694209
504	NC_011312	GCTTT	2	10	680451	680460	0 %	60 %	20 %	20 %	209694209
505	NC_011312	AATGA	2	10	682544	682553	60 %	20 %	20 %	0 %	209694212
506	NC_011312	GCATG	2	10	685218	685227	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
507	NC_011312	TTGTC	2	10	686277	686286	0 %	60 %	20 %	20 %	209694214
508	NC_011312	AAATA	2	10	686443	686452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011312	TGAGA	2	10	687102	687111	40 %	20 %	40 %	0 %	209694215
510	NC_011312	ATTTT	2	10	687866	687875	20 %	80 %	0 %	0 %	209694216
511	NC_011312	AAAGA	2	10	689061	689070	80 %	0 %	20 %	0 %	209694216
512	NC_011312	TTCAA	2	10	689797	689806	40 %	40 %	0 %	20 %	209694216
513	NC_011312	CAAAA	2	10	690670	690679	80 %	0 %	0 %	20 %	209694217
514	NC_011312	AATTA	2	10	694315	694324	60 %	40 %	0 %	0 %	209694220
515	NC_011312	TCGGT	2	10	696124	696133	0 %	40 %	40 %	20 %	209694221
516	NC_011312	AAGAA	2	10	696497	696506	80 %	0 %	20 %	0 %	209694221
517	NC_011312	AATTA	2	10	696521	696530	60 %	40 %	0 %	0 %	209694221
518	NC_011312	GTTAA	2	10	696724	696733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011312	AAGCG	2	10	698649	698658	40 %	0 %	40 %	20 %	209694222
520	NC_011312	TTAAT	2	10	698853	698862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011312	GTAAT	2	10	698992	699001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011312	TGTGT	2	10	699532	699541	0 %	60 %	40 %	0 %	209694223
523	NC_011312	ATAGA	2	10	701664	701673	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011312	GCAAA	2	10	703241	703250	60 %	0 %	20 %	20 %	209694225
525	NC_011312	TGAAA	2	10	703403	703412	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011312	ATCGT	2	10	704077	704086	20 %	40 %	20 %	20 %	209694226
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529	NC_011312	TGGGG	2	10	709737	709746	0 %	20 %	80 %	0 %	209694230
530	NC_011312	GGAAT	2	10	711785	711794	40 %	20 %	40 %	0 %	209694231
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532	NC_011312	CTTTT	2	10	716496	716505	0 %	80 %	0 %	20 %	209694234
533	NC_011312	GTTCT	2	10	717521	717530	0 %	60 %	20 %	20 %	209694234
534	NC_011312	ATTTC	2	10	718827	718836	20 %	60 %	0 %	20 %	209694236
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538	NC_011312	AATTT	2	10	722837	722846	40 %	60 %	0 %	0 %	209694240
539	NC_011312	AGCTA	2	10	723084	723093	40 %	20 %	20 %	20 %	209694240
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541	NC_011312	TATTT	2	10	728734	728743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011312	CAATA	2	10	729349	729358	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
543	NC_011312	GTTAG	2	10	729506	729515	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011312	CAAGC	2	10	729891	729900	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
545	NC_011312	TTCAG	2	10	731488	731497	20 %	40 %	20 %	20 %	209694248
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549	NC_011312	GAAAT	2	10	749418	749427	60 %	20 %	20 %	0 %	209694260
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551	NC_011312	AATTA	2	10	751458	751467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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553	NC_011312	GTTCA	2	10	752782	752791	20 %	40 %	20 %	20 %	209694264
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556	NC_011312	ATTAA	2	10	754491	754500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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562	NC_011312	TTATT	2	10	765864	765873	20 %	80 %	0 %	0 %	209694271
563	NC_011312	TGATT	2	10	766375	766384	20 %	60 %	20 %	0 %	209694271
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605	NC_011312	TATCT	2	10	831429	831438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
606	NC_011312	TTTGG	2	10	831463	831472	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_011312	ATCAA	2	10	834537	834546	60 %	20 %	0 %	20 %	209694335
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614	NC_011312	TGGTT	2	10	838813	838822	0 %	60 %	40 %	0 %	209694338
615	NC_011312	AAGCC	2	10	838886	838895	40 %	0 %	20 %	40 %	209694338
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622	NC_011312	TAAAA	2	10	845002	845011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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624	NC_011312	AAGGC	2	10	846268	846277	40 %	0 %	40 %	20 %	209694345
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626	NC_011312	TTTTG	2	10	847669	847678	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_011312	AAATA	2	10	850987	850996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011312	GAGTC	2	10	854699	854708	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
631	NC_011312	TTTTA	2	10	854832	854841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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