MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 2276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008578	AGCTG	2	10	1711	1720	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008578	GACGG	2	10	2106	2115	20 %	0 %	60 %	20 %	117927213
3	NC_008578	TCACC	2	10	2969	2978	20 %	20 %	0 %	60 %	117927213
4	NC_008578	CGCGC	2	10	3142	3151	0 %	0 %	40 %	60 %	117927214
5	NC_008578	GGGCA	2	10	3193	3202	20 %	0 %	60 %	20 %	117927214
6	NC_008578	GGCAG	2	10	3281	3290	20 %	0 %	60 %	20 %	117927214
7	NC_008578	CCGGA	2	10	5447	5456	20 %	0 %	40 %	40 %	117927216
8	NC_008578	CGACC	2	10	5639	5648	20 %	0 %	20 %	60 %	117927216
9	NC_008578	CCTTG	2	10	8812	8821	0 %	40 %	20 %	40 %	117927217
10	NC_008578	GATCA	2	10	9825	9834	40 %	20 %	20 %	20 %	117927218
11	NC_008578	CTCGG	2	10	11154	11163	0 %	20 %	40 %	40 %	117927219
12	NC_008578	CGGCG	2	10	12402	12411	0 %	0 %	60 %	40 %	117927222
13	NC_008578	GTCGC	2	10	15039	15048	0 %	20 %	40 %	40 %	117927226
14	NC_008578	GCAAG	2	10	15259	15268	40 %	0 %	40 %	20 %	117927226
15	NC_008578	TCACC	2	10	16494	16503	20 %	20 %	0 %	60 %	117927228
16	NC_008578	GCGGT	2	10	17480	17489	0 %	20 %	60 %	20 %	117927230
17	NC_008578	GGTCA	2	10	17811	17820	20 %	20 %	40 %	20 %	117927230
18	NC_008578	GGCGT	2	10	18037	18046	0 %	20 %	60 %	20 %	117927230
19	NC_008578	GGAGA	2	10	19997	20006	40 %	0 %	60 %	0 %	117927231
20	NC_008578	CTTGG	2	10	20450	20459	0 %	40 %	40 %	20 %	117927231
21	NC_008578	AGAGC	2	10	21099	21108	40 %	0 %	40 %	20 %	117927232
22	NC_008578	TCCGC	2	10	22028	22037	0 %	20 %	20 %	60 %	117927233
23	NC_008578	GACCA	2	10	24498	24507	40 %	0 %	20 %	40 %	117927235
24	NC_008578	GCCCG	2	10	25071	25080	0 %	0 %	40 %	60 %	117927236
25	NC_008578	GCGCA	2	10	27116	27125	20 %	0 %	40 %	40 %	117927237
26	NC_008578	CCTTT	2	10	29444	29453	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008578	CGGGG	2	10	32138	32147	0 %	0 %	80 %	20 %	117927240
28	NC_008578	GCGGA	2	10	33156	33165	20 %	0 %	60 %	20 %	117927240
29	NC_008578	CGCGT	2	10	34985	34994	0 %	20 %	40 %	40 %	117927242
30	NC_008578	GCCCG	2	10	35110	35119	0 %	0 %	40 %	60 %	117927242
31	NC_008578	GCCGC	2	10	37933	37942	0 %	0 %	40 %	60 %	117927244
32	NC_008578	GGGCT	2	10	39384	39393	0 %	20 %	60 %	20 %	117927246
33	NC_008578	TCGGT	2	10	39558	39567	0 %	40 %	40 %	20 %	117927246
34	NC_008578	GCGAG	2	10	39709	39718	20 %	0 %	60 %	20 %	117927246
35	NC_008578	CACCG	2	10	40121	40130	20 %	0 %	20 %	60 %	117927246
36	NC_008578	GACGC	2	10	42295	42304	20 %	0 %	40 %	40 %	117927247
37	NC_008578	GCCGT	2	10	43330	43339	0 %	20 %	40 %	40 %	117927249
38	NC_008578	CTCGG	2	10	43355	43364	0 %	20 %	40 %	40 %	117927249
39	NC_008578	GTGAC	2	10	45157	45166	20 %	20 %	40 %	20 %	117927251
40	NC_008578	GTCCG	2	10	45457	45466	0 %	20 %	40 %	40 %	117927251
41	NC_008578	GGCCG	2	10	47171	47180	0 %	0 %	60 %	40 %	117927252
42	NC_008578	TCGCT	2	10	48111	48120	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_008578	AAGCC	2	10	48892	48901	40 %	0 %	20 %	40 %	117927254
44	NC_008578	GATCC	2	10	50342	50351	20 %	20 %	20 %	40 %	117927256
45	NC_008578	CACGA	2	10	52126	52135	40 %	0 %	20 %	40 %	117927258
46	NC_008578	CGGGA	2	10	52976	52985	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_008578	GCGAC	2	10	53129	53138	20 %	0 %	40 %	40 %	117927259
48	NC_008578	CGCGG	2	10	55341	55350	0 %	0 %	60 %	40 %	117927260
49	NC_008578	CTCCG	2	10	55397	55406	0 %	20 %	20 %	60 %	117927260
50	NC_008578	AGTGC	2	10	57067	57076	20 %	20 %	40 %	20 %	117927262
51	NC_008578	CGGCT	2	10	57176	57185	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008578	CCGGC	2	10	58619	58628	0 %	0 %	40 %	60 %	117927263
53	NC_008578	GCACG	2	10	59563	59572	20 %	0 %	40 %	40 %	117927264
54	NC_008578	CCGGC	2	10	60140	60149	0 %	0 %	40 %	60 %	117927265
55	NC_008578	TTCCG	2	10	61821	61830	0 %	40 %	20 %	40 %	117927267
56	NC_008578	CGGGC	2	10	62363	62372	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008578	CGGTG	2	10	62471	62480	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008578	GCCGA	2	10	62643	62652	20 %	0 %	40 %	40 %	117927268
59	NC_008578	CTCGC	2	10	63193	63202	0 %	20 %	20 %	60 %	117927269
60	NC_008578	ACTGG	2	10	64318	64327	20 %	20 %	40 %	20 %	117927270
61	NC_008578	TCCGG	2	10	64567	64576	0 %	20 %	40 %	40 %	117927270
62	NC_008578	CCCGG	2	10	65362	65371	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_008578	CGGCG	2	10	65468	65477	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_008578	CCGGC	2	10	65712	65721	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_008578	GCTGG	2	10	66882	66891	0 %	20 %	60 %	20 %	117927273
66	NC_008578	GGTTC	2	10	68111	68120	0 %	40 %	40 %	20 %	117927275
67	NC_008578	CGCGC	2	10	69096	69105	0 %	0 %	40 %	60 %	117927275
68	NC_008578	AGCGG	2	10	72482	72491	20 %	0 %	60 %	20 %	117927277
69	NC_008578	GCCGA	2	10	72766	72775	20 %	0 %	40 %	40 %	117927277
70	NC_008578	CCGGC	2	10	73804	73813	0 %	0 %	40 %	60 %	117927278
71	NC_008578	ACGCG	2	10	74266	74275	20 %	0 %	40 %	40 %	117927279
72	NC_008578	GATCA	2	10	75318	75327	40 %	20 %	20 %	20 %	117927280
73	NC_008578	CGGCG	2	10	75782	75791	0 %	0 %	60 %	40 %	117927282
74	NC_008578	CCGGC	2	10	76449	76458	0 %	0 %	40 %	60 %	117927283
75	NC_008578	GCTGA	2	10	77572	77581	20 %	20 %	40 %	20 %	117927283
76	NC_008578	GAGGC	2	10	78615	78624	20 %	0 %	60 %	20 %	117927284
77	NC_008578	CGCGG	2	10	79227	79236	0 %	0 %	60 %	40 %	117927284
78	NC_008578	CTGTG	2	10	79372	79381	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008578	CGGAC	2	10	79802	79811	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_008578	TGCCG	2	10	79869	79878	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008578	GCGCC	2	10	80121	80130	0 %	0 %	40 %	60 %	117927286
82	NC_008578	GATCG	2	10	84234	84243	20 %	20 %	40 %	20 %	117927290
83	NC_008578	GCCGG	2	10	84914	84923	0 %	0 %	60 %	40 %	117927291
84	NC_008578	CCCGG	2	10	85587	85596	0 %	0 %	40 %	60 %	117927292
85	NC_008578	GGCAG	2	10	89220	89229	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008578	CGGCC	2	10	89394	89403	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_008578	GGTCG	2	10	89464	89473	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_008578	CGGCG	2	10	90128	90137	0 %	0 %	60 %	40 %	117927296
89	NC_008578	CCGGA	2	10	91606	91615	20 %	0 %	40 %	40 %	117927299
90	NC_008578	ATCCG	2	10	92125	92134	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_008578	TGGGC	2	10	98472	98481	0 %	20 %	60 %	20 %	117927306
92	NC_008578	CAGGC	2	10	98863	98872	20 %	0 %	40 %	40 %	117927306
93	NC_008578	CTCGG	2	10	100095	100104	0 %	20 %	40 %	40 %	117927307
94	NC_008578	CGTCG	2	10	100346	100355	0 %	20 %	40 %	40 %	117927307
95	NC_008578	CTCCG	2	10	100544	100553	0 %	20 %	20 %	60 %	117927307
96	NC_008578	CGATT	2	10	103452	103461	20 %	40 %	20 %	20 %	117927311
97	NC_008578	CCGCT	2	10	106685	106694	0 %	20 %	20 %	60 %	117927313
98	NC_008578	GAGCG	2	10	106832	106841	20 %	0 %	60 %	20 %	117927313
99	NC_008578	AGGTG	2	10	107611	107620	20 %	20 %	60 %	0 %	117927314
100	NC_008578	CGACG	2	10	107701	107710	20 %	0 %	40 %	40 %	117927314
101	NC_008578	CGGAC	2	10	108519	108528	20 %	0 %	40 %	40 %	117927315
102	NC_008578	CCGGC	2	10	108643	108652	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
103	NC_008578	CGACG	2	10	110705	110714	20 %	0 %	40 %	40 %	117927318
104	NC_008578	TGCCG	2	10	111391	111400	0 %	20 %	40 %	40 %	117927318
105	NC_008578	GTGCG	2	10	112613	112622	0 %	20 %	60 %	20 %	117927319
106	NC_008578	AGCGG	2	10	112982	112991	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008578	AGCGG	2	10	113005	113014	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008578	CGACC	2	10	113209	113218	20 %	0 %	20 %	60 %	117927320
109	NC_008578	TGCCG	2	10	115289	115298	0 %	20 %	40 %	40 %	117927322
110	NC_008578	GCCGG	2	10	115305	115314	0 %	0 %	60 %	40 %	117927322
111	NC_008578	CGGGC	2	10	115589	115598	0 %	0 %	60 %	40 %	117927323
112	NC_008578	ACTGC	2	10	115791	115800	20 %	20 %	20 %	40 %	117927323
113	NC_008578	CCGAT	2	10	120519	120528	20 %	20 %	20 %	40 %	117927327
114	NC_008578	CGACC	2	10	121598	121607	20 %	0 %	20 %	60 %	117927328
115	NC_008578	GGTCG	2	10	123139	123148	0 %	20 %	60 %	20 %	117927330
116	NC_008578	TCCAC	2	10	123337	123346	20 %	20 %	0 %	60 %	117927330
117	NC_008578	CACCG	2	10	124959	124968	20 %	0 %	20 %	60 %	117927331
118	NC_008578	CGAGG	2	10	125051	125060	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_008578	CCATG	2	10	126247	126256	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_008578	AGCTC	2	10	127637	127646	20 %	20 %	20 %	40 %	117927337
121	NC_008578	AATGA	2	10	128610	128619	60 %	20 %	20 %	0 %	117927337
122	NC_008578	ACGGG	2	10	131492	131501	20 %	0 %	60 %	20 %	117927339
123	NC_008578	GACGT	2	10	133497	133506	20 %	20 %	40 %	20 %	117927340
124	NC_008578	CGTGG	2	10	134904	134913	0 %	20 %	60 %	20 %	117927341
125	NC_008578	CGGCG	2	10	135028	135037	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
126	NC_008578	TCACC	2	10	135452	135461	20 %	20 %	0 %	60 %	117927342
127	NC_008578	GTGGC	2	10	136151	136160	0 %	20 %	60 %	20 %	117927343
128	NC_008578	GGCGA	2	10	138982	138991	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008578	CAAAT	2	10	139859	139868	60 %	20 %	0 %	20 %	117927345
130	NC_008578	GGGTC	2	10	140770	140779	0 %	20 %	60 %	20 %	117927346
131	NC_008578	CGGTC	2	10	142029	142038	0 %	20 %	40 %	40 %	117927347
132	NC_008578	GTCCG	2	10	144435	144444	0 %	20 %	40 %	40 %	117927349
133	NC_008578	GACGC	2	10	144498	144507	20 %	0 %	40 %	40 %	117927349
134	NC_008578	TCCCA	2	10	145280	145289	20 %	20 %	0 %	60 %	117927349
135	NC_008578	GCTTG	2	10	145640	145649	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_008578	GCCGA	2	10	146958	146967	20 %	0 %	40 %	40 %	117927350
137	NC_008578	ACCGG	2	10	148751	148760	20 %	0 %	40 %	40 %	117927353
138	NC_008578	GCCAG	2	10	149014	149023	20 %	0 %	40 %	40 %	117927353
139	NC_008578	GTGCC	2	10	151421	151430	0 %	20 %	40 %	40 %	117927355
140	NC_008578	TGGGC	2	10	153698	153707	0 %	20 %	60 %	20 %	117927358
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142	NC_008578	GTGAC	2	10	154709	154718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_008578	GCCGA	2	10	162302	162311	20 %	0 %	40 %	40 %	117927364
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160	NC_008578	GGGTC	2	10	169156	169165	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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