MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidothermus cellulolyticus 11B chromosome

Total Repeats: 2276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008578	GCACG	2	10	524917	524926	20 %	0 %	40 %	40 %	117927698
502	NC_008578	CCGCC	2	10	526279	526288	0 %	0 %	20 %	80 %	117927698
503	NC_008578	GTGAC	2	10	528980	528989	20 %	20 %	40 %	20 %	117927702
504	NC_008578	GGAGA	2	10	530483	530492	40 %	0 %	60 %	0 %	117927704
505	NC_008578	CGATG	2	10	530939	530948	20 %	20 %	40 %	20 %	117927705
506	NC_008578	CCGCC	2	10	532802	532811	0 %	0 %	20 %	80 %	117927708
507	NC_008578	CCGTG	2	10	533339	533348	0 %	20 %	40 %	40 %	117927709
508	NC_008578	CGCGG	2	10	533906	533915	0 %	0 %	60 %	40 %	117927709
509	NC_008578	CGGCG	2	10	535451	535460	0 %	0 %	60 %	40 %	117927711
510	NC_008578	GCCGG	2	10	535843	535852	0 %	0 %	60 %	40 %	117927711
511	NC_008578	ACCAG	2	10	537098	537107	40 %	0 %	20 %	40 %	117927713
512	NC_008578	TGCCG	2	10	538039	538048	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
513	NC_008578	CACGT	2	10	542640	542649	20 %	20 %	20 %	40 %	117927717
514	NC_008578	CCAGC	2	10	542939	542948	20 %	0 %	20 %	60 %	117927717
515	NC_008578	GCCGG	2	10	543091	543100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
516	NC_008578	CAGCG	2	10	545472	545481	20 %	0 %	40 %	40 %	117927720
517	NC_008578	GCGGG	2	10	545807	545816	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
518	NC_008578	GCTGG	2	10	546439	546448	0 %	20 %	60 %	20 %	117927721
519	NC_008578	GCCTT	2	10	547912	547921	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
520	NC_008578	CTGAC	2	10	550092	550101	20 %	20 %	20 %	40 %	117927724
521	NC_008578	GAGGT	2	10	553135	553144	20 %	20 %	60 %	0 %	117927728
522	NC_008578	ACCGA	2	10	555558	555567	40 %	0 %	20 %	40 %	117927729
523	NC_008578	CCGGG	2	10	555820	555829	0 %	0 %	60 %	40 %	117927729
524	NC_008578	GGTGG	2	10	558767	558776	0 %	20 %	80 %	0 %	117927730
525	NC_008578	TCCGT	2	10	562773	562782	0 %	40 %	20 %	40 %	117927735
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527	NC_008578	TGACG	2	10	565110	565119	20 %	20 %	40 %	20 %	117927737
528	NC_008578	TCCGG	2	10	565775	565784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
529	NC_008578	TCCGC	2	10	566966	566975	0 %	20 %	20 %	60 %	117927740
530	NC_008578	TCCAG	2	10	569059	569068	20 %	20 %	20 %	40 %	117927743
531	NC_008578	TCACG	2	10	569388	569397	20 %	20 %	20 %	40 %	117927743
532	NC_008578	CGTCG	2	10	569449	569458	0 %	20 %	40 %	40 %	117927743
533	NC_008578	GGCAC	2	10	571465	571474	20 %	0 %	40 %	40 %	117927745
534	NC_008578	ACTGC	2	10	571524	571533	20 %	20 %	20 %	40 %	117927745
535	NC_008578	TGAGC	2	10	572901	572910	20 %	20 %	40 %	20 %	117927747
536	NC_008578	CAGCG	2	10	575899	575908	20 %	0 %	40 %	40 %	117927753
537	NC_008578	CGTGA	2	10	576246	576255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
538	NC_008578	AGCGG	2	10	576374	576383	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
539	NC_008578	TTCGG	2	10	577498	577507	0 %	40 %	40 %	20 %	117927754
540	NC_008578	ACCGA	2	10	578752	578761	40 %	0 %	20 %	40 %	117927755
541	NC_008578	CTGCA	2	10	580986	580995	20 %	20 %	20 %	40 %	117927758
542	NC_008578	GGTCG	2	10	580997	581006	0 %	20 %	60 %	20 %	117927758
543	NC_008578	GTCCG	2	10	582044	582053	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
544	NC_008578	CGTGC	2	10	583041	583050	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
545	NC_008578	TCACC	2	10	583540	583549	20 %	20 %	0 %	60 %	117927760
546	NC_008578	CCACC	2	10	583572	583581	20 %	0 %	0 %	80 %	117927760
547	NC_008578	GACGA	2	10	584623	584632	40 %	0 %	40 %	20 %	117927761
548	NC_008578	CGGTT	2	10	584837	584846	0 %	40 %	40 %	20 %	117927761
549	NC_008578	AGGGG	2	10	587403	587412	20 %	0 %	80 %	0 %	117927763
550	NC_008578	GACCC	2	10	588860	588869	20 %	0 %	20 %	60 %	117927765
551	NC_008578	GGGGT	2	10	589209	589218	0 %	20 %	80 %	0 %	117927765
552	NC_008578	CGGCC	2	10	589917	589926	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
553	NC_008578	GGTGA	2	10	591573	591582	20 %	20 %	60 %	0 %	117927767
554	NC_008578	GGGTC	2	10	591908	591917	0 %	20 %	60 %	20 %	117927767
555	NC_008578	GCCGC	2	10	597022	597031	0 %	0 %	40 %	60 %	117927773
556	NC_008578	GTCGT	2	10	598225	598234	0 %	40 %	40 %	20 %	117927775
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558	NC_008578	TGTCG	2	10	599582	599591	0 %	40 %	40 %	20 %	117927777
559	NC_008578	CGGTC	2	10	600288	600297	0 %	20 %	40 %	40 %	117927777
560	NC_008578	GTCGA	2	10	603036	603045	20 %	20 %	40 %	20 %	117927781
561	NC_008578	GCTAC	2	10	606185	606194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
562	NC_008578	ACTCG	2	10	607325	607334	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
563	NC_008578	GGTCA	2	10	607592	607601	20 %	20 %	40 %	20 %	117927785
564	NC_008578	CAGAT	2	10	607638	607647	40 %	20 %	20 %	20 %	117927785
565	NC_008578	GGCCT	2	10	611372	611381	0 %	20 %	40 %	40 %	117927788
566	NC_008578	CCGTG	2	10	612585	612594	0 %	20 %	40 %	40 %	117927789
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568	NC_008578	CGGCG	2	10	614958	614967	0 %	0 %	60 %	40 %	117927791
569	NC_008578	GATGT	2	10	615456	615465	20 %	40 %	40 %	0 %	117927791
570	NC_008578	GGTCC	2	10	617487	617496	0 %	20 %	40 %	40 %	117927794
571	NC_008578	CGCTG	2	10	617535	617544	0 %	20 %	40 %	40 %	117927794
572	NC_008578	TCCGC	2	10	619789	619798	0 %	20 %	20 %	60 %	117927794
573	NC_008578	GCACG	2	10	619867	619876	20 %	0 %	40 %	40 %	117927794
574	NC_008578	CCGCC	2	10	620054	620063	0 %	0 %	20 %	80 %	117927794
575	NC_008578	ACGGG	2	10	620230	620239	20 %	0 %	60 %	20 %	117927794
576	NC_008578	CGCCA	2	10	622709	622718	20 %	0 %	20 %	60 %	117927796
577	NC_008578	GATCA	2	10	622811	622820	40 %	20 %	20 %	20 %	117927796
578	NC_008578	CCCGG	2	10	623112	623121	0 %	0 %	40 %	60 %	117927796
579	NC_008578	CCACG	2	10	627981	627990	20 %	0 %	20 %	60 %	117927801
580	NC_008578	GCTCC	2	10	628374	628383	0 %	20 %	20 %	60 %	117927802
581	NC_008578	GTAGG	2	10	629333	629342	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_008578	TGGCG	2	10	633535	633544	0 %	20 %	60 %	20 %	117927805
584	NC_008578	CCACT	2	10	634157	634166	20 %	20 %	0 %	60 %	117927805
585	NC_008578	AGGGC	2	10	634322	634331	20 %	0 %	60 %	20 %	117927806
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591	NC_008578	GCCGA	2	10	640229	640238	20 %	0 %	40 %	40 %	117927811
592	NC_008578	CGCGG	2	10	641041	641050	0 %	0 %	60 %	40 %	117927811
593	NC_008578	CCGTC	2	10	641350	641359	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
594	NC_008578	GCTAA	2	10	642344	642353	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
595	NC_008578	CGGCA	2	10	642763	642772	20 %	0 %	40 %	40 %	117927813
596	NC_008578	CGGCG	2	10	642810	642819	0 %	0 %	60 %	40 %	117927813
597	NC_008578	CCCGG	2	10	646606	646615	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
598	NC_008578	GGAAA	2	10	646727	646736	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008578	ACGGA	2	10	647282	647291	40 %	0 %	40 %	20 %	117927817
600	NC_008578	AGCGC	2	10	647296	647305	20 %	0 %	40 %	40 %	117927817
601	NC_008578	CGGAC	2	10	648704	648713	20 %	0 %	40 %	40 %	117927818
602	NC_008578	CGATG	2	10	649716	649725	20 %	20 %	40 %	20 %	117927818
603	NC_008578	GTGCT	2	10	649873	649882	0 %	40 %	40 %	20 %	117927818
604	NC_008578	GAGCC	2	10	652037	652046	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
605	NC_008578	GATTG	2	10	652955	652964	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
606	NC_008578	GGGTG	2	10	660167	660176	0 %	20 %	80 %	0 %	117927824
607	NC_008578	GCAAG	2	10	662601	662610	40 %	0 %	40 %	20 %	117927825
608	NC_008578	GGGTG	2	10	667415	667424	0 %	20 %	80 %	0 %	117927826
609	NC_008578	GGGGT	2	10	669619	669628	0 %	20 %	80 %	0 %	117927827
610	NC_008578	TCGGT	2	10	671337	671346	0 %	40 %	40 %	20 %	117927828
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612	NC_008578	GCGGA	2	10	672462	672471	20 %	0 %	60 %	20 %	117927829
613	NC_008578	GCTGA	2	10	672772	672781	20 %	20 %	40 %	20 %	117927829
614	NC_008578	TCCGG	2	10	673376	673385	0 %	20 %	40 %	40 %	117927830
615	NC_008578	CCGCA	2	10	673501	673510	20 %	0 %	20 %	60 %	117927830
616	NC_008578	GCCGC	2	10	674093	674102	0 %	0 %	40 %	60 %	117927830
617	NC_008578	GGCCC	2	10	674141	674150	0 %	0 %	40 %	60 %	117927830
618	NC_008578	GTCCC	2	10	675818	675827	0 %	20 %	20 %	60 %	117927832
619	NC_008578	TGCGG	2	10	676688	676697	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
620	NC_008578	CGGCG	2	10	679043	679052	0 %	0 %	60 %	40 %	117927835
621	NC_008578	CCGCG	2	10	679203	679212	0 %	0 %	40 %	60 %	117927836
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623	NC_008578	TGCCG	2	10	681743	681752	0 %	20 %	40 %	40 %	117927837
624	NC_008578	CACGT	2	10	682342	682351	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
625	NC_008578	CCCCG	2	10	683792	683801	0 %	0 %	20 %	80 %	117927839
626	NC_008578	CCGGC	2	10	684318	684327	0 %	0 %	40 %	60 %	117927839
627	NC_008578	CGTGG	2	10	685320	685329	0 %	20 %	60 %	20 %	117927840
628	NC_008578	CAGAC	2	10	686156	686165	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
629	NC_008578	CGCGG	2	10	686524	686533	0 %	0 %	60 %	40 %	117927841
630	NC_008578	GGGCC	2	10	686852	686861	0 %	0 %	60 %	40 %	117927841
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