MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 15865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004842	TTG	2	6	36789	36794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416404
502	NC_004842	CTT	2	6	36881	36886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
503	NC_004842	ATT	2	6	36987	36992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416404
504	NC_004842	TTC	2	6	37016	37021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
505	NC_004842	ATG	2	6	37071	37076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
506	NC_004842	GAA	2	6	37115	37120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416404
507	NC_004842	CCA	2	6	37155	37160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416404
508	NC_004842	GAT	2	6	37176	37181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
509	NC_004842	TAG	2	6	37226	37231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
510	NC_004842	TCA	2	6	37317	37322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
511	NC_004842	CTG	2	6	37448	37453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416404
512	NC_004842	GGT	2	6	37479	37484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416404
513	NC_004842	ATG	2	6	37524	37529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416404
514	NC_004842	CTT	2	6	37763	37768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
515	NC_004842	ATC	2	6	37793	37798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
516	NC_004842	CTA	2	6	37861	37866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
517	NC_004842	CCT	2	6	37887	37892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416404
518	NC_004842	ACT	2	6	37956	37961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416404
519	NC_004842	CTC	2	6	37967	37972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416404
520	NC_004842	CTC	2	6	37988	37993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416404
521	NC_004842	CTT	2	6	38064	38069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416404
522	NC_004842	GGA	2	6	38084	38089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416404
523	NC_004842	TTG	2	6	38115	38120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416404
524	NC_004842	CTG	2	6	38181	38186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_004842	CCA	2	6	38293	38298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416405
526	NC_004842	ATA	2	6	38310	38315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416405
527	NC_004842	TCA	2	6	38319	38324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416405
528	NC_004842	TCG	2	6	38416	38421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416405
529	NC_004842	CTC	2	6	38544	38549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416405
530	NC_004842	ACC	2	6	38583	38588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416405
531	NC_004842	TAT	2	6	38767	38772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416405
532	NC_004842	CCA	2	6	38773	38778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416405
533	NC_004842	GAC	2	6	38826	38831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416405
534	NC_004842	ACA	2	6	38912	38917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_004842	GCA	2	6	39054	39059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_004842	ACC	2	6	39126	39131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_004842	TCC	2	6	39290	39295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416406
538	NC_004842	AAG	2	6	39299	39304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416406
539	NC_004842	CCA	2	6	39348	39353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416406
540	NC_004842	GTT	2	6	39544	39549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416407
541	NC_004842	TGA	2	6	39731	39736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416407
542	NC_004842	GCT	2	6	39911	39916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416408
543	NC_004842	AGA	2	6	39928	39933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416408
544	NC_004842	TGC	2	6	39987	39992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416408
545	NC_004842	AGC	2	6	40110	40115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416408
546	NC_004842	CAG	2	6	40216	40221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416408
547	NC_004842	CGT	2	6	40392	40397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416408
548	NC_004842	ACT	2	6	40569	40574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416408
549	NC_004842	TTC	2	6	40625	40630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416408
550	NC_004842	TTG	2	6	40938	40943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004842	CGC	2	6	40999	41004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416409
552	NC_004842	TGG	2	6	41012	41017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416409
553	NC_004842	ATC	2	6	41060	41065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416409
554	NC_004842	ATC	2	6	41183	41188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416409
555	NC_004842	GCC	2	6	41253	41258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416409
556	NC_004842	GCG	2	6	41276	41281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416409
557	NC_004842	CAA	2	6	41305	41310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416409
558	NC_004842	AAG	2	6	41510	41515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416409
559	NC_004842	AAT	2	6	41533	41538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416409
560	NC_004842	GCC	2	6	41642	41647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416409
561	NC_004842	AAC	2	6	41696	41701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416409
562	NC_004842	GCG	2	6	41709	41714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416409
563	NC_004842	ATA	2	6	41717	41722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416409
564	NC_004842	CTT	2	6	41819	41824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_004842	TTG	2	6	41831	41836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004842	TGA	2	6	41888	41893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004842	TGC	2	6	41947	41952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416410
568	NC_004842	GCA	2	6	41961	41966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416410
569	NC_004842	CCA	2	6	41976	41981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416410
570	NC_004842	TGC	2	6	42030	42035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416410
571	NC_004842	TGA	2	6	42043	42048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416410
572	NC_004842	TGC	2	6	42082	42087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416410
573	NC_004842	TGC	2	6	42144	42149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416410
574	NC_004842	AGA	2	6	42214	42219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416410
575	NC_004842	GCT	2	6	42250	42255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416410
576	NC_004842	GAA	2	6	42529	42534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416410
577	NC_004842	GTA	2	6	42881	42886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416410
578	NC_004842	AGC	2	6	43029	43034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416410
579	NC_004842	AAC	2	6	43049	43054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416410
580	NC_004842	CGC	2	6	43108	43113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416410
581	NC_004842	GCC	2	6	43118	43123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416410
582	NC_004842	ACA	2	6	43184	43189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416410
583	NC_004842	CAA	3	9	43253	43261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_004842	CGC	2	6	43326	43331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_004842	ACG	2	6	43333	43338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_004842	CCA	2	6	43348	43353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_004842	CAA	2	6	43392	43397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416411
588	NC_004842	CAC	2	6	43497	43502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416411
589	NC_004842	TCT	2	6	43596	43601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416411
590	NC_004842	GCA	2	6	43711	43716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_004842	GCT	2	6	43796	43801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_004842	TGC	2	6	43879	43884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_004842	AGC	2	6	44076	44081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416412
594	NC_004842	TGC	2	6	44260	44265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416412
595	NC_004842	AAG	2	6	44343	44348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416412
596	NC_004842	TGT	2	6	44495	44500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416412
597	NC_004842	CAT	2	6	44504	44509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416412
598	NC_004842	TCA	2	6	44701	44706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416412
599	NC_004842	TCA	2	6	44737	44742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416412
600	NC_004842	CTG	2	6	44871	44876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416412
601	NC_004842	TGC	2	6	44984	44989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416412
602	NC_004842	TGG	2	6	45062	45067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416412
603	NC_004842	ATA	2	6	45138	45143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416412
604	NC_004842	GGA	2	6	45293	45298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_004842	CAG	2	6	45304	45309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_004842	AGC	2	6	45338	45343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_004842	GCC	2	6	45349	45354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_004842	CCA	2	6	45360	45365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_004842	GTA	2	6	45385	45390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_004842	CAC	2	6	45499	45504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_004842	CAG	2	6	45553	45558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004842	TCA	2	6	45594	45599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_004842	CAA	2	6	45721	45726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_004842	ACC	2	6	45740	45745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_004842	AAC	2	6	45767	45772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_004842	TCA	2	6	45900	45905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_004842	TTA	2	6	45915	45920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_004842	CAG	2	6	45949	45954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_004842	GCA	2	6	45969	45974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_004842	AAT	2	6	46006	46011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004842	GTA	2	6	46068	46073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_004842	CTT	2	6	46220	46225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_004842	TCC	2	6	46248	46253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_004842	TCT	2	6	46392	46397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_004842	CTG	2	6	46405	46410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_004842	TCT	2	6	46482	46487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_004842	TCT	2	6	46514	46519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_004842	TCT	2	6	46579	46584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_004842	GCT	2	6	46671	46676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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