MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 15865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004842	TCT	2	6	383001	383006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416657
5002	NC_004842	TCC	2	6	383016	383021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416657
5003	NC_004842	CTG	2	6	383049	383054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416657
5004	NC_004842	ATT	2	6	383072	383077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416657
5005	NC_004842	TGC	2	6	383415	383420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416657
5006	NC_004842	ATG	2	6	383429	383434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416657
5007	NC_004842	TTA	2	6	383522	383527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416657
5008	NC_004842	AGC	2	6	383549	383554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416657
5009	NC_004842	TGT	2	6	383722	383727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416657
5010	NC_004842	AGA	2	6	383951	383956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416657
5011	NC_004842	GTG	2	6	384032	384037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_004842	GGT	2	6	384085	384090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_004842	CTG	2	6	384253	384258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_004842	CAT	2	6	384447	384452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416658
5015	NC_004842	CTC	2	6	384469	384474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416658
5016	NC_004842	GGC	2	6	384511	384516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416658
5017	NC_004842	GCA	2	6	384564	384569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416658
5018	NC_004842	TTA	2	6	384857	384862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416658
5019	NC_004842	TGT	2	6	384946	384951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_004842	GTC	2	6	385137	385142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416659
5021	NC_004842	TGT	2	6	385157	385162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416659
5022	NC_004842	CTT	2	6	385221	385226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416659
5023	NC_004842	AGG	2	6	385375	385380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416659
5024	NC_004842	ACA	2	6	385411	385416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416659
5025	NC_004842	GCT	2	6	385676	385681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416659
5026	NC_004842	TCC	2	6	385719	385724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416659
5027	NC_004842	GAT	2	6	385728	385733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416659
5028	NC_004842	CTG	2	6	385857	385862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416659
5029	NC_004842	GGT	2	6	385979	385984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416659
5030	NC_004842	GGT	2	6	386084	386089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416659
5031	NC_004842	TAC	2	6	386092	386097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416659
5032	NC_004842	AAG	2	6	386229	386234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416659
5033	NC_004842	TAC	3	9	386361	386369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416659
5034	NC_004842	TGA	2	6	386384	386389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416659
5035	NC_004842	GTG	2	6	386406	386411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416659
5036	NC_004842	TTG	2	6	386448	386453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416659
5037	NC_004842	GGC	2	6	386480	386485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416660
5038	NC_004842	GTT	2	6	386627	386632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416660
5039	NC_004842	GTA	2	6	386845	386850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416660
5040	NC_004842	GCT	2	6	386997	387002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416660
5041	NC_004842	TGT	2	6	387247	387252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416660
5042	NC_004842	AGG	2	6	387292	387297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416660
5043	NC_004842	TTG	2	6	387333	387338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416660
5044	NC_004842	GAA	2	6	387404	387409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416660
5045	NC_004842	ACG	2	6	387445	387450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416660
5046	NC_004842	TGG	2	6	387613	387618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416660
5047	NC_004842	GAA	2	6	387750	387755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416660
5048	NC_004842	AAT	2	6	387779	387784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416660
5049	NC_004842	TTG	2	6	387847	387852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416660
5050	NC_004842	TAA	2	6	387907	387912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416660
5051	NC_004842	TGC	2	6	388036	388041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_004842	GCT	2	6	388219	388224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_004842	GTA	2	6	388243	388248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_004842	ATT	2	6	388501	388506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416661
5055	NC_004842	GTT	2	6	388549	388554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416661
5056	NC_004842	GCA	2	6	388718	388723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416661
5057	NC_004842	ATG	2	6	388867	388872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416661
5058	NC_004842	TAC	2	6	388903	388908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416661
5059	NC_004842	GGT	2	6	388920	388925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416661
5060	NC_004842	AAG	2	6	389002	389007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416661
5061	NC_004842	CTG	2	6	389030	389035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416661
5062	NC_004842	GCT	2	6	389053	389058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416661
5063	NC_004842	GAA	2	6	389134	389139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416661
5064	NC_004842	TGT	2	6	389223	389228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416661
5065	NC_004842	GCA	2	6	389381	389386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_004842	TGC	2	6	389407	389412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_004842	ATG	2	6	389447	389452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_004842	TTA	2	6	389471	389476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_004842	GGT	2	6	389498	389503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_004842	TAT	2	6	389505	389510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_004842	ACT	2	6	389543	389548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416662
5072	NC_004842	GTC	2	6	389699	389704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416662
5073	NC_004842	ACT	2	6	389748	389753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416662
5074	NC_004842	GGC	2	6	389897	389902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416662
5075	NC_004842	CTC	2	6	389922	389927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416662
5076	NC_004842	TGC	3	9	389986	389994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416662
5077	NC_004842	TCT	2	6	390011	390016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416662
5078	NC_004842	CAT	2	6	390193	390198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416662
5079	NC_004842	TGA	2	6	390241	390246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416662
5080	NC_004842	GGA	2	6	390280	390285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416662
5081	NC_004842	ACC	2	6	390428	390433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416662
5082	NC_004842	TTC	2	6	390577	390582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416662
5083	NC_004842	AGG	2	6	390731	390736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416662
5084	NC_004842	GCA	2	6	391020	391025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_004842	CTC	2	6	391098	391103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416663
5086	NC_004842	TCT	2	6	391123	391128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416663
5087	NC_004842	AGT	2	6	391218	391223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416663
5088	NC_004842	GTC	2	6	391230	391235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416663
5089	NC_004842	CAC	2	6	391260	391265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416663
5090	NC_004842	GCC	2	6	391273	391278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416663
5091	NC_004842	CGA	2	6	391316	391321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416663
5092	NC_004842	CTC	2	6	391393	391398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416663
5093	NC_004842	ATC	2	6	391483	391488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416663
5094	NC_004842	CGA	2	6	391613	391618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416663
5095	NC_004842	CAA	2	6	391622	391627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416663
5096	NC_004842	TGC	2	6	391854	391859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416663
5097	NC_004842	TTG	2	6	391920	391925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416663
5098	NC_004842	CAA	2	6	391928	391933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416663
5099	NC_004842	GCA	2	6	392002	392007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416663
5100	NC_004842	GCT	2	6	392103	392108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_004842	GCC	2	6	392257	392262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416664
5102	NC_004842	CTG	2	6	392359	392364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416664
5103	NC_004842	GTG	2	6	392379	392384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416664
5104	NC_004842	GCG	2	6	392823	392828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416664
5105	NC_004842	CCA	2	6	392931	392936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_004842	AAC	2	6	392973	392978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_004842	TAC	2	6	393015	393020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416665
5108	NC_004842	TTA	2	6	393160	393165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416665
5109	NC_004842	AGA	2	6	393179	393184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416665
5110	NC_004842	GAA	2	6	393221	393226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416665
5111	NC_004842	AAG	2	6	393288	393293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416665
5112	NC_004842	GAA	2	6	393333	393338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416665
5113	NC_004842	CGC	2	6	393825	393830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_004842	CGG	2	6	393941	393946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_004842	CGC	2	6	394022	394027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_004842	GCC	2	6	394160	394165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_004842	ACC	2	6	394212	394217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5118	NC_004842	GGA	2	6	394232	394237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_004842	CAA	2	6	394327	394332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_004842	GCA	2	6	394343	394348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_004842	ACA	2	6	394418	394423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_004842	CAA	2	6	394468	394473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_004842	CTA	2	6	394478	394483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_004842	CTT	2	6	394499	394504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_004842	CTT	2	6	394549	394554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_004842	TAA	2	6	394843	394848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_004842	GCT	2	6	395081	395086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416666
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5146	NC_004842	ACA	2	6	396412	396417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5147	NC_004842	CGC	2	6	396536	396541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5148	NC_004842	TGA	2	6	396554	396559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5150	NC_004842	TTG	2	6	396690	396695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5151	NC_004842	CCA	2	6	396703	396708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5152	NC_004842	ACA	2	6	396756	396761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5153	NC_004842	GCA	2	6	396765	396770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5155	NC_004842	GCT	2	6	396957	396962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5157	NC_004842	ATA	2	6	397106	397111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5240	NC_004842	CAT	2	6	403721	403726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416673
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5242	NC_004842	CTG	2	6	403891	403896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416673
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5366	NC_004842	CTG	2	6	414109	414114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161544990
5367	NC_004842	TGC	2	6	414132	414137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161544990
5368	NC_004842	TCT	2	6	414252	414257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161544990
5369	NC_004842	ATG	2	6	414284	414289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161544990
5370	NC_004842	CAT	2	6	414540	414545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544990
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5372	NC_004842	TGT	2	6	414844	414849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161544990
5373	NC_004842	CTG	2	6	414890	414895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161544990
5374	NC_004842	CAT	2	6	414918	414923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544990
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5378	NC_004842	CTA	2	6	415413	415418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544990
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5381	NC_004842	CTA	2	6	415734	415739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161544990
5382	NC_004842	GGA	2	6	415833	415838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_004842	CAC	2	6	415858	415863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5384	NC_004842	TAC	2	6	416106	416111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416685
5385	NC_004842	TGC	2	6	416140	416145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416685
5386	NC_004842	GTA	2	6	416170	416175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416685
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5388	NC_004842	ACC	2	6	416292	416297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416685
5389	NC_004842	ATG	2	6	416311	416316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416685
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5391	NC_004842	CAT	2	6	416427	416432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416685
5392	NC_004842	CGA	2	6	416490	416495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416685
5393	NC_004842	TCG	2	6	416528	416533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416685
5394	NC_004842	AAG	2	6	416669	416674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416685
5395	NC_004842	GCA	2	6	416862	416867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416685
5396	NC_004842	ACT	2	6	416920	416925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416685
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5398	NC_004842	ACC	2	6	417247	417252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416686
5399	NC_004842	AAC	2	6	417469	417474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416686
5400	NC_004842	ACT	2	6	417677	417682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416686
5401	NC_004842	TTA	2	6	417718	417723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5402	NC_004842	TGG	2	6	417904	417909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5403	NC_004842	CTG	2	6	417923	417928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5404	NC_004842	CGT	2	6	417956	417961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416687
5405	NC_004842	GTG	2	6	417967	417972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416687
5406	NC_004842	CTG	2	6	418022	418027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416687
5407	NC_004842	CAT	2	6	418249	418254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416687
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5421	NC_004842	ATT	2	6	419297	419302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416687
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5453	NC_004842	CAA	2	6	421390	421395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5454	NC_004842	CGG	2	6	421539	421544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5455	NC_004842	GCA	2	6	421725	421730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5487	NC_004842	GCA	2	6	424028	424033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416688
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