Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Lotus japonicus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_016743(CTAG)3p45970598112Design Primer
2NC_016743(GAA)5p3190271904115Design Primer
3NC_016743(A)11p1194741948411Design Primer
4NC_016743(TCTA)3p4216512166212Design Primer
5NC_016743(GACC)3p4253412535212Design Primer
6NC_016743(T)10p1288582886710Design Primer
7NC_016743(TTTTC)3p5339993401315Design Primer
8NC_016743(AT)6p2365173652812Design Primer
9NC_016743(A)10p1375593756810Design Primer
10NC_016743(TTCT)3p4381893820012Design Primer
11NC_016743(A)11p1384493845911Design Primer
12NC_016743(T)10p1423754238410Design Primer
13NC_016743(T)10p1430694307810Design Primer
14NC_016743(T)11p1491614917111Design Primer
15NC_016743(AATA)3p4502005021112Design Primer
16NC_016743(AATG)3p4547545476512Design Primer
17NC_016743(AAGA)3p4579085791912Design Primer
18NC_016743(AAGG)3p4587575876812Design Primer
19NC_016743(A)10p1620626207110Design Primer
20NC_016743(TCCC)3p4636326364312Design Primer
21NC_016743(A)10p1663036631210Design Primer
22NC_016743(A)11p1737407375011Design Primer
23NC_016743(AT)6p2755687557912Design Primer
24NC_016743(T)11p1760517606111Design Primer
25NC_016743(TGAA)3p4815838159412Design Primer
26NC_016743(GTCC)3p4823008231112Design Primer
27NC_016743(T)10p1946699467810Design Primer
28NC_016743(A)10p110178810179710Design Primer
29NC_016743(TGAA)3p410432510433612Design Primer
30NC_016743(A)12p110827010828112Design Primer
31NC_016743(GTT)4p311608611609712Design Primer
32NC_016743(CTGC)3p411722811723912Design Primer
33NC_016743(T)10p111841211842110Design Primer
34NC_016743(TTAT)3p412125312126412Design Primer
35NC_016743(TTTGAT)3p612191712193418Design Primer
36NC_016743(T)12p112981512982612Design Primer
37NC_016743(AAC)4p313480213481312Design Primer
38NC_016743(T)11p113672213673211Design Primer
39NC_016743(A)13p113887013888213Design Primer
40NC_016743(T)12p113909913911012Design Primer
41NC_016743(T)11p113958613959611Design Primer
42NC_016743(A)10p114436614437510Design Primer
43NC_016743(TATC)3(GATA)3c14602614604924Design Primer
44NC_016743(TCTT)3caatcgttccgatcaggacaagtg(GGTT)3c14618814623548Design Primer
45NC_016743(CTT)4p314779414780512Design Primer
46NC_016743(T)13cttcctatcgccctttcttaaatatgaaatagaaatgggcatcttcttattcttcagcctgaaaggctcttccctgccgggatccccttc(A)11c149981150094114Design Primer
47NC_016743(A)10p115790315791210Design Primer
48NC_016743(T)10p116225916226810Design Primer
49NC_016743(A)11p116421316422311Design Primer
50NC_016743(TCAG)3p417403717404812Design Primer
51NC_016743(CTTT)3p417946617947712Design Primer
52NC_016743(TCAA)3p418454218455312Design Primer
53NC_016743(A)11p118654318655311Design Primer
54NC_016743(TGAG)3p419228619229712Design Primer
55NC_016743(A)10p119250119251010Design Primer
56NC_016743(AGAA)3p419967319968412Design Primer
57NC_016743(AAGA)3p420517020518112Design Primer
58NC_016743(A)11p121216321217311Design Primer
59NC_016743(T)11p121600121601111Design Primer
60NC_016743(T)10p122042322043210Design Primer
61NC_016743(GTCC)3p422514522515612Design Primer
62NC_016743(TAC)4catacgtcattttcccattggctacattccgatcactaaggagaccaggggagggacttaaggcttgtc(T)10c22860322869391Design Primer
63NC_016743(CAAA)3p423009123010212Design Primer
64NC_016743(T)11p123071723072711Design Primer
65NC_016743(TTC)4p323693023694112Design Primer
66NC_016743(T)13p124207824209013Design Primer
67NC_016743(A)11p124272024273011Design Primer
68NC_016743(A)10p125280325281210Design Primer
69NC_016743(GGCA)3p425398425399512Design Primer
70NC_016743(A)15p125594425595815Design Primer
71NC_016743(CTTT)3p426065626066712Design Primer
72NC_016743(GGTT)3p426318026319112Design Primer
73NC_016743(AACT)3p427030627031712Design Primer
74NC_016743(AGCA)3p427109127110212Design Primer
75NC_016743(T)10act(TA)6c27251827254225Design Primer
76NC_016743(AT)6p227476227477312Design Primer
77NC_016743(T)11p127524527525511Design Primer
78NC_016743(TGAA)3p428077728078812Design Primer
79NC_016743(GTCC)3p428149428150512Design Primer
80NC_016743(A)10p129263929264810Design Primer
81NC_016743(GAAA)3p429533729534812Design Primer
82NC_016743(CCAT)3p431642731643812Design Primer
83NC_016743(AGT)4p332223232224312Design Primer
84NC_016743(TTAT)3p432341332342412Design Primer
85NC_016743(T)10p133393333394210Design Primer
86NC_016743(AAGT)3p433703133704212Design Primer
87NC_016743(T)10agaaaagaaaaagagtagttctttcgactcggtcatct(A)11c34396234402059Design Primer
88NC_016743(AGAA)3p434559934561012Design Primer
89NC_016743(TATT)3p435047435048512Design Primer
90NC_016743(T)12p135875035876112Design Primer
91NC_016743(T)10p136544536545410Design Primer
92NC_016743(T)11p136623436624411Design Primer
93NC_016743(C)11p136669836670811Design Primer
94NC_016743(A)10p136748536749410Design Primer
95NC_016743(A)10p137961437962310Design Primer