Compound Compound Repeats of Ichthyophthirius multifiliis mitochondrion
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| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_015981 | (AT)8(A)10 | c | 5028 | 5053 | 26 | Design Primer |
| 2 | NC_015981 | (T)11a(T)10 | c | 5713 | 5734 | 22 | Design Primer |
| 3 | NC_015981 | (AT)7aatctaatataaaataattaaaattattaaatagtaaattatcatagtgtaaaaataaataattatcaatttcactat(A)12 | c | 9037 | 9140 | 104 | Design Primer |
| 4 | NC_015981 | (T)15acacggaatcaatataaagatattaactaaatatacatttgacttgatataatactat(TA)7 | c | 10352 | 10438 | 87 | Design Primer |
| 5 | NC_015981 | (AT)8a(AAAAT)3 | c | 12261 | 12292 | 32 | Design Primer |
| 6 | NC_015981 | (AAAT)3ataaatataatattattttaattataaaatttatataattataaaaaaaaacatctttatagaataaatataatattaagtagataaaaaataatttt(A)13tatcctttatag(TA)8 | c | 14565 | 14715 | 151 | Design Primer |
| 7 | NC_015981 | (T)10aacttttagattatctcatgaattttttttatttaaattaattataattaattt(A)11 | c | 16816 | 16890 | 75 | Design Primer |
| 8 | NC_015981 | (A)12tattaatatgatataatttgataattttataacataaaatattaaaatattaaagttttcacttattaaaaaaatattattaa(ATATT)3 | c | 18208 | 18317 | 110 | Design Primer |
| 9 | NC_015981 | (AT)6aattataataaaatacattatcataaaaatacatttatcagtaaatacacctaaactaataattattttaaaaatatttata(AAT)4 | c | 18673 | 18778 | 106 | Design Primer |
| 10 | NC_015981 | (TA)7ttgtaaga(T)12aaaatttaattcttctttaatattatatttttttcatttttttatattattattaattaattcagacaaatctattttatacaataa(ATT)4 | c | 25795 | 25927 | 133 | Design Primer |
| 11 | NC_015981 | (AT)10(TA)6 | c | 26735 | 26766 | 32 | Design Primer |
| 12 | NC_015981 | (T)10ataatttat(TA)6(T)10 | c | 27099 | 27139 | 41 | Design Primer |
| 13 | NC_015981 | (TA)6acgatttacaaatataatataaaatattatttaaagatttaaaaaaatcttttaaat(TAA)4ttaatatataatttctaatataatttaaaataaataaaaaaataaaaaaaaatattaaataattt(A)12tttaataataaaaaaaaatttaacaatat(A)10taatattttataat(ATAA)3atttaaacaatttaaatttttataaattaatattaatatatcaattatttt(TAATA)3 | c | 27399 | 27687 | 289 | Design Primer |
| 14 | NC_015981 | (ATTT)3aaaatttttaatataaataaaatattttataataaaaattt(ATTA)3 | c | 29843 | 29907 | 65 | Design Primer |
| 15 | NC_015981 | (T)13aagaggaacaaattttataattaataatatttattttattcaagttaaatcttatatttttaataaa(T)11 | c | 38955 | 39045 | 91 | Design Primer |
| 16 | NC_015981 | (TA)8ctatttaaatttttttactttactgaaactttattgttaca(ATT)4 | c | 41900 | 41968 | 69 | Design Primer |
| 17 | NC_015981 | (T)12atttatattatctaa(T)13 | c | 44759 | 44798 | 40 | Design Primer |