MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187150	AGGT	2	8	351	358	25 %	25 %	50 %	0 %	399912628
2	NT_187150	TCGA	2	8	766	773	25 %	25 %	25 %	25 %	399912628
3	NT_187150	GGCA	2	8	795	802	25 %	0 %	50 %	25 %	399912628
4	NT_187150	GATG	2	8	925	932	25 %	25 %	50 %	0 %	399912628
5	NT_187150	TCCG	2	8	2040	2047	0 %	25 %	25 %	50 %	399912628
6	NT_187150	GATC	2	8	2149	2156	25 %	25 %	25 %	25 %	399912628
7	NT_187150	ATGC	2	8	2475	2482	25 %	25 %	25 %	25 %	399912628
8	NT_187150	TACC	2	8	2689	2696	25 %	25 %	0 %	50 %	399912628
9	NT_187150	GCCT	2	8	3722	3729	0 %	25 %	25 %	50 %	399912629
10	NT_187150	CCGT	2	8	4160	4167	0 %	25 %	25 %	50 %	399912629
11	NT_187150	GGTG	2	8	4399	4406	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187150	GATA	2	8	4971	4978	50 %	25 %	25 %	0 %	399912631
13	NT_187150	ATTT	2	8	5647	5654	25 %	75 %	0 %	0 %	399912631
14	NT_187150	GGCA	2	8	5859	5866	25 %	0 %	50 %	25 %	399912631
15	NT_187150	GTCA	2	8	6093	6100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NT_187150	CGCT	2	8	6778	6785	0 %	25 %	25 %	50 %	399912632
17	NT_187150	TGGA	2	8	8075	8082	25 %	25 %	50 %	0 %	399912633
18	NT_187150	CGTC	2	8	8296	8303	0 %	25 %	25 %	50 %	399912633
19	NT_187150	ATGT	2	8	8808	8815	25 %	50 %	25 %	0 %	399912634
20	NT_187150	TCCC	2	8	8847	8854	0 %	25 %	0 %	75 %	399912634
21	NT_187150	AAAC	2	8	8888	8895	75 %	0 %	0 %	25 %	399912634
22	NT_187150	GCAG	2	8	9488	9495	25 %	0 %	50 %	25 %	399912634
23	NT_187150	CATT	2	8	9557	9564	25 %	50 %	0 %	25 %	399912634
24	NT_187150	CGCA	2	8	9766	9773	25 %	0 %	25 %	50 %	399912634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.