MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187149	GACGGC	2	12	7603	7614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	399995576
2	NT_187149	CCAGAG	2	12	7868	7879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
3	NT_187149	TCCGCG	2	12	11014	11025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	399995580
4	NT_187149	CAAGCT	2	12	11513	11524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399995580
5	NT_187149	AACGGC	2	12	16399	16410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995586
6	NT_187149	GCAGCC	2	12	20103	20114	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995590
7	NT_187149	ACCATC	2	12	25725	25736	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NT_187149	TGGCAA	2	12	26665	26676	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995599
9	NT_187149	CCGCTG	2	12	28514	28525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	399995602
10	NT_187149	ACGATG	2	12	28854	28865	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995602
11	NT_187149	CCTTGC	2	12	30374	30385	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	399995605
12	NT_187149	TTGGCG	2	12	30993	31004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	399995606
13	NT_187149	CCAAGC	2	12	31515	31526	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	399995606
14	NT_187149	CGATCT	2	12	33297	33308	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995609
15	NT_187149	GCCACG	2	12	38593	38604	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995615
16	NT_187149	ACAAAT	2	12	39341	39352	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NT_187149	GAGTAC	2	12	40574	40585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995616
18	NT_187149	CACGCG	2	12	42781	42792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995618
19	NT_187149	TTCGTC	2	12	45223	45234	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	399995620
20	NT_187149	GATCGG	2	12	46769	46780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	399995623
21	NT_187149	GTTCCG	2	12	46850	46861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.