MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187149	CAAG	2	8	1297	1304	50 %	0 %	25 %	25 %	399995568
2	NT_187149	CGGA	2	8	1528	1535	25 %	0 %	50 %	25 %	399995568
3	NT_187149	ACCG	2	8	1617	1624	25 %	0 %	25 %	50 %	399995568
4	NT_187149	CGAT	2	8	2291	2298	25 %	25 %	25 %	25 %	399995570
5	NT_187149	CGTC	2	8	2702	2709	0 %	25 %	25 %	50 %	399995570
6	NT_187149	CGAT	2	8	3000	3007	25 %	25 %	25 %	25 %	399995570
7	NT_187149	CAAT	2	8	3292	3299	50 %	25 %	0 %	25 %	399995570
8	NT_187149	CGAC	2	8	3882	3889	25 %	0 %	25 %	50 %	399995570
9	NT_187149	TCGC	2	8	4240	4247	0 %	25 %	25 %	50 %	399995571
10	NT_187149	GCAG	2	8	4296	4303	25 %	0 %	50 %	25 %	399995571
11	NT_187149	GGCA	2	8	4875	4882	25 %	0 %	50 %	25 %	399995572
12	NT_187149	ATTG	2	8	5196	5203	25 %	50 %	25 %	0 %	399995573
13	NT_187149	CCCG	2	8	5280	5287	0 %	0 %	25 %	75 %	399995573
14	NT_187149	GCCG	2	8	5474	5481	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
15	NT_187149	ATCA	2	8	7292	7299	50 %	25 %	0 %	25 %	399995575
16	NT_187149	AGGA	2	8	7365	7372	50 %	0 %	50 %	0 %	399995575
17	NT_187149	GAAG	2	8	7720	7727	50 %	0 %	50 %	0 %	399995576
18	NT_187149	GCTC	2	8	7767	7774	0 %	25 %	25 %	50 %	399995576
19	NT_187149	CGCC	2	8	7882	7889	0 %	0 %	25 %	75 %	399995577
20	NT_187149	GCGG	2	8	9513	9520	0 %	0 %	75 %	25 %	399995579
21	NT_187149	CGGC	2	8	10131	10138	0 %	0 %	50 %	50 %	399995580
22	NT_187149	CGGC	2	8	10289	10296	0 %	0 %	50 %	50 %	399995580
23	NT_187149	CTCG	2	8	11030	11037	0 %	25 %	25 %	50 %	399995580
24	NT_187149	TTGC	2	8	13512	13519	0 %	50 %	25 %	25 %	399995583
25	NT_187149	CTTC	2	8	14315	14322	0 %	50 %	0 %	50 %	399995584
26	NT_187149	AAGG	2	8	14323	14330	50 %	0 %	50 %	0 %	399995584
27	NT_187149	ACCT	2	8	15307	15314	25 %	25 %	0 %	50 %	399995585
28	NT_187149	TCGA	2	8	15726	15733	25 %	25 %	25 %	25 %	399995586
29	NT_187149	CTCA	2	8	16072	16079	25 %	25 %	0 %	50 %	399995586
30	NT_187149	CGAA	2	8	16159	16166	50 %	0 %	25 %	25 %	399995586
31	NT_187149	GCCT	2	8	17499	17506	0 %	25 %	25 %	50 %	399995587
32	NT_187149	CGGC	2	8	18053	18060	0 %	0 %	50 %	50 %	399995588
33	NT_187149	TGAT	2	8	18103	18110	25 %	50 %	25 %	0 %	399995588
34	NT_187149	TGCT	2	8	18459	18466	0 %	50 %	25 %	25 %	399995588
35	NT_187149	GATT	2	8	21349	21356	25 %	50 %	25 %	0 %	399995591
36	NT_187149	CGAC	2	8	21531	21538	25 %	0 %	25 %	50 %	399995591
37	NT_187149	GCAC	2	8	21597	21604	25 %	0 %	25 %	50 %	399995591
38	NT_187149	CTGC	2	8	21733	21740	0 %	25 %	25 %	50 %	399995591
39	NT_187149	AAGG	2	8	21836	21843	50 %	0 %	50 %	0 %	399995591
40	NT_187149	GGCG	2	8	23203	23210	0 %	0 %	75 %	25 %	399995591
41	NT_187149	CGCC	2	8	23374	23381	0 %	0 %	25 %	75 %	399995591
42	NT_187149	AGTG	2	8	23430	23437	25 %	25 %	50 %	0 %	399995591
43	NT_187149	ATCG	2	8	24689	24696	25 %	25 %	25 %	25 %	399995593
44	NT_187149	ACGA	2	8	24961	24968	50 %	0 %	25 %	25 %	399995594
45	NT_187149	CGTC	2	8	25010	25017	0 %	25 %	25 %	50 %	399995594
46	NT_187149	GAAA	2	8	25197	25204	75 %	0 %	25 %	0 %	399995594
47	NT_187149	GGCG	2	8	26060	26067	0 %	0 %	75 %	25 %	399995597
48	NT_187149	GAGC	2	8	27328	27335	25 %	0 %	50 %	25 %	399995600
49	NT_187149	CGGA	2	8	27677	27684	25 %	0 %	50 %	25 %	399995601
50	NT_187149	GGCG	2	8	28667	28674	0 %	0 %	75 %	25 %	399995602
51	NT_187149	TCGA	2	8	29090	29097	25 %	25 %	25 %	25 %	399995603
52	NT_187149	GATG	2	8	30529	30536	25 %	25 %	50 %	0 %	399995605
53	NT_187149	ACAT	2	8	31551	31558	50 %	25 %	0 %	25 %	399995606
54	NT_187149	TCCT	2	8	32021	32028	0 %	50 %	0 %	50 %	399995606
55	NT_187149	AACG	2	8	32079	32086	50 %	0 %	25 %	25 %	399995606
56	NT_187149	GCTG	2	8	32891	32898	0 %	25 %	50 %	25 %	399995608
57	NT_187149	ACCG	2	8	33012	33019	25 %	0 %	25 %	50 %	399995608
58	NT_187149	CAGC	2	8	34017	34024	25 %	0 %	25 %	50 %	399995609
59	NT_187149	CGAC	2	8	34578	34585	25 %	0 %	25 %	50 %	399995609
60	NT_187149	GCGT	2	8	34647	34654	0 %	25 %	50 %	25 %	399995609
61	NT_187149	TGCT	2	8	35162	35169	0 %	50 %	25 %	25 %	399995609
62	NT_187149	CTCG	2	8	35181	35188	0 %	25 %	25 %	50 %	399995609
63	NT_187149	GGCA	2	8	36097	36104	25 %	0 %	50 %	25 %	399995610
64	NT_187149	ACAT	2	8	37277	37284	50 %	25 %	0 %	25 %	399995613
65	NT_187149	ATTC	2	8	37503	37510	25 %	50 %	0 %	25 %	399995613
66	NT_187149	GCTT	2	8	37688	37695	0 %	50 %	25 %	25 %	399995614
67	NT_187149	TCGG	2	8	37835	37842	0 %	25 %	50 %	25 %	399995614
68	NT_187149	AAGG	2	8	38793	38800	50 %	0 %	50 %	0 %	399995615
69	NT_187149	GCAG	2	8	38905	38912	25 %	0 %	50 %	25 %	399995615
70	NT_187149	GTCG	2	8	40272	40279	0 %	25 %	50 %	25 %	399995616
71	NT_187149	CGAT	2	8	40499	40506	25 %	25 %	25 %	25 %	399995616
72	NT_187149	ATCC	2	8	40766	40773	25 %	25 %	0 %	50 %	399995616
73	NT_187149	CGCA	2	8	41259	41266	25 %	0 %	25 %	50 %	399995617
74	NT_187149	GCTC	2	8	41316	41323	0 %	25 %	25 %	50 %	399995617
75	NT_187149	GTTC	2	8	41400	41407	0 %	50 %	25 %	25 %	399995617
76	NT_187149	TCCT	2	8	41914	41921	0 %	50 %	0 %	50 %	399995617
77	NT_187149	GGAA	2	8	42177	42184	50 %	0 %	50 %	0 %	399995617
78	NT_187149	TCGA	2	8	42738	42745	25 %	25 %	25 %	25 %	399995618
79	NT_187149	GCCG	2	8	44363	44370	0 %	0 %	50 %	50 %	399995619
80	NT_187149	TTCG	2	8	44548	44555	0 %	50 %	25 %	25 %	399995619
81	NT_187149	CGGA	2	8	46681	46688	25 %	0 %	50 %	25 %	399995623
82	NT_187149	CGGC	2	8	46824	46831	0 %	0 %	50 %	50 %	399995623
83	NT_187149	CCGC	2	8	46889	46896	0 %	0 %	25 %	75 %	399995623
84	NT_187149	CCGG	2	8	47069	47076	0 %	0 %	50 %	50 %	399995623
85	NT_187149	GCCG	2	8	47105	47112	0 %	0 %	50 %	50 %	399995623
86	NT_187149	ATCG	2	8	47226	47233	25 %	25 %	25 %	25 %	399995623
87	NT_187149	AGCG	2	8	47242	47249	25 %	0 %	50 %	25 %	399995623

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.