MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187148	GGGTT	2	10	4037	4046	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187148	TCCGG	2	10	38434	38443	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NT_187148	CCGCT	2	10	49980	49989	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NT_187148	TGAGA	2	10	50637	50646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187148	CGTCC	2	10	85675	85684	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NT_187148	GGGCT	2	10	102934	102943	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NT_187148	CCGCG	2	10	143260	143269	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NT_187148	ATCGG	2	10	179330	179339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NT_187148	TGCAA	2	10	184553	184562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NT_187148	CCACC	2	10	197965	197974	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NT_187148	CCCAT	2	10	199348	199357	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NT_187148	ATCCG	2	10	199460	199469	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NT_187148	CGTCC	2	10	203401	203410	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NT_187148	CTCAC	2	10	203481	203490	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NT_187148	TTCGC	2	10	213635	213644	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NT_187148	TGTCC	2	10	224984	224993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NT_187148	AGCGA	2	10	225298	225307	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NT_187148	TCACC	2	10	231664	231673	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NT_187148	CCGAC	2	10	243907	243916	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
20	NT_187148	GCGCA	2	10	246197	246206	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NT_187148	CCGAC	2	10	248024	248033	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.