MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 3753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187148	GAT	2	6	138	143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995315
2	NT_187148	TCA	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995315
3	NT_187148	AGC	2	6	188	193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995315
4	NT_187148	AAG	2	6	229	234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995315
5	NT_187148	TCA	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995315
6	NT_187148	ATG	2	6	301	306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995315
7	NT_187148	TGC	2	6	336	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
8	NT_187148	CGG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995316
9	NT_187148	TCT	2	6	432	437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995316
10	NT_187148	CCA	2	6	450	455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995316
11	NT_187148	TGC	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
12	NT_187148	TGC	2	6	532	537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
13	NT_187148	CGG	2	6	548	553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995316
14	NT_187148	TCC	2	6	606	611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995316
15	NT_187148	GCC	2	6	634	639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995316
16	NT_187148	AGC	2	6	716	721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995316
17	NT_187148	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995316
18	NT_187148	GAT	2	6	796	801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995316
19	NT_187148	TCG	2	6	900	905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995316
20	NT_187148	ATG	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995316
21	NT_187148	CAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995316
22	NT_187148	GCA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
23	NT_187148	TGT	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
24	NT_187148	CGT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995317
25	NT_187148	ATC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
26	NT_187148	GGC	2	6	1105	1110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
27	NT_187148	CAC	2	6	1119	1124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995317
28	NT_187148	CGG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
29	NT_187148	TTG	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
30	NT_187148	GAC	2	6	1341	1346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
31	NT_187148	TGG	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995317
32	NT_187148	GAA	2	6	1513	1518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995317
33	NT_187148	GCC	2	6	1597	1602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
34	NT_187148	GCC	2	6	1662	1667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
35	NT_187148	TAG	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995317
36	NT_187148	GGC	2	6	1697	1702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
37	NT_187148	CGG	2	6	1812	1817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995317
38	NT_187148	ATC	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
39	NT_187148	CAG	2	6	1987	1992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
40	NT_187148	TCT	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995317
41	NT_187148	GCA	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
42	NT_187148	TTG	2	6	2184	2189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995317
43	NT_187148	GAC	2	6	2200	2205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
44	NT_187148	GCC	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995317
45	NT_187148	AAG	2	6	2359	2364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995317
46	NT_187148	GCA	2	6	2477	2482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995317
47	NT_187148	ATC	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995317
48	NT_187148	GTC	2	6	2545	2550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995317
49	NT_187148	CAG	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995318
50	NT_187148	CAC	2	6	2710	2715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995318
51	NT_187148	CTT	2	6	2761	2766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995318
52	NT_187148	CGT	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995318
53	NT_187148	GCC	2	6	2815	2820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995318
54	NT_187148	CGC	2	6	2949	2954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995318
55	NT_187148	ATC	2	6	2966	2971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995318
56	NT_187148	CTT	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995319
57	NT_187148	GTG	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995319
58	NT_187148	GTC	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995319
59	NT_187148	CGC	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995319
60	NT_187148	GAC	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995319
61	NT_187148	AAC	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995319
62	NT_187148	CGC	3	9	3270	3278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995319
63	NT_187148	TGC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995319
64	NT_187148	ACT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995319
65	NT_187148	ACC	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995319
66	NT_187148	GAA	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995320
67	NT_187148	AAG	2	6	3592	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995320
68	NT_187148	CTT	2	6	3600	3605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995320
69	NT_187148	GCT	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995320
70	NT_187148	CCA	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995320
71	NT_187148	ACG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995320
72	NT_187148	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995320
73	NT_187148	GGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187148	GGA	2	6	3982	3987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187148	CCG	2	6	4056	4061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NT_187148	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187148	GAT	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187148	CGG	2	6	4150	4155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187148	TGA	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187148	ATC	2	6	4172	4177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187148	TGC	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
82	NT_187148	AGC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995321
83	NT_187148	GCC	2	6	4299	4304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995321
84	NT_187148	CTC	2	6	4371	4376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995321
85	NT_187148	GAA	2	6	4400	4405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995321
86	NT_187148	CTG	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
87	NT_187148	AAG	2	6	4456	4461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995321
88	NT_187148	TGG	2	6	4492	4497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995321
89	NT_187148	TTC	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995321
90	NT_187148	GCC	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995321
91	NT_187148	GAG	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995321
92	NT_187148	TCG	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
93	NT_187148	CGG	2	6	4849	4854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995321
94	NT_187148	GTC	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
95	NT_187148	TCG	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995321
96	NT_187148	GAT	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995321
97	NT_187148	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995322
98	NT_187148	GTC	2	6	5466	5471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995322
99	NT_187148	CAT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995322
100	NT_187148	ACC	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995322
101	NT_187148	GCT	2	6	5634	5639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187148	CCT	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NT_187148	TCG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995323
104	NT_187148	CGA	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995323
105	NT_187148	CGA	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995323
106	NT_187148	CCG	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995323
107	NT_187148	ATG	2	6	6008	6013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995323
108	NT_187148	GCG	2	6	6014	6019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995323
109	NT_187148	GCG	2	6	6081	6086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995323
110	NT_187148	GAC	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995323
111	NT_187148	GAA	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187148	TCG	2	6	6200	6205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187148	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995324
114	NT_187148	CGA	2	6	6513	6518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995324
115	NT_187148	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995324
116	NT_187148	GCG	2	6	6722	6727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995324
117	NT_187148	GAC	2	6	6883	6888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995324
118	NT_187148	CGC	2	6	6946	6951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995324
119	NT_187148	CAT	2	6	6955	6960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995324
120	NT_187148	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995324
121	NT_187148	ACG	2	6	7288	7293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995324
122	NT_187148	GAA	2	6	7396	7401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995324
123	NT_187148	CGC	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995324
124	NT_187148	CCT	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995324
125	NT_187148	CTT	2	6	7662	7667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995325
126	NT_187148	GCC	2	6	7720	7725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995325
127	NT_187148	GAC	2	6	7749	7754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995325
128	NT_187148	CGC	2	6	7763	7768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995325
129	NT_187148	GAT	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995325
130	NT_187148	GCC	2	6	7911	7916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995325
131	NT_187148	CGG	2	6	7918	7923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995325
132	NT_187148	GTC	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995325
133	NT_187148	CCG	2	6	8123	8128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995325
134	NT_187148	TCT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995325
135	NT_187148	GGC	2	6	8292	8297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995325
136	NT_187148	GGC	2	6	8304	8309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995325
137	NT_187148	CGG	2	6	8336	8341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995325
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139	NT_187148	TCT	2	6	8381	8386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995325
140	NT_187148	TCA	2	6	8405	8410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995325
141	NT_187148	GTC	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995325
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143	NT_187148	CGC	2	6	8494	8499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995326
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145	NT_187148	CCT	2	6	8699	8704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995326
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151	NT_187148	TGC	2	6	9216	9221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NT_187148	GAG	2	6	9353	9358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995327
153	NT_187148	TCA	2	6	9486	9491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995327
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189	NT_187148	CAT	2	6	11529	11534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NT_187148	GCC	2	6	11645	11650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
193	NT_187148	CAG	2	6	11692	11697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
194	NT_187148	TGA	2	6	11815	11820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995331
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198	NT_187148	CTG	2	6	12131	12136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
199	NT_187148	CGA	2	6	12184	12189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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209	NT_187148	TCC	2	6	12849	12854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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230	NT_187148	CAT	2	6	14272	14277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
231	NT_187148	CTG	2	6	14324	14329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
232	NT_187148	GTC	2	6	14392	14397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
233	NT_187148	CCT	2	6	14481	14486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995335
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237	NT_187148	ACG	2	6	14677	14682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995335
238	NT_187148	ACG	2	6	14840	14845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
239	NT_187148	AGT	2	6	14956	14961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995336
240	NT_187148	GCG	3	9	14979	14987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995336
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242	NT_187148	GCC	2	6	15219	15224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995336
243	NT_187148	GAG	2	6	15386	15391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995336
244	NT_187148	GCG	2	6	15541	15546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995336
245	NT_187148	TTG	2	6	15580	15585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995336
246	NT_187148	AAG	2	6	15621	15626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NT_187148	CGT	2	6	15766	15771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995337
248	NT_187148	TGC	2	6	15820	15825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995337
249	NT_187148	GAG	2	6	15854	15859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995337
250	NT_187148	AGG	2	6	15861	15866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995337
251	NT_187148	GTC	2	6	15910	15915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995337
252	NT_187148	GGA	2	6	15970	15975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995337
253	NT_187148	CGC	2	6	15986	15991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995337
254	NT_187148	GCT	2	6	16005	16010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995337
255	NT_187148	CGA	2	6	16101	16106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995337
256	NT_187148	ATC	2	6	16406	16411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995337
257	NT_187148	CGG	3	9	16417	16425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995337
258	NT_187148	TGG	2	6	16429	16434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995337
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361	NT_187148	CTC	2	6	23040	23045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995344
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365	NT_187148	CGC	2	6	23522	23527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
366	NT_187148	GCC	2	6	23564	23569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
367	NT_187148	GTC	2	6	23664	23669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995345
368	NT_187148	AGC	3	9	23736	23744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995345
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370	NT_187148	AAT	2	6	23860	23865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995345
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374	NT_187148	TGA	2	6	24097	24102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995345
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499	NT_187148	GGC	2	6	33103	33108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995354
500	NT_187148	ATG	2	6	33144	33149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995354

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