MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187148	GC	3	6	4142	4147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187148	GC	3	6	5674	5679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187148	CG	3	6	12172	12177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187148	GA	3	6	12243	12248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187148	GA	3	6	12268	12273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187148	CA	3	6	12934	12939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187148	GC	3	6	14305	14310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NT_187148	GC	3	6	14776	14781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NT_187148	CG	3	6	22452	22457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NT_187148	CG	3	6	25524	25529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NT_187148	CG	3	6	35146	35151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NT_187148	CG	3	6	35242	35247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NT_187148	CG	3	6	35334	35339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NT_187148	TG	3	6	35359	35364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187148	GT	3	6	41231	41236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187148	CG	3	6	48256	48261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NT_187148	TG	3	6	49997	50002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187148	CG	3	6	50039	50044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NT_187148	TC	3	6	50154	50159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187148	GC	3	6	50630	50635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187148	GC	3	6	51553	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NT_187148	CG	3	6	54813	54818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NT_187148	GA	3	6	57562	57567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187148	GC	3	6	58865	58870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NT_187148	AC	3	6	73210	73215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NT_187148	AT	4	8	74132	74139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187148	TG	3	6	82237	82242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187148	CT	3	6	85564	85569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NT_187148	CT	3	6	91024	91029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NT_187148	CA	3	6	91224	91229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NT_187148	GC	3	6	91238	91243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NT_187148	CG	3	6	97757	97762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187148	CG	3	6	99820	99825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NT_187148	CG	4	8	102692	102699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NT_187148	GA	3	6	103024	103029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187148	AC	3	6	104337	104342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NT_187148	GC	3	6	104356	104361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NT_187148	GA	4	8	113732	113739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187148	GA	3	6	121388	121393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187148	GC	3	6	122891	122896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NT_187148	GC	3	6	128062	128067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NT_187148	GC	3	6	134004	134009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NT_187148	TC	4	8	134279	134286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NT_187148	GC	3	6	151310	151315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NT_187148	CT	3	6	155326	155331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NT_187148	CG	3	6	159064	159069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187148	AT	3	6	167332	167337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187148	CG	3	6	179255	179260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NT_187148	CG	3	6	184790	184795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NT_187148	GT	3	6	185442	185447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187148	CG	3	6	187396	187401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NT_187148	GC	3	6	192961	192966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187148	GA	3	6	195049	195054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187148	AG	3	6	197365	197370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187148	CT	3	6	197432	197437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NT_187148	AG	3	6	199909	199914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187148	CT	3	6	199924	199929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NT_187148	CG	3	6	200384	200389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NT_187148	GC	4	8	202324	202331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NT_187148	GA	3	6	203391	203396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187148	GA	3	6	204034	204039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187148	GC	3	6	209621	209626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NT_187148	GC	4	8	209670	209677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NT_187148	GC	3	6	211714	211719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187148	TC	3	6	212163	212168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NT_187148	CG	3	6	212232	212237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NT_187148	TC	3	6	213832	213837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NT_187148	CG	3	6	228307	228312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NT_187148	GA	3	6	229479	229484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187148	CG	3	6	229490	229495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187148	GC	3	6	229964	229969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NT_187148	GC	3	6	231556	231561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NT_187148	GC	3	6	232440	232445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NT_187148	GC	3	6	233507	233512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187148	GC	3	6	238683	238688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NT_187148	CG	3	6	241760	241765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NT_187148	GC	3	6	242234	242239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187148	GC	3	6	244234	244239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NT_187148	TG	3	6	247754	247759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.