MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187148	T	6	6	2649	2654	0 %	100 %	0 %	0 %	399995318
2	NT_187148	C	6	6	9208	9213	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NT_187148	C	7	7	9415	9421	0 %	0 %	0 %	100 %	399995327
4	NT_187148	C	6	6	10070	10075	0 %	0 %	0 %	100 %	399995329
5	NT_187148	C	6	6	11611	11616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6	NT_187148	A	6	6	13846	13851	100 %	0 %	0 %	0 %	399995334
7	NT_187148	C	6	6	15114	15119	0 %	0 %	0 %	100 %	399995336
8	NT_187148	G	6	6	31044	31049	0 %	0 %	100 %	0 %	399995353
9	NT_187148	C	6	6	38184	38189	0 %	0 %	0 %	100 %	399995358
10	NT_187148	C	7	7	39587	39593	0 %	0 %	0 %	100 %	399995361
11	NT_187148	A	6	6	41279	41284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187148	T	6	6	42799	42804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187148	T	6	6	51123	51128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187148	T	6	6	54009	54014	0 %	100 %	0 %	0 %	399995382
15	NT_187148	C	6	6	58291	58296	0 %	0 %	0 %	100 %	399995387
16	NT_187148	G	6	6	59093	59098	0 %	0 %	100 %	0 %	399995389
17	NT_187148	C	6	6	59134	59139	0 %	0 %	0 %	100 %	399995389
18	NT_187148	T	6	6	60549	60554	0 %	100 %	0 %	0 %	399995391
19	NT_187148	G	6	6	66356	66361	0 %	0 %	100 %	0 %	399995391
20	NT_187148	C	6	6	66647	66652	0 %	0 %	0 %	100 %	399995391
21	NT_187148	A	6	6	68343	68348	100 %	0 %	0 %	0 %	399995391
22	NT_187148	G	6	6	68809	68814	0 %	0 %	100 %	0 %	399995391
23	NT_187148	T	6	6	73470	73475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187148	C	6	6	81510	81515	0 %	0 %	0 %	100 %	399995408
25	NT_187148	G	6	6	91267	91272	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187148	C	6	6	104331	104336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NT_187148	A	6	6	113546	113551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187148	C	6	6	122569	122574	0 %	0 %	0 %	100 %	399995440
29	NT_187148	C	6	6	130067	130072	0 %	0 %	0 %	100 %	399995450
30	NT_187148	C	6	6	133772	133777	0 %	0 %	0 %	100 %	399995452
31	NT_187148	C	6	6	137705	137710	0 %	0 %	0 %	100 %	399995456
32	NT_187148	C	6	6	148042	148047	0 %	0 %	0 %	100 %	399995469
33	NT_187148	A	6	6	153028	153033	100 %	0 %	0 %	0 %	399995476
34	NT_187148	T	7	7	154245	154251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187148	A	6	6	168687	168692	100 %	0 %	0 %	0 %	399995489
36	NT_187148	C	6	6	175449	175454	0 %	0 %	0 %	100 %	399995492
37	NT_187148	A	6	6	177694	177699	100 %	0 %	0 %	0 %	399995492
38	NT_187148	T	6	6	184650	184655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187148	A	6	6	187323	187328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187148	T	6	6	194198	194203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187148	A	7	7	194377	194383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187148	A	6	6	202255	202260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187148	T	6	6	203164	203169	0 %	100 %	0 %	0 %	399995518
44	NT_187148	G	6	6	209149	209154	0 %	0 %	100 %	0 %	399995521
45	NT_187148	G	6	6	213104	213109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187148	G	6	6	218337	218342	0 %	0 %	100 %	0 %	399995534
47	NT_187148	C	6	6	220641	220646	0 %	0 %	0 %	100 %	399995534
48	NT_187148	T	6	6	225350	225355	0 %	100 %	0 %	0 %	399995540
49	NT_187148	T	6	6	226034	226039	0 %	100 %	0 %	0 %	399995540
50	NT_187148	A	6	6	245033	245038	100 %	0 %	0 %	0 %	399995563
51	NT_187148	G	7	7	245756	245762	0 %	0 %	100 %	0 %	399995563

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.