MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	CGTGG	2	10	5781	5790	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NT_187147	CGGAG	2	10	5919	5928	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NT_187147	ACCTT	2	10	7051	7060	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NT_187147	GACCG	2	10	13443	13452	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NT_187147	AAGGG	2	10	13468	13477	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187147	TTCTT	2	10	26435	26444	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NT_187147	CTCTT	2	10	31701	31710	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NT_187147	CGCAG	2	10	48028	48037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NT_187147	TCGGC	2	10	48486	48495	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NT_187147	AGCTG	2	10	48513	48522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NT_187147	AGGAG	2	10	49277	49286	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187147	CATGA	2	10	61958	61967	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NT_187147	GCGAG	2	10	72074	72083	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NT_187147	GCGAC	2	10	82267	82276	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NT_187147	GCGCC	2	10	85364	85373	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NT_187147	GCATT	2	10	105070	105079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NT_187147	GTGGC	2	10	110775	110784	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NT_187147	GAGCC	2	10	111224	111233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NT_187147	AATCC	2	10	117560	117569	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NT_187147	GCAGC	2	10	133865	133874	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NT_187147	TTGTG	2	10	140907	140916	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187147	GGCGT	2	10	140971	140980	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NT_187147	GATAT	2	10	144954	144963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187147	TGTTA	2	10	152432	152441	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187147	CCGCA	2	10	179626	179635	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NT_187147	CAATT	2	10	179646	179655	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NT_187147	GAAGA	2	10	193896	193905	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187147	CGGCT	2	10	211591	211600	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NT_187147	TCGGA	2	10	238388	238397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NT_187147	ATCGA	2	10	238842	238851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NT_187147	TAGCT	2	10	248021	248030	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NT_187147	AGCAT	2	10	255173	255182	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NT_187147	GCTGA	2	10	255225	255234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NT_187147	CGATG	2	10	272936	272945	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.