MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	TGC	3	9	51	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187147	CCG	2	6	194	199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187147	TTC	2	6	210	215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187147	TCG	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
5	NT_187147	CCA	2	6	239	244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995010
6	NT_187147	GCG	2	6	294	299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995010
7	NT_187147	GTC	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
8	NT_187147	GCC	2	6	462	467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
9	NT_187147	GAC	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
10	NT_187147	CGA	2	6	507	512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
11	NT_187147	GCC	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
12	NT_187147	GCA	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
13	NT_187147	GCC	2	6	673	678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
14	NT_187147	CCG	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
15	NT_187147	ATC	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995010
16	NT_187147	CAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995010
17	NT_187147	TGC	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187147	GGC	2	6	931	936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
19	NT_187147	GGC	2	6	1072	1077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
20	NT_187147	AAC	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995011
21	NT_187147	CTT	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995011
22	NT_187147	TCG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
23	NT_187147	CGG	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
24	NT_187147	CGA	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
25	NT_187147	GCG	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
26	NT_187147	GCC	2	6	1367	1372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995011
27	NT_187147	CGT	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
28	NT_187147	CGG	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
29	NT_187147	CCA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995011
30	NT_187147	GCG	2	6	1458	1463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
31	NT_187147	CAG	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
32	NT_187147	GAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
33	NT_187147	GCG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
34	NT_187147	TGA	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
35	NT_187147	CTG	2	6	1820	1825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187147	TCA	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995012
37	NT_187147	GCC	3	9	2173	2181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NT_187147	CGC	3	9	2214	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NT_187147	GGC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187147	CCG	2	6	2321	2326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
41	NT_187147	CAT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
42	NT_187147	GGC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
43	NT_187147	ATC	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
44	NT_187147	TCC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
45	NT_187147	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
46	NT_187147	GCG	2	6	2760	2765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
47	NT_187147	GCA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
48	NT_187147	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
49	NT_187147	TTG	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
50	NT_187147	TTC	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995013
51	NT_187147	TGA	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995013
52	NT_187147	TGC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
53	NT_187147	GTT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
54	NT_187147	CCA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
55	NT_187147	TCG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
56	NT_187147	ACG	3	9	3241	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
57	NT_187147	GCG	2	6	3265	3270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
58	NT_187147	CCT	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
59	NT_187147	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
60	NT_187147	CGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
61	NT_187147	CGG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
62	NT_187147	CGA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
63	NT_187147	GCC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
64	NT_187147	CAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
65	NT_187147	GTG	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
66	NT_187147	CGG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
67	NT_187147	ATC	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
68	NT_187147	GCC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
69	NT_187147	CAG	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
70	NT_187147	GGT	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
71	NT_187147	ACC	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
72	NT_187147	TTG	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
73	NT_187147	CAG	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
74	NT_187147	CTT	2	6	4012	4017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187147	CAG	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187147	CGC	3	9	4183	4191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NT_187147	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187147	CGT	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
79	NT_187147	CGT	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
80	NT_187147	CGC	2	6	4338	4343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995014
81	NT_187147	AGG	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995014
82	NT_187147	GTC	2	6	4575	4580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
83	NT_187147	CTG	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
84	NT_187147	TCA	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995015
85	NT_187147	CTG	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
86	NT_187147	TGC	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
87	NT_187147	TCG	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
88	NT_187147	CGC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995015
89	NT_187147	TGA	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
90	NT_187147	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
91	NT_187147	GGC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
92	NT_187147	GAC	2	6	4892	4897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995015
93	NT_187147	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995015
94	NT_187147	TGA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
95	NT_187147	CGG	3	9	4987	4995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
96	NT_187147	AAG	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995015
97	NT_187147	CTG	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
98	NT_187147	TCG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
99	NT_187147	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995016
100	NT_187147	GGC	2	6	5151	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
101	NT_187147	GGC	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
102	NT_187147	CGG	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
103	NT_187147	TCT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995016
104	NT_187147	GCA	3	9	5278	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
105	NT_187147	CGA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
106	NT_187147	CCA	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995016
107	NT_187147	TCG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
108	NT_187147	CGT	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
109	NT_187147	CTG	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
110	NT_187147	GCC	2	6	5741	5746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995016
111	NT_187147	ATC	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187147	GCT	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187147	ACG	3	9	5879	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187147	GCC	2	6	6151	6156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995017
115	NT_187147	TGC	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995017
116	NT_187147	ATC	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187147	GGC	2	6	6495	6500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187147	GAC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995018
119	NT_187147	TCA	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995018
120	NT_187147	CTT	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995018
121	NT_187147	AAT	2	6	6852	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995018
122	NT_187147	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995018
123	NT_187147	AGC	2	6	7099	7104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187147	CTG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187147	GAG	2	6	7594	7599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187147	GCC	2	6	7622	7627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NT_187147	ATG	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995020
128	NT_187147	GGC	2	6	7739	7744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995020
129	NT_187147	GGC	2	6	7912	7917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995020
130	NT_187147	GGT	2	6	7944	7949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995020
131	NT_187147	TTG	2	6	8008	8013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995020
132	NT_187147	CGC	2	6	8030	8035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995020
133	NT_187147	CGT	2	6	8084	8089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995020
134	NT_187147	TTC	2	6	8118	8123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995021
135	NT_187147	CCA	2	6	8150	8155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995021
136	NT_187147	TCA	2	6	8159	8164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995021
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138	NT_187147	GCC	2	6	8443	8448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995021
139	NT_187147	GAC	2	6	8550	8555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995021
140	NT_187147	CGT	2	6	8570	8575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995021
141	NT_187147	GAG	2	6	8580	8585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995021
142	NT_187147	GTC	2	6	8596	8601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995021
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147	NT_187147	GGC	2	6	8993	8998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995022
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158	NT_187147	GCT	2	6	9877	9882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995023
159	NT_187147	GAT	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995023
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162	NT_187147	GAT	2	6	10094	10099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995024
163	NT_187147	CCT	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995024
164	NT_187147	CTT	2	6	10405	10410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995024
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179	NT_187147	TTC	2	6	11351	11356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NT_187147	GGC	2	6	12058	12063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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235	NT_187147	TGA	2	6	15305	15310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995032
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239	NT_187147	CGG	2	6	15518	15523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995032
240	NT_187147	TCG	2	6	15568	15573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995032
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244	NT_187147	TGG	2	6	15836	15841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995032
245	NT_187147	CGA	2	6	15844	15849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995032
246	NT_187147	AGA	2	6	15864	15869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
247	NT_187147	CGG	2	6	15881	15886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
248	NT_187147	GCA	3	9	16021	16029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995033
249	NT_187147	ACA	2	6	16128	16133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995033
250	NT_187147	GCC	2	6	16150	16155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995033
251	NT_187147	ACG	2	6	16239	16244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995033
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253	NT_187147	TGC	2	6	16259	16264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995033
254	NT_187147	TCG	2	6	16281	16286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995033
255	NT_187147	TAT	2	6	16357	16362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NT_187147	TGA	2	6	16363	16368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
257	NT_187147	CAG	2	6	16533	16538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
258	NT_187147	CAG	2	6	16652	16657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
259	NT_187147	AGC	2	6	16715	16720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995034
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380	NT_187147	TCC	2	6	25717	25722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
381	NT_187147	AGC	2	6	25883	25888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995048
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500	NT_187147	GCG	2	6	35297	35302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995056

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