MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	TGC	3	9	51	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187147	CCG	2	6	194	199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187147	TTC	2	6	210	215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187147	TGC	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187147	CTG	2	6	1820	1825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187147	GCC	3	9	2173	2181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NT_187147	CGC	3	9	2214	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187147	GGC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187147	CTT	2	6	4012	4017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187147	CAG	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187147	CGC	3	9	4183	4191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NT_187147	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187147	ATC	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187147	GCT	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187147	ACG	3	9	5879	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187147	ATC	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187147	GGC	2	6	6495	6500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187147	AGC	2	6	7099	7104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187147	CTG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187147	GAG	2	6	7594	7599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187147	GCC	2	6	7622	7627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NT_187147	CGT	2	6	10833	10838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187147	GAG	2	6	10843	10848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187147	CCG	2	6	11335	11340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187147	TTC	2	6	11351	11356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187147	TGC	2	6	11955	11960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187147	CCA	2	6	12031	12036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NT_187147	GGC	2	6	12058	12063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187147	CAG	2	6	12091	12096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187147	ACC	2	6	12131	12136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NT_187147	CAC	2	6	12157	12162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NT_187147	TCG	2	6	12360	12365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187147	GAC	2	6	12381	12386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187147	GGC	2	6	13327	13332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187147	GCA	2	6	14235	14240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187147	GCA	2	6	15261	15266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187147	AGA	2	6	15864	15869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187147	CGG	2	6	15881	15886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NT_187147	TAT	2	6	16357	16362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187147	TGA	2	6	16363	16368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187147	TCA	2	6	18431	18436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187147	CAT	2	6	18553	18558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187147	ATT	2	6	18566	18571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187147	GCC	2	6	18616	18621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NT_187147	CGG	3	9	18658	18666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187147	GAC	2	6	20088	20093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187147	CGA	2	6	20176	20181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187147	CAG	2	6	21383	21388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187147	CCG	2	6	21423	21428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NT_187147	CGC	2	6	23136	23141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NT_187147	GCG	2	6	23358	23363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187147	CGC	2	6	23540	23545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NT_187147	CCG	2	6	24117	24122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NT_187147	CGC	2	6	24154	24159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NT_187147	GAA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187147	CGA	2	6	24242	24247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187147	GGA	2	6	24394	24399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187147	TCC	2	6	25717	25722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NT_187147	AGG	2	6	26451	26456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187147	CGG	2	6	26522	26527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187147	GCT	2	6	26530	26535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187147	GCT	2	6	26706	26711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187147	TGC	2	6	26728	26733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187147	CCT	2	6	27982	27987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NT_187147	CTG	2	6	30146	30151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187147	AGA	2	6	31868	31873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187147	GCG	2	6	31886	31891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187147	GCA	2	6	31905	31910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187147	ACG	2	6	33050	33055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187147	GCC	2	6	33071	33076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NT_187147	CGC	3	9	37868	37876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NT_187147	ACG	2	6	37934	37939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187147	CAC	2	6	38016	38021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NT_187147	GCC	2	6	38070	38075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NT_187147	TCA	2	6	38105	38110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187147	CGA	2	6	38118	38123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187147	TCG	2	6	38133	38138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187147	GCC	2	6	38152	38157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NT_187147	GCA	2	6	38165	38170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187147	CGG	2	6	38181	38186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187147	GGC	2	6	38190	38195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187147	CCG	2	6	38308	38313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NT_187147	GCC	2	6	38333	38338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NT_187147	CTC	2	6	38503	38508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NT_187147	CAG	2	6	38709	38714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187147	TGT	2	6	44721	44726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187147	GAA	2	6	44731	44736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187147	GAT	2	6	44760	44765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187147	CGC	2	6	44768	44773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NT_187147	AGG	2	6	44898	44903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187147	TGT	2	6	45048	45053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187147	GGT	2	6	45075	45080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187147	GTC	2	6	45192	45197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187147	GTG	2	6	46650	46655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187147	CGG	3	9	46934	46942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187147	CGC	2	6	47086	47091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NT_187147	ATC	2	6	47260	47265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187147	TTG	2	6	47396	47401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187147	CCA	2	6	47438	47443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NT_187147	GCA	2	6	47468	47473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187147	ACG	2	6	47877	47882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187147	GCA	2	6	47937	47942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187147	GCA	2	6	48078	48083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187147	CCA	2	6	48189	48194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NT_187147	AAT	2	6	48270	48275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187147	GCG	2	6	48405	48410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187147	CCG	2	6	48425	48430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NT_187147	TCC	2	6	48503	48508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NT_187147	CTG	2	6	48534	48539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187147	CGT	2	6	48565	48570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187147	TGC	2	6	48600	48605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187147	CGA	2	6	48644	48649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187147	CGC	2	6	48678	48683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NT_187147	CAG	2	6	49189	49194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187147	GCA	2	6	49309	49314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187147	TCC	3	9	49859	49867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NT_187147	AGG	2	6	49928	49933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187147	CGG	2	6	49952	49957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187147	CTG	2	6	49986	49991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187147	CGG	2	6	50028	50033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187147	CCG	2	6	50049	50054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NT_187147	CGG	2	6	50398	50403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187147	GCT	2	6	50412	50417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187147	CGA	2	6	50420	50425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187147	AGC	2	6	50450	50455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187147	TCG	2	6	50474	50479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187147	GAC	2	6	50537	50542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187147	ACG	2	6	50577	50582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187147	GAA	2	6	50627	50632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187147	TCG	2	6	51258	51263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187147	GAA	2	6	51383	51388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187147	CCT	2	6	51395	51400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NT_187147	CAG	2	6	52247	52252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187147	CAG	2	6	52539	52544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NT_187147	CCA	2	6	52571	52576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NT_187147	CCA	2	6	52581	52586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NT_187147	TCG	2	6	52614	52619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187147	GCA	2	6	52692	52697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187147	CCA	2	6	52758	52763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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