MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	CG	3	6	2129	2134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187147	TC	3	6	3950	3955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187147	TG	3	6	5814	5819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187147	GC	3	6	6544	6549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NT_187147	CT	3	6	7116	7121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NT_187147	TC	3	6	12310	12315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187147	CG	3	6	13292	13297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NT_187147	GC	3	6	23160	23165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NT_187147	CG	3	6	24497	24502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NT_187147	GT	3	6	30239	30244	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187147	CG	3	6	30297	30302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NT_187147	GC	3	6	32937	32942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NT_187147	AG	3	6	37180	37185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187147	CG	4	8	38755	38762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NT_187147	TG	3	6	38995	39000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187147	AT	3	6	48154	48159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187147	GC	3	6	51181	51186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NT_187147	GA	3	6	51340	51345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187147	CG	3	6	52362	52367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NT_187147	GC	3	6	52556	52561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NT_187147	CG	3	6	53324	53329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NT_187147	GA	3	6	56200	56205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187147	GA	3	6	56319	56324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187147	GC	3	6	56691	56696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NT_187147	CG	3	6	61230	61235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NT_187147	GC	3	6	71529	71534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NT_187147	CG	3	6	71853	71858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NT_187147	TC	3	6	82340	82345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NT_187147	TA	3	6	83602	83607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187147	GC	3	6	83891	83896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NT_187147	CG	3	6	88231	88236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NT_187147	AC	3	6	88627	88632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187147	GT	3	6	88930	88935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187147	TG	3	6	89032	89037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187147	GT	3	6	89679	89684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187147	TG	3	6	90909	90914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187147	CG	3	6	94660	94665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NT_187147	GT	3	6	95113	95118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187147	AG	3	6	97304	97309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187147	CT	3	6	97517	97522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NT_187147	GA	4	8	97654	97661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187147	CT	3	6	99090	99095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NT_187147	AT	3	6	105022	105027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187147	TA	3	6	105095	105100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187147	GC	3	6	105177	105182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NT_187147	GC	3	6	105184	105189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187147	GC	3	6	112085	112090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NT_187147	CT	3	6	116204	116209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NT_187147	GC	3	6	116487	116492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NT_187147	GC	3	6	117364	117369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NT_187147	AG	3	6	117409	117414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187147	AG	3	6	117662	117667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187147	TG	3	6	121488	121493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187147	GC	3	6	123083	123088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NT_187147	CG	3	6	124344	124349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NT_187147	CG	3	6	126745	126750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NT_187147	CG	3	6	126795	126800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NT_187147	CA	3	6	129708	129713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NT_187147	GC	3	6	129729	129734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NT_187147	AT	3	6	130254	130259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187147	GA	3	6	134399	134404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187147	GC	3	6	134633	134638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NT_187147	CT	3	6	134643	134648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NT_187147	AC	3	6	139623	139628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187147	CA	3	6	140829	140834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NT_187147	TC	3	6	142186	142191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NT_187147	TC	3	6	142577	142582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NT_187147	CA	3	6	144457	144462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NT_187147	AG	3	6	145198	145203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187147	TC	3	6	145234	145239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187147	GC	3	6	148504	148509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NT_187147	CG	3	6	148532	148537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NT_187147	CT	3	6	148707	148712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NT_187147	GC	3	6	149143	149148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187147	CT	3	6	150975	150980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NT_187147	TC	3	6	151625	151630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NT_187147	CG	3	6	152613	152618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NT_187147	CG	3	6	168815	168820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NT_187147	GT	3	6	168861	168866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187147	AC	3	6	170688	170693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NT_187147	AG	3	6	174618	174623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187147	GC	3	6	176569	176574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NT_187147	CG	4	8	178481	178488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NT_187147	GC	3	6	179476	179481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NT_187147	CA	3	6	179688	179693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NT_187147	CG	3	6	180860	180865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NT_187147	CG	3	6	181263	181268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NT_187147	GC	3	6	187527	187532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NT_187147	CG	3	6	187610	187615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NT_187147	CG	3	6	188137	188142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NT_187147	AG	3	6	190628	190633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187147	AG	3	6	191270	191275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187147	CG	3	6	193862	193867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NT_187147	GC	3	6	194222	194227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NT_187147	GT	3	6	194475	194480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187147	AG	3	6	194633	194638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187147	TC	3	6	195689	195694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NT_187147	AG	3	6	200140	200145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187147	CG	3	6	200319	200324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NT_187147	CG	3	6	200344	200349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NT_187147	GC	3	6	200742	200747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NT_187147	CT	3	6	200752	200757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NT_187147	GC	3	6	207609	207614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NT_187147	GC	4	8	207626	207633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NT_187147	GC	3	6	208256	208261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NT_187147	GC	4	8	208273	208280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NT_187147	CT	3	6	215628	215633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NT_187147	GC	3	6	217448	217453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NT_187147	CT	4	8	218901	218908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NT_187147	GC	3	6	219497	219502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NT_187147	AT	3	6	219728	219733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187147	CT	3	6	227861	227866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NT_187147	TG	3	6	227923	227928	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187147	CT	3	6	228845	228850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NT_187147	GC	3	6	238407	238412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NT_187147	GC	3	6	238507	238512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NT_187147	CG	4	8	238773	238780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NT_187147	GC	3	6	238914	238919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NT_187147	GC	3	6	238998	239003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NT_187147	GC	3	6	239032	239037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NT_187147	GC	3	6	239317	239322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NT_187147	GC	3	6	241015	241020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NT_187147	GC	3	6	243444	243449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NT_187147	AG	3	6	245069	245074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187147	CG	3	6	245128	245133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NT_187147	GC	3	6	248208	248213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NT_187147	GC	3	6	248258	248263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NT_187147	GC	3	6	248623	248628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NT_187147	CG	3	6	248806	248811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NT_187147	CG	3	6	251411	251416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NT_187147	AT	3	6	252045	252050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187147	AG	3	6	252166	252171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187147	AG	3	6	252214	252219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187147	CA	3	6	255108	255113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NT_187147	TC	3	6	255456	255461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NT_187147	AC	3	6	260195	260200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NT_187147	CG	3	6	265622	265627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NT_187147	GC	3	6	265746	265751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NT_187147	CT	3	6	265966	265971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NT_187147	AT	3	6	266550	266555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187147	CT	3	6	266605	266610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NT_187147	GC	3	6	268468	268473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NT_187147	CG	3	6	268792	268797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NT_187147	CG	3	6	273304	273309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.