MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 428

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	GC	3	6	224	229	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
2	NT_187147	CG	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
3	NT_187147	CG	3	6	594	599	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
4	NT_187147	GC	3	6	908	913	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
5	NT_187147	GC	3	6	1619	1624	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
6	NT_187147	TG	3	6	2063	2068	0 %	50 %	50 %	0 %	399995012
7	NT_187147	GC	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	399995012
8	NT_187147	GA	3	6	2446	2451	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
9	NT_187147	GC	3	6	2546	2551	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
10	NT_187147	GA	3	6	3337	3342	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
11	NT_187147	TG	3	6	4240	4245	0 %	50 %	50 %	0 %	399995014
12	NT_187147	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	399995014
13	NT_187147	GC	3	6	4728	4733	0 %	0 %	50 %	50 %	399995015
14	NT_187147	CG	3	6	5532	5537	0 %	0 %	50 %	50 %	399995016
15	NT_187147	CG	3	6	6027	6032	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
16	NT_187147	GC	3	6	6043	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
17	NT_187147	CG	3	6	6111	6116	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
18	NT_187147	GC	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
19	NT_187147	AC	3	6	8736	8741	50 %	0 %	0 %	50 %	399995021
20	NT_187147	CA	3	6	9182	9187	50 %	0 %	0 %	50 %	399995022
21	NT_187147	GC	3	6	10586	10591	0 %	0 %	50 %	50 %	399995025
22	NT_187147	GC	3	6	11365	11370	0 %	0 %	50 %	50 %	399995027
23	NT_187147	CG	3	6	11403	11408	0 %	0 %	50 %	50 %	399995027
24	NT_187147	CG	3	6	11735	11740	0 %	0 %	50 %	50 %	399995027
25	NT_187147	GA	3	6	12429	12434	50 %	0 %	50 %	0 %	399995028
26	NT_187147	AG	3	6	12453	12458	50 %	0 %	50 %	0 %	399995028
27	NT_187147	CG	3	6	14678	14683	0 %	0 %	50 %	50 %	399995031
28	NT_187147	GC	3	6	15480	15485	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
29	NT_187147	CG	3	6	15813	15818	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
30	NT_187147	GC	3	6	15851	15856	0 %	0 %	50 %	50 %	399995032
31	NT_187147	CG	3	6	16825	16830	0 %	0 %	50 %	50 %	399995035
32	NT_187147	GC	3	6	17025	17030	0 %	0 %	50 %	50 %	399995035
33	NT_187147	GC	3	6	17740	17745	0 %	0 %	50 %	50 %	399995036
34	NT_187147	CG	3	6	18094	18099	0 %	0 %	50 %	50 %	399995036
35	NT_187147	GC	3	6	19367	19372	0 %	0 %	50 %	50 %	399995038
36	NT_187147	CG	3	6	19682	19687	0 %	0 %	50 %	50 %	399995038
37	NT_187147	CT	3	6	20410	20415	0 %	50 %	0 %	50 %	399995039
38	NT_187147	TC	3	6	22069	22074	0 %	50 %	0 %	50 %	399995041
39	NT_187147	TC	3	6	22583	22588	0 %	50 %	0 %	50 %	399995043
40	NT_187147	GC	3	6	22617	22622	0 %	0 %	50 %	50 %	399995043
41	NT_187147	GC	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	399995043
42	NT_187147	CG	3	6	23075	23080	0 %	0 %	50 %	50 %	399995043
43	NT_187147	GA	3	6	25873	25878	50 %	0 %	50 %	0 %	399995048
44	NT_187147	AC	3	6	26283	26288	50 %	0 %	0 %	50 %	399995048
45	NT_187147	TC	3	6	27345	27350	0 %	50 %	0 %	50 %	399995049
46	NT_187147	GA	3	6	27604	27609	50 %	0 %	50 %	0 %	399995049
47	NT_187147	GC	4	8	28325	28332	0 %	0 %	50 %	50 %	399995050
48	NT_187147	CT	3	6	28520	28525	0 %	50 %	0 %	50 %	399995050
49	NT_187147	GA	3	6	28844	28849	50 %	0 %	50 %	0 %	399995051
50	NT_187147	CA	3	6	29190	29195	50 %	0 %	0 %	50 %	399995051
51	NT_187147	CG	3	6	29815	29820	0 %	0 %	50 %	50 %	399995051
52	NT_187147	CT	3	6	31929	31934	0 %	50 %	0 %	50 %	399995053
53	NT_187147	GT	3	6	32286	32291	0 %	50 %	50 %	0 %	399995053
54	NT_187147	GC	3	6	32581	32586	0 %	0 %	50 %	50 %	399995053
55	NT_187147	AG	3	6	33643	33648	50 %	0 %	50 %	0 %	399995054
56	NT_187147	GA	3	6	34116	34121	50 %	0 %	50 %	0 %	399995054
57	NT_187147	TC	3	6	34149	34154	0 %	50 %	0 %	50 %	399995054
58	NT_187147	AT	3	6	34527	34532	50 %	50 %	0 %	0 %	399995055
59	NT_187147	CG	3	6	35927	35932	0 %	0 %	50 %	50 %	399995057
60	NT_187147	GC	3	6	35985	35990	0 %	0 %	50 %	50 %	399995057
61	NT_187147	CG	3	6	38423	38428	0 %	0 %	50 %	50 %	399995059
62	NT_187147	GC	4	8	39138	39145	0 %	0 %	50 %	50 %	399995060
63	NT_187147	CG	3	6	39260	39265	0 %	0 %	50 %	50 %	399995060
64	NT_187147	CG	3	6	39535	39540	0 %	0 %	50 %	50 %	399995060
65	NT_187147	CG	3	6	40178	40183	0 %	0 %	50 %	50 %	399995061
66	NT_187147	CT	3	6	40263	40268	0 %	50 %	0 %	50 %	399995061
67	NT_187147	CG	3	6	40479	40484	0 %	0 %	50 %	50 %	399995061
68	NT_187147	CG	3	6	40690	40695	0 %	0 %	50 %	50 %	399995062
69	NT_187147	CG	3	6	40869	40874	0 %	0 %	50 %	50 %	399995062
70	NT_187147	GT	3	6	40942	40947	0 %	50 %	50 %	0 %	399995062
71	NT_187147	TA	3	6	41058	41063	50 %	50 %	0 %	0 %	399995062
72	NT_187147	CG	3	6	41163	41168	0 %	0 %	50 %	50 %	399995062
73	NT_187147	CG	3	6	41256	41261	0 %	0 %	50 %	50 %	399995062
74	NT_187147	CG	4	8	41953	41960	0 %	0 %	50 %	50 %	399995063
75	NT_187147	GT	3	6	42428	42433	0 %	50 %	50 %	0 %	399995063
76	NT_187147	GC	3	6	42901	42906	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
77	NT_187147	GC	3	6	43020	43025	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
78	NT_187147	CG	5	10	43035	43044	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
79	NT_187147	GC	3	6	43109	43114	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
80	NT_187147	GC	3	6	43191	43196	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
81	NT_187147	GC	3	6	43412	43417	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
82	NT_187147	CG	4	8	43546	43553	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
83	NT_187147	CG	3	6	43860	43865	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
84	NT_187147	GC	3	6	44017	44022	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
85	NT_187147	CG	3	6	44051	44056	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
86	NT_187147	GC	3	6	44212	44217	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
87	NT_187147	CG	3	6	44515	44520	0 %	0 %	50 %	50 %	399995064
88	NT_187147	CG	3	6	45334	45339	0 %	0 %	50 %	50 %	399995065
89	NT_187147	GT	3	6	48867	48872	0 %	50 %	50 %	0 %	399995069
90	NT_187147	CG	3	6	50962	50967	0 %	0 %	50 %	50 %	399995073
91	NT_187147	CT	3	6	51139	51144	0 %	50 %	0 %	50 %	399995073
92	NT_187147	GC	4	8	51484	51491	0 %	0 %	50 %	50 %	399995074
93	NT_187147	TC	3	6	51751	51756	0 %	50 %	0 %	50 %	399995074
94	NT_187147	CG	3	6	51975	51980	0 %	0 %	50 %	50 %	399995074
95	NT_187147	GC	3	6	53609	53614	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
96	NT_187147	GC	3	6	54320	54325	0 %	0 %	50 %	50 %	399995077
97	NT_187147	CG	4	8	54968	54975	0 %	0 %	50 %	50 %	399995078
98	NT_187147	GC	3	6	55581	55586	0 %	0 %	50 %	50 %	399995078
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100	NT_187147	CG	3	6	55926	55931	0 %	0 %	50 %	50 %	399995078
101	NT_187147	GC	3	6	57243	57248	0 %	0 %	50 %	50 %	399995079
102	NT_187147	GC	3	6	59121	59126	0 %	0 %	50 %	50 %	399995080
103	NT_187147	TC	3	6	59851	59856	0 %	50 %	0 %	50 %	399995081
104	NT_187147	GA	3	6	60251	60256	50 %	0 %	50 %	0 %	399995081
105	NT_187147	CT	3	6	61637	61642	0 %	50 %	0 %	50 %	399995082
106	NT_187147	CG	3	6	62256	62261	0 %	0 %	50 %	50 %	399995083
107	NT_187147	TC	3	6	62395	62400	0 %	50 %	0 %	50 %	399995083
108	NT_187147	AC	3	6	62461	62466	50 %	0 %	0 %	50 %	399995083
109	NT_187147	GA	4	8	64323	64330	50 %	0 %	50 %	0 %	399995084
110	NT_187147	CG	3	6	64566	64571	0 %	0 %	50 %	50 %	399995084
111	NT_187147	GC	3	6	64608	64613	0 %	0 %	50 %	50 %	399995084
112	NT_187147	AT	3	6	64849	64854	50 %	50 %	0 %	0 %	399995085
113	NT_187147	GC	3	6	65398	65403	0 %	0 %	50 %	50 %	399995085
114	NT_187147	CG	3	6	65973	65978	0 %	0 %	50 %	50 %	399995087
115	NT_187147	GC	3	6	66040	66045	0 %	0 %	50 %	50 %	399995087
116	NT_187147	CG	3	6	66936	66941	0 %	0 %	50 %	50 %	399995088
117	NT_187147	GC	3	6	66975	66980	0 %	0 %	50 %	50 %	399995088
118	NT_187147	GA	3	6	67251	67256	50 %	0 %	50 %	0 %	399995088
119	NT_187147	GC	3	6	67641	67646	0 %	0 %	50 %	50 %	399995089
120	NT_187147	GC	3	6	67751	67756	0 %	0 %	50 %	50 %	399995089
121	NT_187147	GC	3	6	68218	68223	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
122	NT_187147	CG	3	6	68376	68381	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
123	NT_187147	GC	3	6	68468	68473	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
124	NT_187147	GC	4	8	68907	68914	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
125	NT_187147	CG	3	6	69106	69111	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
126	NT_187147	CG	3	6	69300	69305	0 %	0 %	50 %	50 %	399995090
127	NT_187147	GC	4	8	69440	69447	0 %	0 %	50 %	50 %	399995091
128	NT_187147	CA	3	6	69495	69500	50 %	0 %	0 %	50 %	399995091
129	NT_187147	CG	4	8	69578	69585	0 %	0 %	50 %	50 %	399995091
130	NT_187147	CA	4	8	69605	69612	50 %	0 %	0 %	50 %	399995091
131	NT_187147	GT	3	6	71054	71059	0 %	50 %	50 %	0 %	399995093
132	NT_187147	CA	3	6	72272	72277	50 %	0 %	0 %	50 %	399995095
133	NT_187147	TC	3	6	72340	72345	0 %	50 %	0 %	50 %	399995095
134	NT_187147	CG	3	6	72444	72449	0 %	0 %	50 %	50 %	399995095
135	NT_187147	CA	3	6	74124	74129	50 %	0 %	0 %	50 %	399995096
136	NT_187147	CT	3	6	75162	75167	0 %	50 %	0 %	50 %	399995098
137	NT_187147	AG	3	6	75382	75387	50 %	0 %	50 %	0 %	399995098
138	NT_187147	GC	3	6	75434	75439	0 %	0 %	50 %	50 %	399995098
139	NT_187147	GC	3	6	77332	77337	0 %	0 %	50 %	50 %	399995101
140	NT_187147	GC	3	6	77347	77352	0 %	0 %	50 %	50 %	399995101
141	NT_187147	CG	3	6	78046	78051	0 %	0 %	50 %	50 %	399995102
142	NT_187147	CT	3	6	79401	79406	0 %	50 %	0 %	50 %	399995103
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.