MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	A	6	6	3508	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	399995013
2	NT_187147	T	6	6	6884	6889	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
3	NT_187147	T	6	6	6919	6924	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
4	NT_187147	T	7	7	16669	16675	0 %	100 %	0 %	0 %	399995034
5	NT_187147	A	8	8	21954	21961	100 %	0 %	0 %	0 %	399995040
6	NT_187147	T	6	6	22406	22411	0 %	100 %	0 %	0 %	399995042
7	NT_187147	A	7	7	26050	26056	100 %	0 %	0 %	0 %	399995048
8	NT_187147	A	6	6	27148	27153	100 %	0 %	0 %	0 %	399995049
9	NT_187147	A	6	6	28202	28207	100 %	0 %	0 %	0 %	399995050
10	NT_187147	T	6	6	32076	32081	0 %	100 %	0 %	0 %	399995053
11	NT_187147	T	6	6	33301	33306	0 %	100 %	0 %	0 %	399995054
12	NT_187147	G	7	7	34914	34920	0 %	0 %	100 %	0 %	399995055
13	NT_187147	A	6	6	38441	38446	100 %	0 %	0 %	0 %	399995059
14	NT_187147	A	6	6	44453	44458	100 %	0 %	0 %	0 %	399995064
15	NT_187147	A	6	6	46888	46893	100 %	0 %	0 %	0 %	399995067
16	NT_187147	C	6	6	47796	47801	0 %	0 %	0 %	100 %	399995068
17	NT_187147	A	6	6	58635	58640	100 %	0 %	0 %	0 %	399995080
18	NT_187147	T	6	6	64295	64300	0 %	100 %	0 %	0 %	399995084
19	NT_187147	C	6	6	65028	65033	0 %	0 %	0 %	100 %	399995085
20	NT_187147	C	6	6	71664	71669	0 %	0 %	0 %	100 %	399995094
21	NT_187147	C	7	7	73417	73423	0 %	0 %	0 %	100 %	399995096
22	NT_187147	T	6	6	73697	73702	0 %	100 %	0 %	0 %	399995096
23	NT_187147	T	6	6	76252	76257	0 %	100 %	0 %	0 %	399995099
24	NT_187147	A	6	6	78597	78602	100 %	0 %	0 %	0 %	399995102
25	NT_187147	C	6	6	78846	78851	0 %	0 %	0 %	100 %	399995102
26	NT_187147	A	7	7	88040	88046	100 %	0 %	0 %	0 %	399995109
27	NT_187147	T	6	6	90182	90187	0 %	100 %	0 %	0 %	399995111
28	NT_187147	C	6	6	97100	97105	0 %	0 %	0 %	100 %	399995120
29	NT_187147	T	6	6	98363	98368	0 %	100 %	0 %	0 %	399995122
30	NT_187147	A	6	6	98769	98774	100 %	0 %	0 %	0 %	399995123
31	NT_187147	A	6	6	105343	105348	100 %	0 %	0 %	0 %	399995129
32	NT_187147	A	6	6	106735	106740	100 %	0 %	0 %	0 %	399995130
33	NT_187147	C	6	6	109604	109609	0 %	0 %	0 %	100 %	399995136
34	NT_187147	C	6	6	109663	109668	0 %	0 %	0 %	100 %	399995137
35	NT_187147	C	6	6	141330	141335	0 %	0 %	0 %	100 %	399995165
36	NT_187147	A	6	6	142670	142675	100 %	0 %	0 %	0 %	399995167
37	NT_187147	C	6	6	150461	150466	0 %	0 %	0 %	100 %	399995175
38	NT_187147	A	8	8	152241	152248	100 %	0 %	0 %	0 %	399995177
39	NT_187147	T	7	7	153240	153246	0 %	100 %	0 %	0 %	399995178
40	NT_187147	T	6	6	153274	153279	0 %	100 %	0 %	0 %	399995178
41	NT_187147	A	6	6	154095	154100	100 %	0 %	0 %	0 %	399995179
42	NT_187147	A	6	6	162398	162403	100 %	0 %	0 %	0 %	399995184
43	NT_187147	G	6	6	165896	165901	0 %	0 %	100 %	0 %	399995187
44	NT_187147	C	6	6	166296	166301	0 %	0 %	0 %	100 %	399995188
45	NT_187147	A	7	7	169082	169088	100 %	0 %	0 %	0 %	399995190
46	NT_187147	A	6	6	175636	175641	100 %	0 %	0 %	0 %	399995196
47	NT_187147	G	6	6	183551	183556	0 %	0 %	100 %	0 %	399995206
48	NT_187147	T	6	6	186380	186385	0 %	100 %	0 %	0 %	399995210
49	NT_187147	A	6	6	188934	188939	100 %	0 %	0 %	0 %	399995211
50	NT_187147	A	6	6	189558	189563	100 %	0 %	0 %	0 %	399995211
51	NT_187147	G	6	6	190474	190479	0 %	0 %	100 %	0 %	399995213
52	NT_187147	A	6	6	203158	203163	100 %	0 %	0 %	0 %	399995229
53	NT_187147	T	7	7	207081	207087	0 %	100 %	0 %	0 %	399995232
54	NT_187147	A	6	6	212548	212553	100 %	0 %	0 %	0 %	399995239
55	NT_187147	A	6	6	216772	216777	100 %	0 %	0 %	0 %	399995244
56	NT_187147	G	6	6	220555	220560	0 %	0 %	100 %	0 %	399995249
57	NT_187147	A	6	6	224725	224730	100 %	0 %	0 %	0 %	399995255
58	NT_187147	G	6	6	225083	225088	0 %	0 %	100 %	0 %	399995255
59	NT_187147	A	6	6	228773	228778	100 %	0 %	0 %	0 %	399995258
60	NT_187147	C	8	8	243667	243674	0 %	0 %	0 %	100 %	399995275
61	NT_187147	C	6	6	259732	259737	0 %	0 %	0 %	100 %	399995290
62	NT_187147	T	6	6	264856	264861	0 %	100 %	0 %	0 %	399995296
63	NT_187147	G	7	7	267231	267237	0 %	0 %	100 %	0 %	399995301
64	NT_187147	T	7	7	273016	273022	0 %	100 %	0 %	0 %	399995308

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.