MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187146	CGC	2	6	37	42	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187146	CGC	2	6	73	78	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NT_187146	CTG	2	6	144	149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187146	ACT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187146	AAG	2	6	231	236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187146	TGG	2	6	362	367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187146	CTG	2	6	592	597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187146	GGC	2	6	604	609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187146	GGC	2	6	665	670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994763
10	NT_187146	ACG	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994763
11	NT_187146	GCC	3	9	841	849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399994763
12	NT_187146	AGG	2	6	959	964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399994763
13	NT_187146	CAT	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994763
14	NT_187146	GTC	2	6	1077	1082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994763
15	NT_187146	CGG	2	6	1101	1106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994763
16	NT_187146	TTC	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399994763
17	NT_187146	AAG	2	6	1345	1350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399994763
18	NT_187146	GAC	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187146	ATC	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994764
20	NT_187146	GCG	2	6	1789	1794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994765
21	NT_187146	CGA	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994765
22	NT_187146	GCC	3	9	2058	2066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399994765
23	NT_187146	ATC	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994765
24	NT_187146	GCC	2	6	2139	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399994765
25	NT_187146	TCA	2	6	2209	2214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994765
26	NT_187146	TGA	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187146	GCG	2	6	2364	2369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187146	TCA	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994766
29	NT_187146	CGG	2	6	2457	2462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994766
30	NT_187146	GAT	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994766
31	NT_187146	TTG	2	6	2845	2850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399994766
32	NT_187146	TCT	2	6	2994	2999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399994766
33	NT_187146	GTC	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994766
34	NT_187146	CCT	2	6	3248	3253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399994766
35	NT_187146	AGA	2	6	3331	3336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399994766
36	NT_187146	GAT	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994766
37	NT_187146	GGA	2	6	3417	3422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399994766
38	NT_187146	CTC	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399994766
39	NT_187146	TCG	2	6	3511	3516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994766
40	NT_187146	CAA	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399994766
41	NT_187146	GAT	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994766
42	NT_187146	CTC	3	9	3735	3743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399994766
43	NT_187146	ACG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994766
44	NT_187146	CGT	2	6	3992	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994766
45	NT_187146	GAC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994766
46	NT_187146	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994766
47	NT_187146	CAT	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399994767
48	NT_187146	TTC	2	6	4495	4500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399994767
49	NT_187146	CGG	2	6	4546	4551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994767
50	NT_187146	GCG	2	6	4702	4707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399994767
51	NT_187146	TGA	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994768
52	NT_187146	CGA	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994768
53	NT_187146	CGT	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399994768
54	NT_187146	AGC	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994768
55	NT_187146	GAT	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994768
56	NT_187146	AGC	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399994768
57	NT_187146	GAT	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399994768
58	NT_187146	TCA	2	6	5859	5864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187146	ATC	2	6	5906	5911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NT_187146	CTG	2	6	5912	5917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187146	GGT	2	6	6085	6090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187146	CCG	2	6	6110	6115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NT_187146	GAC	2	6	6121	6126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187146	ATG	2	6	6143	6148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187146	TCG	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187146	CCG	2	6	6296	6301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NT_187146	GAA	2	6	6379	6384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187146	GTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187146	GCC	2	6	6443	6448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NT_187146	GCC	2	6	6584	6589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.