MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187145	AGA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202380
2	NT_187145	TAA	2	6	94	99	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202380
3	NT_187145	GAT	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202380
4	NT_187145	ATA	2	6	564	569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187145	AAT	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187145	TTA	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187145	ATA	2	6	1011	1016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187145	ATT	2	6	1069	1074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202381
9	NT_187145	AGG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202381
10	NT_187145	GTA	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202381
11	NT_187145	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202381
12	NT_187145	GAA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202381
13	NT_187145	TGC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202381
14	NT_187145	CCT	2	6	1605	1610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NT_187145	TAT	2	6	1636	1641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187145	CAT	2	6	1647	1652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187145	AAT	2	6	1667	1672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187145	TAA	2	6	1702	1707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187145	TAA	2	6	1724	1729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187145	ATT	2	6	1784	1789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187145	TAT	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187145	ATT	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187145	AGT	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187145	TAG	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187145	ATA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187145	TTA	2	6	2048	2053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187145	ATT	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187145	GTT	2	6	2139	2144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187145	TAT	2	6	2163	2168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187145	ATT	2	6	2227	2232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187145	ATA	2	6	2256	2261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187145	ATT	2	6	2277	2282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187145	TAA	2	6	2349	2354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187145	ATA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187145	GAA	3	9	2371	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
36	NT_187145	TGA	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
37	NT_187145	TAA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202382
38	NT_187145	TGC	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
39	NT_187145	AAG	2	6	2544	2549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
40	NT_187145	TGA	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
41	NT_187145	CTG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
42	NT_187145	GTT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202382
43	NT_187145	GCT	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
44	NT_187145	AAG	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
45	NT_187145	TGA	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
46	NT_187145	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202382
47	NT_187145	TAA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202382
48	NT_187145	GAA	2	6	2873	2878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
49	NT_187145	GTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202382
50	NT_187145	GCT	2	6	2918	2923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
51	NT_187145	GCT	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
52	NT_187145	ATT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187145	ATT	2	6	3118	3123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187145	AAT	2	6	3246	3251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187145	ATT	2	6	3312	3317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187145	AAT	2	6	3338	3343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187145	AGG	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187145	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
59	NT_187145	AGA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
60	NT_187145	AGA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
61	NT_187145	TGT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202383
62	NT_187145	GAA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
63	NT_187145	AGT	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
64	NT_187145	TGA	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
65	NT_187145	CAA	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202383
66	NT_187145	AGA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
67	NT_187145	AGA	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
68	NT_187145	AAG	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
69	NT_187145	TGA	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
70	NT_187145	AAG	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
71	NT_187145	GAA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
72	NT_187145	AAG	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
73	NT_187145	AGA	2	6	4084	4089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
74	NT_187145	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
75	NT_187145	ACG	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202383
76	NT_187145	TTA	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
77	NT_187145	TCT	3	9	4165	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202383
78	NT_187145	AAG	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
79	NT_187145	AAG	2	6	4305	4310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187145	ATT	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187145	TAA	2	6	4472	4477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187145	AGC	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202384
83	NT_187145	ATT	2	6	4689	4694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202384
84	NT_187145	AGT	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202384
85	NT_187145	TGA	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202384
86	NT_187145	AGA	3	9	4858	4866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202384
87	NT_187145	ATA	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384
88	NT_187145	AAT	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384
89	NT_187145	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202384
90	NT_187145	ATT	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202384
91	NT_187145	CTA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202384
92	NT_187145	TAA	2	6	5357	5362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.