MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187145	AGA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202380
2	NT_187145	TAA	2	6	94	99	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202380
3	NT_187145	GAT	2	6	374	379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202380
4	NT_187145	ATT	2	6	1069	1074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202381
5	NT_187145	AGG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202381
6	NT_187145	GTA	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202381
7	NT_187145	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202381
8	NT_187145	GAA	2	6	1530	1535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202381
9	NT_187145	TGC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202381
10	NT_187145	GAA	3	9	2371	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
11	NT_187145	TGA	2	6	2397	2402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
12	NT_187145	TAA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202382
13	NT_187145	TGC	2	6	2530	2535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
14	NT_187145	AAG	2	6	2544	2549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
15	NT_187145	TGA	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
16	NT_187145	CTG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
17	NT_187145	GTT	2	6	2744	2749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202382
18	NT_187145	GCT	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
19	NT_187145	AAG	2	6	2756	2761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
20	NT_187145	TGA	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202382
21	NT_187145	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202382
22	NT_187145	TAA	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202382
23	NT_187145	GAA	2	6	2873	2878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202382
24	NT_187145	GTT	2	6	2908	2913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202382
25	NT_187145	GCT	2	6	2918	2923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
26	NT_187145	GCT	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202382
27	NT_187145	ATT	2	6	3408	3413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
28	NT_187145	AGA	2	6	3480	3485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
29	NT_187145	AGA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
30	NT_187145	TGT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202383
31	NT_187145	GAA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
32	NT_187145	AGT	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
33	NT_187145	TGA	2	6	3606	3611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
34	NT_187145	CAA	2	6	3637	3642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202383
35	NT_187145	AGA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
36	NT_187145	AGA	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
37	NT_187145	AAG	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
38	NT_187145	TGA	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202383
39	NT_187145	AAG	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
40	NT_187145	GAA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
41	NT_187145	AAG	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
42	NT_187145	AGA	2	6	4084	4089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
43	NT_187145	ATT	2	6	4097	4102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
44	NT_187145	ACG	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202383
45	NT_187145	TTA	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202383
46	NT_187145	TCT	3	9	4165	4173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202383
47	NT_187145	AAG	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202383
48	NT_187145	AGC	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202384
49	NT_187145	ATT	2	6	4689	4694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202384
50	NT_187145	AGT	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202384
51	NT_187145	TGA	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202384
52	NT_187145	AGA	3	9	4858	4866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202384
53	NT_187145	ATA	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384
54	NT_187145	AAT	2	6	5078	5083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384
55	NT_187145	TCA	2	6	5144	5149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202384
56	NT_187145	ATT	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202384
57	NT_187145	CTA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202384
58	NT_187145	TAA	2	6	5357	5362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202384

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.