MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 983

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187144	TAA	2	6	30	35	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187144	GCA	2	6	113	118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187144	CTG	2	6	217	222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187144	TGC	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187144	AAG	2	6	293	298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187144	TGT	2	6	306	311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187144	GTT	2	6	316	321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187144	GTG	2	6	370	375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187144	ATG	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187144	ATT	2	6	459	464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187144	TGA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187144	AAG	2	6	505	510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187144	AGG	2	6	704	709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187144	AAT	3	9	741	749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202378
15	NT_187144	AAG	2	6	973	978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202378
16	NT_187144	TTG	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202378
17	NT_187144	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202378
18	NT_187144	TTA	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202378
19	NT_187144	CAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202378
20	NT_187144	GAT	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202378
21	NT_187144	ATT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202378
22	NT_187144	AGC	2	6	1320	1325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202378
23	NT_187144	ATA	2	6	1466	1471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202378
24	NT_187144	TGC	2	6	1512	1517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202378
25	NT_187144	ACG	2	6	1588	1593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202378
26	NT_187144	GCA	3	9	1603	1611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202378
27	NT_187144	TAA	2	6	1640	1645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202378
28	NT_187144	AAG	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202378
29	NT_187144	CAA	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202378
30	NT_187144	GCA	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187144	ATA	2	6	2140	2145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187144	CAT	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187144	ACA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187144	GAT	2	6	2388	2393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187144	CTA	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187144	CTT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187144	TAA	2	6	2582	2587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187144	ACA	2	6	2600	2605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.