MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1051L

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187143	CTCTT	2	10	557	566	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NT_187143	TTTTA	2	10	2062	2071	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187143	GATAA	2	10	2486	2495	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187143	AAATA	2	10	5196	5205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187143	TTTTA	2	10	6655	6664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187143	ATTTT	2	10	6856	6865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187143	GAACA	2	10	9335	9344	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NT_187143	GATAA	2	10	11396	11405	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187143	AAAAG	2	10	14500	14509	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187143	TCAAA	2	10	16868	16877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NT_187143	TCAAG	2	10	16997	17006	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NT_187143	AGAAA	2	10	17658	17667	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187143	TTTTA	2	10	18056	18065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187143	GAAAA	2	10	19012	19021	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187143	ATTTT	2	10	19497	19506	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187143	TAAAA	2	10	19914	19923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187143	CTTTA	2	10	20382	20391	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NT_187143	TAAGT	2	10	21481	21490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187143	GATAA	2	10	21628	21637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.