MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1050

Total Repeats: 16

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187142	GCTTAA	2	12	2362	2373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426202360
2	NT_187142	TGATGT	2	12	2380	2391	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	426202360
3	NT_187142	TTTAAA	2	12	2403	2414	50 %	50 %	0 %	0 %	426202360
4	NT_187142	TATACT	2	12	3414	3425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NT_187142	AGGCTA	2	12	7079	7090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	426202363
6	NT_187142	AGGTAA	2	12	7200	7211	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	426202363
7	NT_187142	AAGGTA	2	12	8344	8355	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187142	TTAATA	2	12	9267	9278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187142	AGGTAA	2	12	10590	10601	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	426202367
10	NT_187142	GATGCT	2	12	11550	11561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NT_187142	ATTTAA	2	12	15400	15411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187142	CAGCAT	2	12	16589	16600	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187142	GCACTA	2	12	17700	17711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	426202368
14	NT_187142	CATTAG	2	12	18672	18683	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	426202369
15	NT_187142	GCATTA	2	12	19288	19299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NT_187142	AGCATC	2	12	20681	20692	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.