MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1050

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187142	TTGC	2	8	288	295	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187142	ATTT	2	8	1098	1105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187142	TTTG	2	8	1167	1174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187142	CTTT	2	8	1498	1505	0 %	75 %	0 %	25 %	426202359
5	NT_187142	AGGC	2	8	1897	1904	25 %	0 %	50 %	25 %	426202360
6	NT_187142	TTAA	2	8	2502	2509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187142	TTAT	2	8	2920	2927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187142	TTAT	2	8	3597	3604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187142	TAAG	2	8	3920	3927	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187142	AGAT	2	8	3949	3956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187142	ATTT	2	8	4177	4184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187142	ATTA	2	8	4412	4419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187142	TTCT	2	8	4454	4461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NT_187142	TATT	2	8	4536	4543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187142	TTTA	2	8	4673	4680	25 %	75 %	0 %	0 %	426202361
16	NT_187142	GTAA	2	8	4770	4777	50 %	25 %	25 %	0 %	426202361
17	NT_187142	GAAA	2	8	4867	4874	75 %	0 %	25 %	0 %	426202361
18	NT_187142	TAAA	2	8	5053	5060	75 %	25 %	0 %	0 %	426202361
19	NT_187142	AAAG	2	8	5126	5133	75 %	0 %	25 %	0 %	426202361
20	NT_187142	TAAC	2	8	5279	5286	50 %	25 %	0 %	25 %	426202361
21	NT_187142	AATA	2	8	5292	5299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187142	ATAA	2	8	5465	5472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187142	TTTA	2	8	5695	5702	25 %	75 %	0 %	0 %	426202362
24	NT_187142	TTGC	2	8	5945	5952	0 %	50 %	25 %	25 %	426202362
25	NT_187142	AAAT	2	8	6076	6083	75 %	25 %	0 %	0 %	426202362
26	NT_187142	TAAC	2	8	6301	6308	50 %	25 %	0 %	25 %	426202362
27	NT_187142	AATA	2	8	6314	6321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187142	ATAA	2	8	6487	6494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187142	TTTA	2	8	6717	6724	25 %	75 %	0 %	0 %	426202363
30	NT_187142	TTAG	2	8	6874	6881	25 %	50 %	25 %	0 %	426202363
31	NT_187142	TAAA	2	8	7502	7509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187142	TACT	2	8	7634	7641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NT_187142	TATT	2	8	7744	7751	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187142	TAAG	2	8	8229	8236	50 %	25 %	25 %	0 %	426202364
35	NT_187142	ATTA	2	8	8636	8643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187142	ACCC	2	8	8818	8825	25 %	0 %	0 %	75 %	426202365
37	NT_187142	GATT	2	8	8994	9001	25 %	50 %	25 %	0 %	426202365
38	NT_187142	ATTT	2	8	9279	9286	25 %	75 %	0 %	0 %	426202366
39	NT_187142	CAAT	2	8	9464	9471	50 %	25 %	0 %	25 %	426202366
40	NT_187142	TTTC	2	8	9703	9710	0 %	75 %	0 %	25 %	426202366
41	NT_187142	TGAT	2	8	9799	9806	25 %	50 %	25 %	0 %	426202366
42	NT_187142	TTTA	2	8	10113	10120	25 %	75 %	0 %	0 %	426202367
43	NT_187142	AATA	2	8	10735	10742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187142	TTAA	2	8	10768	10775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187142	ATAA	2	8	10909	10916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187142	AAGT	2	8	10975	10982	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187142	TTTA	2	8	11135	11142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187142	AAAG	2	8	11330	11337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187142	AATA	2	8	11737	11744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187142	TTAA	2	8	11769	11776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187142	TTTA	2	8	11849	11856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187142	AAAG	2	8	12467	12474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187142	TTAA	2	8	12967	12974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187142	TAGT	2	8	13011	13018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187142	TCTA	2	8	13170	13177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NT_187142	ATTT	2	8	13241	13248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187142	CCTT	2	8	13309	13316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NT_187142	TTTC	2	8	13431	13438	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NT_187142	ATAA	2	8	13624	13631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187142	GCTA	2	8	13981	13988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NT_187142	CTTT	2	8	14136	14143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NT_187142	CTTT	2	8	14368	14375	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NT_187142	CCTA	2	8	14723	14730	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NT_187142	AAAT	2	8	15372	15379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187142	CTTT	2	8	15558	15565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NT_187142	TTAG	2	8	15579	15586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187142	AATT	2	8	16631	16638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187142	AGCT	2	8	17660	17667	25 %	25 %	25 %	25 %	426202368
69	NT_187142	ATAA	2	8	18021	18028	75 %	25 %	0 %	0 %	426202368
70	NT_187142	CTAT	2	8	18085	18092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NT_187142	AAGC	2	8	18114	18121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NT_187142	ATCA	2	8	18574	18581	50 %	25 %	0 %	25 %	426202369
73	NT_187142	ATAA	2	8	19220	19227	75 %	25 %	0 %	0 %	426202369
74	NT_187142	CTTC	2	8	19874	19881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NT_187142	ATAA	2	8	20352	20359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187142	CAAC	2	8	21449	21456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NT_187142	TAAA	2	8	21460	21467	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187142	TTTA	2	8	21633	21640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187142	AATA	2	8	22167	22174	75 %	25 %	0 %	0 %	426202370
80	NT_187142	GCTT	2	8	22771	22778	0 %	50 %	25 %	25 %	426202370
81	NT_187142	TAAG	2	8	22832	22839	50 %	25 %	25 %	0 %	426202370
82	NT_187142	TAAT	2	8	23039	23046	50 %	50 %	0 %	0 %	426202371
83	NT_187142	GTAT	2	8	23195	23202	25 %	50 %	25 %	0 %	426202371
84	NT_187142	CAAG	2	8	23435	23442	50 %	0 %	25 %	25 %	426202371
85	NT_187142	AGAA	2	8	23679	23686	75 %	0 %	25 %	0 %	426202371
86	NT_187142	ATTT	2	8	23701	23708	25 %	75 %	0 %	0 %	426202371

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.