MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1050

Total Repeats: 229

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187142	GGT	2	6	80	85	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187142	AAG	2	6	179	184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187142	ATA	2	6	318	323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187142	TAA	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187142	TAC	2	6	367	372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187142	TCT	2	6	376	381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187142	TTA	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187142	TAA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187142	ATG	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187142	CTT	2	6	1148	1153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187142	ATT	2	6	1209	1214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187142	TGT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187142	AGC	2	6	2516	2521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187142	AAT	3	9	2595	2603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187142	GGT	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187142	AAT	2	6	2715	2720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187142	CAT	2	6	2827	2832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187142	TGG	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187142	TAT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187142	ACA	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187142	TTA	2	6	3127	3132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187142	AAG	2	6	3139	3144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187142	ATA	2	6	3302	3307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187142	TAT	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187142	ACT	2	6	3383	3388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187142	TAT	2	6	3478	3483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187142	AAT	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187142	AAG	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187142	TAA	3	9	3606	3614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187142	TTA	2	6	3632	3637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187142	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187142	TAG	2	6	4083	4088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187142	AGT	2	6	4186	4191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187142	AGA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187142	AAT	2	6	4267	4272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187142	TTA	2	6	4318	4323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187142	ACA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187142	AGT	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187142	TAT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187142	TTA	2	6	5325	5330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187142	AAT	2	6	5513	5518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187142	AAT	2	6	5579	5584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187142	AAG	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187142	TTA	2	6	6332	6337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187142	TTA	2	6	6347	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187142	AAG	2	6	6395	6400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187142	AAT	2	6	6535	6540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187142	AAT	2	6	6601	6606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187142	AAT	2	6	7346	7351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187142	ATT	2	6	7358	7363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187142	ATT	2	6	7370	7375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187142	AGG	2	6	7452	7457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187142	TTA	2	6	7703	7708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187142	TTG	2	6	8319	8324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187142	AGA	2	6	8438	8443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187142	ATT	2	6	8534	8539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187142	ATG	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187142	TTC	2	6	8689	8694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187142	TGT	2	6	8729	8734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187142	ATT	3	9	9985	9993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187142	TAG	2	6	10004	10009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187142	TAA	2	6	10059	10064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187142	AGT	2	6	10748	10753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187142	TAT	2	6	10754	10759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187142	AAT	2	6	10957	10962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187142	TAA	3	9	11022	11030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187142	ATA	2	6	11079	11084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187142	GAA	3	9	11104	11112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187142	TAA	2	6	11159	11164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187142	AAG	2	6	11278	11283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187142	TGA	2	6	11306	11311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187142	TTA	2	6	11323	11328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187142	ATA	2	6	11359	11364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187142	ATA	2	6	11409	11414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187142	AGG	2	6	11600	11605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187142	CAG	2	6	11629	11634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187142	AGC	2	6	11708	11713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187142	AGT	2	6	11750	11755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187142	CAT	2	6	11959	11964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187142	TAA	2	6	12077	12082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187142	ATA	2	6	12157	12162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187142	TGC	2	6	12239	12244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187142	TGG	2	6	12245	12250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187142	TAA	2	6	12295	12300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187142	AGT	2	6	12323	12328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187142	AAG	2	6	12334	12339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187142	TAA	2	6	12434	12439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187142	GCA	2	6	12486	12491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187142	TGG	2	6	12545	12550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187142	TGC	2	6	12554	12559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187142	AGG	2	6	12632	12637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187142	GGT	2	6	12663	12668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187142	TGT	2	6	12704	12709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187142	AAG	2	6	12811	12816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187142	CTA	3	9	12874	12882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187142	TAA	2	6	12984	12989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187142	ATT	2	6	12998	13003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187142	GCC	2	6	13090	13095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NT_187142	AAC	2	6	13099	13104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NT_187142	TCA	2	6	13195	13200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187142	TTC	2	6	13228	13233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187142	ATG	2	6	13253	13258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187142	GCA	2	6	13273	13278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NT_187142	CTT	2	6	13484	13489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187142	ATT	2	6	13602	13607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187142	ATT	3	9	13636	13644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187142	TAT	2	6	13663	13668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187142	CTT	2	6	13675	13680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187142	AAT	2	6	13752	13757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187142	TTA	2	6	13776	13781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187142	CTT	2	6	13788	13793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187142	TCT	2	6	13874	13879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187142	CTA	2	6	13898	13903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NT_187142	TTG	2	6	13913	13918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187142	CTT	3	9	13940	13948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187142	CCT	2	6	13951	13956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NT_187142	CTG	2	6	13967	13972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187142	CTG	2	6	14029	14034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187142	CCT	2	6	14073	14078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187142	TGC	2	6	14126	14131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187142	ATT	2	6	14151	14156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187142	CTG	2	6	14182	14187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187142	ATT	2	6	14193	14198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187142	GCT	2	6	14199	14204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187142	TGC	2	6	14219	14224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187142	ACC	2	6	14231	14236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NT_187142	TGT	2	6	14291	14296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187142	TTG	2	6	14329	14334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187142	TGT	2	6	14393	14398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187142	TGC	2	6	14414	14419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NT_187142	CTA	2	6	14425	14430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187142	TCA	2	6	14436	14441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187142	CTT	2	6	14446	14451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187142	CCT	2	6	14628	14633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NT_187142	CTT	2	6	14635	14640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187142	CTC	2	6	14764	14769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NT_187142	GTT	3	9	14797	14805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187142	AAC	2	6	14822	14827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187142	TTA	2	6	14856	14861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187142	ATT	2	6	14862	14867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187142	TAA	2	6	15116	15121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187142	ATT	2	6	15167	15172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187142	AGA	2	6	15184	15189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187142	TTC	2	6	15191	15196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NT_187142	ATT	2	6	15383	15388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187142	TAA	2	6	15536	15541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187142	AGA	2	6	15593	15598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187142	TGC	2	6	15623	15628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NT_187142	TAA	2	6	15659	15664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187142	CTT	2	6	15724	15729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NT_187142	ATT	2	6	15915	15920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NT_187142	AAG	2	6	16023	16028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NT_187142	TTA	2	6	16076	16081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NT_187142	GTA	2	6	16082	16087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NT_187142	GTT	2	6	16369	16374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NT_187142	AGC	2	6	16389	16394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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162	NT_187142	AGC	2	6	16488	16493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NT_187142	GTA	2	6	16503	16508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NT_187142	CAA	2	6	16701	16706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NT_187142	TAT	2	6	16753	16758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NT_187142	TAT	2	6	16770	16775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NT_187142	TAG	2	6	16866	16871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NT_187142	CCT	2	6	18073	18078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
172	NT_187142	CCT	2	6	19272	19277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NT_187142	TCA	2	6	19300	19305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NT_187142	TAA	2	6	19320	19325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NT_187142	TTA	2	6	19363	19368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NT_187142	TAG	5	15	19371	19385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NT_187142	CTT	2	6	19443	19448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NT_187142	CTG	2	6	19527	19532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NT_187142	TAG	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NT_187142	GCT	2	6	19748	19753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NT_187142	CAC	2	6	19809	19814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
185	NT_187142	ATT	2	6	19819	19824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NT_187142	TAG	2	6	19962	19967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NT_187142	TAT	2	6	20032	20037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NT_187142	TAT	2	6	20049	20054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NT_187142	TTA	2	6	20129	20134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NT_187142	CCT	2	6	20404	20409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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225	NT_187142	ATA	2	6	21874	21879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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229	NT_187142	TAT	2	6	22970	22975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.