MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047R

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187141	AAGC	2	8	14	21	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187141	GAAG	2	8	481	488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187141	AAAG	2	8	538	545	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187141	TAAA	2	8	1276	1283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187141	TTAT	2	8	1336	1343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187141	GTAG	2	8	1543	1550	25 %	25 %	50 %	0 %	426202351
7	NT_187141	AGTT	2	8	1583	1590	25 %	50 %	25 %	0 %	426202351
8	NT_187141	AAAG	2	8	1626	1633	75 %	0 %	25 %	0 %	426202351
9	NT_187141	ATAA	2	8	1990	1997	75 %	25 %	0 %	0 %	426202351
10	NT_187141	GATA	2	8	2467	2474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187141	ATTA	2	8	2480	2487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187141	CTAA	2	8	2886	2893	50 %	25 %	0 %	25 %	426202352
13	NT_187141	TGAT	2	8	3187	3194	25 %	50 %	25 %	0 %	426202352
14	NT_187141	AGTA	2	8	3470	3477	50 %	25 %	25 %	0 %	426202352
15	NT_187141	TAAG	2	8	3659	3666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187141	ATAA	2	8	3795	3802	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187141	TTTA	2	8	3905	3912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187141	TAAA	2	8	4380	4387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187141	GAAT	2	8	4519	4526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187141	TAAA	2	8	5761	5768	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187141	AATG	2	8	5864	5871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187141	GTAG	2	8	5956	5963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187141	CAAG	2	8	6386	6393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NT_187141	ATTA	2	8	6701	6708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187141	TTTA	2	8	7051	7058	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187141	TTGC	2	8	7074	7081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NT_187141	ATTG	2	8	7626	7633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187141	GAAA	2	8	8134	8141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187141	AGCA	2	8	8553	8560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NT_187141	ATAA	2	8	8650	8657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187141	TGAG	2	8	9326	9333	25 %	25 %	50 %	0 %	426202353
32	NT_187141	TAAT	2	8	10052	10059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187141	TAAA	2	8	10706	10713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187141	TTAG	2	8	11781	11788	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187141	AAGA	2	8	11888	11895	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187141	AGAT	2	8	12072	12079	50 %	25 %	25 %	0 %	426202354
37	NT_187141	AGAT	2	8	12105	12112	50 %	25 %	25 %	0 %	426202354
38	NT_187141	TTGA	2	8	12197	12204	25 %	50 %	25 %	0 %	426202354
39	NT_187141	TAGT	2	8	12970	12977	25 %	50 %	25 %	0 %	426202356
40	NT_187141	TTTA	2	8	13115	13122	25 %	75 %	0 %	0 %	426202356
41	NT_187141	TGTC	3	12	13303	13314	0 %	50 %	25 %	25 %	426202356
42	NT_187141	AAGA	2	8	13557	13564	75 %	0 %	25 %	0 %	426202356
43	NT_187141	TTGT	2	8	13988	13995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187141	AGCA	2	8	14350	14357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NT_187141	ATAA	2	8	14620	14627	75 %	25 %	0 %	0 %	426202357
46	NT_187141	ACAA	2	8	14873	14880	75 %	0 %	0 %	25 %	426202357
47	NT_187141	TAGC	2	8	15086	15093	25 %	25 %	25 %	25 %	426202357
48	NT_187141	AAAG	2	8	15903	15910	75 %	0 %	25 %	0 %	426202357
49	NT_187141	TTAA	2	8	16138	16145	50 %	50 %	0 %	0 %	426202357
50	NT_187141	TATT	3	12	16612	16623	25 %	75 %	0 %	0 %	426202357
51	NT_187141	AGAC	2	8	16817	16824	50 %	0 %	25 %	25 %	426202357

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.