MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047R

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187141	CTT	2	6	28	33	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187141	ATA	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187141	ATT	2	6	49	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187141	TAA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187141	AGG	2	6	167	172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187141	AAT	3	9	203	211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187141	GTA	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187141	AAG	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187141	GCA	2	6	527	532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187141	GTG	2	6	552	557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187141	TGG	2	6	562	567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187141	TAA	2	6	672	677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187141	AAG	2	6	678	683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187141	ATG	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187141	TAA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187141	AGC	3	9	793	801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187141	TGC	3	9	850	858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NT_187141	ATG	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187141	TAC	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187141	GCA	2	6	990	995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187141	GCA	2	6	1087	1092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187141	TAT	3	9	1119	1127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187141	AAG	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187141	ATT	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187141	AGG	2	6	1364	1369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187141	TTG	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187141	AAG	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187141	TAA	2	6	3863	3868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187141	AAT	3	9	3893	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187141	TAA	2	6	3929	3934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187141	GCA	2	6	4035	4040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NT_187141	AAG	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187141	TGA	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187141	GTA	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187141	GCT	2	6	4341	4346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NT_187141	TTG	2	6	4416	4421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187141	TGC	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187141	TAA	2	6	4597	4602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187141	ATT	2	6	4665	4670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187141	ATT	2	6	4682	4687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187141	TGA	2	6	4689	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187141	TAA	2	6	4818	4823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187141	CAT	2	6	4841	4846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187141	TAA	2	6	4959	4964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187141	TTG	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187141	ATA	2	6	5039	5044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187141	TGT	2	6	5118	5123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187141	GGT	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187141	GCT	2	6	5134	5139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187141	GAA	2	6	5158	5163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187141	AAG	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187141	GAT	2	6	5245	5250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187141	ATG	2	6	5285	5290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187141	GTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187141	TGC	3	9	5319	5327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187141	TGC	4	12	5334	5345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187141	CAG	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187141	TGC	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NT_187141	AAT	2	6	5449	5454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187141	TGC	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187141	GGT	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187141	TAA	2	6	5553	5558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187141	AGC	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187141	AAG	2	6	5678	5683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187141	TAA	2	6	5745	5750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187141	AAG	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187141	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187141	ATT	2	6	5830	5835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187141	AGT	2	6	5879	5884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187141	AAT	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187141	AAT	3	9	5911	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187141	TAT	2	6	6026	6031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187141	ATG	2	6	6125	6130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187141	TTA	2	6	6162	6167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187141	AAG	2	6	6249	6254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187141	GTT	2	6	6453	6458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187141	TGC	2	6	6462	6467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187141	GAA	2	6	6486	6491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187141	AGC	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187141	ATT	2	6	6515	6520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187141	TTG	2	6	6646	6651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187141	TTA	2	6	6672	6677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187141	GTA	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187141	TGT	2	6	6788	6793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187141	AAT	2	6	6821	6826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187141	ACT	2	6	7325	7330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187141	ATT	2	6	7377	7382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187141	TCT	2	6	7396	7401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187141	CTT	2	6	7524	7529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187141	ATT	2	6	7543	7548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187141	GGA	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187141	AAG	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187141	AGA	2	6	7777	7782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187141	TAC	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187141	TGA	2	6	7829	7834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187141	TGA	2	6	7853	7858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187141	GAT	2	6	7915	7920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187141	TGA	2	6	7974	7979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187141	TGA	2	6	8104	8109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187141	ATA	2	6	8144	8149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187141	ATT	2	6	8261	8266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187141	TGT	2	6	8280	8285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187141	TTG	2	6	8400	8405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187141	TGA	2	6	8470	8475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187141	GTA	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187141	ATT	2	6	8611	8616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187141	GTG	2	6	8624	8629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187141	TAT	2	6	8641	8646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187141	GAT	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187141	GTA	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187141	ATT	2	6	8979	8984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187141	AAG	2	6	8992	8997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187141	GTA	2	6	9058	9063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187141	GAT	2	6	9972	9977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187141	CTG	2	6	10112	10117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187141	AAT	2	6	10156	10161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187141	TTG	2	6	10316	10321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187141	CAA	2	6	10453	10458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187141	ATG	2	6	10486	10491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187141	TAA	2	6	10542	10547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187141	GTT	2	6	10714	10719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187141	TGT	2	6	10740	10745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187141	ATT	2	6	10782	10787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187141	CGT	2	6	10912	10917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187141	GAA	2	6	10972	10977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187141	TGA	2	6	11025	11030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187141	GAG	2	6	11092	11097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187141	ACA	2	6	11145	11150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187141	AGA	2	6	11175	11180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187141	TGA	2	6	11450	11455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187141	TGA	2	6	11505	11510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187141	ATT	2	6	11536	11541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187141	TAA	2	6	11553	11558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187141	ATT	2	6	11596	11601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187141	AAT	2	6	11602	11607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187141	ATG	2	6	11844	11849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187141	TCA	2	6	12367	12372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187141	AGT	2	6	12375	12380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187141	ATA	2	6	13898	13903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187141	ACT	2	6	13910	13915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187141	TCA	2	6	13932	13937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NT_187141	GTA	2	6	13949	13954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187141	ACC	2	6	13957	13962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NT_187141	ACA	2	6	13967	13972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NT_187141	TTA	2	6	14026	14031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187141	TTA	2	6	14276	14281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187141	ATA	2	6	14325	14330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187141	ATT	2	6	14338	14343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187141	TTA	2	6	14413	14418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187141	GTG	2	6	14427	14432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NT_187141	TGA	2	6	14543	14548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.