MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047R

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187141	AAT	2	6	1401	1406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202351
2	NT_187141	TAA	2	6	1407	1412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202351
3	NT_187141	ATG	3	9	1429	1437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202351
4	NT_187141	GTT	2	6	1441	1446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202351
5	NT_187141	ACA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202351
6	NT_187141	AGC	3	9	1497	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202351
7	NT_187141	AGG	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202351
8	NT_187141	AAG	2	6	1515	1520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202351
9	NT_187141	AGG	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202351
10	NT_187141	AGA	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202351
11	NT_187141	ACT	2	6	1783	1788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202351
12	NT_187141	TGC	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202351
13	NT_187141	CAG	2	6	1979	1984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202351
14	NT_187141	ATA	2	6	2003	2008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202351
15	NT_187141	GAA	2	6	2098	2103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202351
16	NT_187141	AAG	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202351
17	NT_187141	AGA	2	6	2154	2159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202351
18	NT_187141	AGC	3	9	2235	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202351
19	NT_187141	AGG	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202351
20	NT_187141	ATA	2	6	2300	2305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202351
21	NT_187141	CAA	2	6	2345	2350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202351
22	NT_187141	AGA	2	6	2370	2375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202351
23	NT_187141	AAG	2	6	2383	2388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202351
24	NT_187141	TAA	2	6	2461	2466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202351
25	NT_187141	GCT	2	6	2574	2579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202352
26	NT_187141	TTA	2	6	2608	2613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202352
27	NT_187141	ACT	2	6	2754	2759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202352
28	NT_187141	AGC	2	6	2814	2819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202352
29	NT_187141	AAC	2	6	2869	2874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202352
30	NT_187141	AAG	2	6	2911	2916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202352
31	NT_187141	TGC	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202352
32	NT_187141	TAT	2	6	3008	3013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202352
33	NT_187141	TGC	3	9	3074	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202352
34	NT_187141	TAC	2	6	3083	3088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202352
35	NT_187141	CTG	2	6	3097	3102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202352
36	NT_187141	TGC	3	9	3125	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202352
37	NT_187141	CAA	3	9	3239	3247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202352
38	NT_187141	GCT	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202352
39	NT_187141	CTG	3	9	3289	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202352
40	NT_187141	AAC	2	6	3300	3305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202352
41	NT_187141	TAG	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202352
42	NT_187141	AGG	2	6	3362	3367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202352
43	NT_187141	TGC	2	6	3383	3388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202352
44	NT_187141	AGC	3	9	3407	3415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202352
45	NT_187141	TAA	2	6	3575	3580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202352
46	NT_187141	ATC	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202352
47	NT_187141	AAG	2	6	9161	9166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202353
48	NT_187141	ATG	2	6	9269	9274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202353
49	NT_187141	TCT	2	6	9463	9468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202353
50	NT_187141	TCA	2	6	9469	9474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202353
51	NT_187141	GAG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202353
52	NT_187141	ACC	2	6	9560	9565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426202353
53	NT_187141	AAG	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202353
54	NT_187141	ATA	2	6	9656	9661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202353
55	NT_187141	ATG	2	6	9736	9741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202353
56	NT_187141	AGA	2	6	9757	9762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202353
57	NT_187141	CAG	2	6	9806	9811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202353
58	NT_187141	AAG	2	6	9833	9838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202353
59	NT_187141	ATT	2	6	11924	11929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202354
60	NT_187141	TTA	2	6	11932	11937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202354
61	NT_187141	GAA	2	6	11945	11950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202354
62	NT_187141	TGA	2	6	12139	12144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202354
63	NT_187141	GTT	2	6	12248	12253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202354
64	NT_187141	TGC	2	6	12262	12267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202354
65	NT_187141	ATT	2	6	12286	12291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202354
66	NT_187141	TAG	2	6	12323	12328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202354
67	NT_187141	TGA	2	6	12435	12440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202355
68	NT_187141	ATT	2	6	12682	12687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202355
69	NT_187141	GGA	2	6	12721	12726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202355
70	NT_187141	ATA	2	6	12997	13002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202356
71	NT_187141	ACA	2	6	13188	13193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202356
72	NT_187141	ATA	2	6	13201	13206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202356
73	NT_187141	GTT	2	6	13245	13250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202356
74	NT_187141	GAT	2	6	13260	13265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202356
75	NT_187141	ATT	3	9	13292	13300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202356
76	NT_187141	TTA	2	6	13383	13388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202356
77	NT_187141	AAG	2	6	13409	13414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202356
78	NT_187141	TGA	2	6	13484	13489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202356
79	NT_187141	AGA	2	6	13517	13522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202356
80	NT_187141	TTA	2	6	13577	13582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202356
81	NT_187141	ATT	2	6	13594	13599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202356
82	NT_187141	TGA	2	6	13661	13666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202356
83	NT_187141	AGA	2	6	14646	14651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202357
84	NT_187141	CTT	2	6	14689	14694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202357
85	NT_187141	AAG	2	6	14750	14755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202357
86	NT_187141	TAT	2	6	14775	14780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202357
87	NT_187141	ATA	2	6	14797	14802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
88	NT_187141	GAC	2	6	14839	14844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202357
89	NT_187141	ATA	2	6	14888	14893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
90	NT_187141	TGA	2	6	15057	15062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357
91	NT_187141	AAG	2	6	15102	15107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202357
92	NT_187141	TAG	2	6	15128	15133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357
93	NT_187141	AAC	2	6	15134	15139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202357
94	NT_187141	TAG	2	6	15179	15184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357
95	NT_187141	TAA	2	6	15294	15299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
96	NT_187141	ATA	2	6	15326	15331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
97	NT_187141	TAA	2	6	15348	15353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
98	NT_187141	ATA	2	6	15389	15394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
99	NT_187141	AGA	2	6	15435	15440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202357
100	NT_187141	TAA	2	6	15456	15461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
101	NT_187141	AAT	2	6	15523	15528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
102	NT_187141	CTT	2	6	15561	15566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202357
103	NT_187141	TGT	2	6	15624	15629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202357
104	NT_187141	TAG	2	6	15642	15647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357
105	NT_187141	GAA	2	6	15703	15708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202357
106	NT_187141	TCC	2	6	16089	16094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	426202357
107	NT_187141	AAT	4	12	16114	16125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
108	NT_187141	ATA	2	6	16163	16168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
109	NT_187141	CAC	2	6	16169	16174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426202357
110	NT_187141	ATG	2	6	16202	16207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357
111	NT_187141	TGA	2	6	16254	16259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357
112	NT_187141	CTT	2	6	16264	16269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202357
113	NT_187141	ATT	2	6	16273	16278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202357
114	NT_187141	TAA	2	6	16281	16286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202357
115	NT_187141	TGA	2	6	16344	16349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357
116	NT_187141	TTA	2	6	16460	16465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202357
117	NT_187141	TAC	2	6	16507	16512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202357
118	NT_187141	GTA	2	6	16526	16531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357
119	NT_187141	ATT	2	6	16610	16615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202357
120	NT_187141	GAA	2	6	16744	16749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202357
121	NT_187141	TGA	2	6	16782	16787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202357

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.