MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047L

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187140	CTTTT	2	10	1145	1154	0 %	80 %	0 %	20 %	426202341
2	NT_187140	TTTTA	2	10	1699	1708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187140	TTTCT	2	10	1785	1794	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NT_187140	TGATA	2	10	2794	2803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187140	TAATT	2	10	2879	2888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187140	CATTT	2	10	3080	3089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NT_187140	TAATT	2	10	3305	3314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187140	AAAGC	2	10	7346	7355	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NT_187140	TTTTA	2	10	7902	7911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187140	TTTTA	2	10	8935	8944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187140	AAAGT	2	10	9227	9236	60 %	20 %	20 %	0 %	426202343
12	NT_187140	AAATA	2	10	9303	9312	80 %	20 %	0 %	0 %	426202343
13	NT_187140	AAGAG	2	10	11315	11324	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187140	AGAAA	2	10	12232	12241	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187140	ATTTA	2	10	12798	12807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187140	AATCT	2	10	13061	13070	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NT_187140	GATTG	2	10	13339	13348	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187140	TTGTA	2	10	13628	13637	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187140	CTTTT	2	10	14324	14333	0 %	80 %	0 %	20 %	426202345
20	NT_187140	AAAAT	2	10	14457	14466	80 %	20 %	0 %	0 %	426202345
21	NT_187140	AAGGG	2	10	18526	18535	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187140	TTTTA	2	10	18549	18558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187140	ATATT	2	10	19041	19050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187140	TAAAT	2	10	19362	19371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187140	TTATT	2	10	19391	19400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187140	ATATT	2	10	19735	19744	40 %	60 %	0 %	0 %	426202348
27	NT_187140	TTTAA	2	10	20726	20735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.