MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047L

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187140	CTCA	2	8	53	60	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187140	AATT	2	8	80	87	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187140	TTAC	2	8	775	782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NT_187140	CTTT	2	8	1542	1549	0 %	75 %	0 %	25 %	426202341
5	NT_187140	TATG	2	8	2020	2027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187140	ATTA	2	8	2327	2334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187140	AGTT	2	8	2434	2441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187140	TCTT	2	8	2765	2772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NT_187140	ATCT	2	8	3045	3052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NT_187140	TTTA	2	8	4178	4185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187140	TTAA	2	8	4333	4340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187140	AGTT	2	8	4433	4440	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187140	AATA	2	8	4769	4776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187140	TTAA	2	8	4802	4809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187140	AATA	2	8	5647	5654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187140	TTAA	2	8	5681	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187140	TTTA	2	8	5856	5863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187140	TTTA	2	8	6987	6994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187140	AATA	2	8	7606	7613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187140	TTAA	2	8	7639	7646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187140	ATAA	2	8	7780	7787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187140	AAGT	2	8	7846	7853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187140	TTTA	2	8	8009	8016	25 %	75 %	0 %	0 %	426202342
24	NT_187140	GAAA	2	8	8203	8210	75 %	0 %	25 %	0 %	426202342
25	NT_187140	GGAA	2	8	8303	8310	50 %	0 %	50 %	0 %	426202342
26	NT_187140	TAGA	2	8	8470	8477	50 %	25 %	25 %	0 %	426202342
27	NT_187140	AATA	2	8	8640	8647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187140	TTAA	2	8	8673	8680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187140	ATAA	2	8	8814	8821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187140	TAAT	2	8	8864	8871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187140	AAGT	2	8	8879	8886	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187140	GTAA	2	8	8896	8903	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187140	TTTA	2	8	9042	9049	25 %	75 %	0 %	0 %	426202343
34	NT_187140	AATT	2	8	9392	9399	50 %	50 %	0 %	0 %	426202343
35	NT_187140	CTAA	2	8	9406	9413	50 %	25 %	0 %	25 %	426202343
36	NT_187140	ATAA	2	8	11200	11207	75 %	25 %	0 %	0 %	426202344
37	NT_187140	TATT	2	8	11352	11359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187140	AAAG	2	8	11523	11530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187140	ATAA	2	8	12037	12044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187140	ATAG	2	8	12253	12260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187140	TTTA	2	8	12371	12378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187140	ATGA	2	8	12632	12639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187140	TTGC	2	8	13112	13119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187140	TAGA	2	8	13401	13408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187140	GTTA	2	8	13539	13546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187140	TTTG	2	8	13988	13995	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187140	ATTT	2	8	14502	14509	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187140	CAAT	2	8	14703	14710	50 %	25 %	0 %	25 %	426202346
49	NT_187140	TACT	2	8	15061	15068	25 %	50 %	0 %	25 %	426202346
50	NT_187140	ATTT	2	8	15975	15982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187140	CTTA	2	8	16127	16134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NT_187140	TTTA	2	8	16752	16759	25 %	75 %	0 %	0 %	426202347
53	NT_187140	AAAG	2	8	17076	17083	75 %	0 %	25 %	0 %	426202347
54	NT_187140	TTAA	2	8	17846	17853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187140	ATAA	2	8	17987	17994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187140	TAAT	2	8	18037	18044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187140	GGAA	2	8	18105	18112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187140	TTTA	2	8	18138	18145	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187140	ATTA	2	8	18396	18403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187140	TAAA	2	8	18461	18468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187140	TACT	2	8	18853	18860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NT_187140	AAAT	2	8	18940	18947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187140	ATAA	2	8	19383	19390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187140	GTAT	2	8	19472	19479	25 %	50 %	25 %	0 %	426202348
65	NT_187140	TGTT	2	8	19493	19500	0 %	75 %	25 %	0 %	426202348
66	NT_187140	AATT	2	8	19863	19870	50 %	50 %	0 %	0 %	426202348
67	NT_187140	AGAT	2	8	19891	19898	50 %	25 %	25 %	0 %	426202348
68	NT_187140	TAAA	2	8	20447	20454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187140	ATTT	2	8	20491	20498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187140	TTAT	2	8	20704	20711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187140	ACTT	2	8	20880	20887	25 %	50 %	0 %	25 %	426202349
72	NT_187140	GCAA	2	8	20896	20903	50 %	0 %	25 %	25 %	426202349
73	NT_187140	TAAT	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	426202349

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.