MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1047L

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187140	TTA	2	6	1010	1015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
2	NT_187140	TCA	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202341
3	NT_187140	ATA	2	6	1163	1168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
4	NT_187140	ATA	2	6	1220	1225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
5	NT_187140	TTC	2	6	1262	1267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202341
6	NT_187140	ATA	2	6	1307	1312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
7	NT_187140	TTA	2	6	1329	1334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
8	NT_187140	CTT	2	6	1383	1388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202341
9	NT_187140	ATA	2	6	1392	1397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202341
10	NT_187140	TTA	2	6	1407	1412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
11	NT_187140	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202341
12	NT_187140	ACT	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202341
13	NT_187140	AAT	3	9	7997	8005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202342
14	NT_187140	TAA	2	6	8033	8038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202342
15	NT_187140	GCA	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202342
16	NT_187140	AAG	2	6	8152	8157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202342
17	NT_187140	TGA	2	6	8180	8185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202342
18	NT_187140	ATG	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202342
19	NT_187140	ATA	2	6	8289	8294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202342
20	NT_187140	ATG	2	6	8437	8442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202342
21	NT_187140	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202342
22	NT_187140	TGG	2	6	8489	8494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202342
23	NT_187140	GCA	2	6	8529	8534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202342
24	NT_187140	TTA	2	6	8544	8549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202342
25	NT_187140	GCT	2	6	8553	8558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202342
26	NT_187140	ATG	2	6	8560	8565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202342
27	NT_187140	AAT	3	9	9030	9038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202343
28	NT_187140	GTA	2	6	9065	9070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202343
29	NT_187140	AGC	2	6	9093	9098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202343
30	NT_187140	ACT	2	6	9274	9279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202343
31	NT_187140	AAG	2	6	9431	9436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202343
32	NT_187140	TAA	2	6	9462	9467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202343
33	NT_187140	TGC	2	6	9474	9479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202343
34	NT_187140	GCT	2	6	9484	9489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202343
35	NT_187140	ATT	2	6	9532	9537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202343
36	NT_187140	CTG	2	6	9620	9625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202343
37	NT_187140	TGC	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202343
38	NT_187140	ATA	2	6	9638	9643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202343
39	NT_187140	GAA	2	6	9676	9681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202343
40	NT_187140	TAA	2	6	9711	9716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202343
41	NT_187140	ATA	2	6	9758	9763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202343
42	NT_187140	GCT	3	9	9835	9843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202343
43	NT_187140	TGC	2	6	9885	9890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202343
44	NT_187140	AGC	3	9	9912	9920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202343
45	NT_187140	TAA	2	6	9959	9964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202343
46	NT_187140	AAG	2	6	10001	10006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202343
47	NT_187140	TAA	2	6	10077	10082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202343
48	NT_187140	GTT	2	6	10210	10215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202344
49	NT_187140	CTG	2	6	10238	10243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202344
50	NT_187140	TCT	2	6	10249	10254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202344
51	NT_187140	TAT	2	6	10320	10325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202344
52	NT_187140	TGC	3	9	10356	10364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202344
53	NT_187140	ATT	2	6	10395	10400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202344
54	NT_187140	AGC	2	6	10404	10409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202344
55	NT_187140	GCT	2	6	10450	10455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202344
56	NT_187140	CTT	2	6	10467	10472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202344
57	NT_187140	AGC	3	9	10509	10517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202344
58	NT_187140	CTG	2	6	10523	10528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202344
59	NT_187140	CTT	2	6	10538	10543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202344
60	NT_187140	GAA	2	6	10592	10597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202344
61	NT_187140	TGC	2	6	10632	10637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202344
62	NT_187140	CAG	2	6	10661	10666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202344
63	NT_187140	CTG	2	6	10709	10714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202344
64	NT_187140	TAG	2	6	10718	10723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202344
65	NT_187140	CTG	2	6	10724	10729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202344
66	NT_187140	GCA	2	6	10816	10821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202344
67	NT_187140	AGC	2	6	10848	10853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202344
68	NT_187140	GCT	2	6	10873	10878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202344
69	NT_187140	TAA	2	6	10916	10921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202344
70	NT_187140	ACT	2	6	10930	10935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202344
71	NT_187140	CTT	2	6	10983	10988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202344
72	NT_187140	TGT	2	6	10995	11000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202344
73	NT_187140	TAG	2	6	11003	11008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202344
74	NT_187140	ATT	3	9	11212	11220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202344
75	NT_187140	TCA	2	6	14235	14240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202345
76	NT_187140	TTG	2	6	14253	14258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202345
77	NT_187140	AAG	2	6	14289	14294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202345
78	NT_187140	TTC	2	6	14339	14344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202345
79	NT_187140	CTT	2	6	14359	14364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202345
80	NT_187140	ACT	2	6	14432	14437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202345
81	NT_187140	TAG	2	6	14441	14446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202345
82	NT_187140	TAA	2	6	14447	14452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202345
83	NT_187140	TTC	2	6	14585	14590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202346
84	NT_187140	TAG	2	6	14602	14607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202346
85	NT_187140	ATT	2	6	14648	14653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202346
86	NT_187140	TTA	2	6	14667	14672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202346
87	NT_187140	ATT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202346
88	NT_187140	ATT	2	6	14690	14695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202346
89	NT_187140	TTA	2	6	14739	14744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202346
90	NT_187140	TCT	2	6	14766	14771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202346
91	NT_187140	ATT	2	6	14849	14854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202346
92	NT_187140	CTT	2	6	14945	14950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202346
93	NT_187140	TCA	2	6	14955	14960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202346
94	NT_187140	AAT	3	9	16740	16748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202347
95	NT_187140	ACA	2	6	16960	16965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202347
96	NT_187140	AAG	2	6	16972	16977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202347
97	NT_187140	TTA	2	6	17039	17044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202347
98	NT_187140	AAG	2	6	17045	17050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202347
99	NT_187140	GTG	2	6	17090	17095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202347
100	NT_187140	TGC	2	6	17139	17144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202347
101	NT_187140	TTG	2	6	17180	17185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202347
102	NT_187140	TTG	2	6	17201	17206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202347
103	NT_187140	TAA	2	6	17213	17218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202347
104	NT_187140	AAG	2	6	17219	17224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202347
105	NT_187140	TGG	2	6	17313	17318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202347
106	NT_187140	GTG	2	6	17369	17374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202347
107	NT_187140	TGC	3	9	17394	17402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202347
108	NT_187140	ATG	2	6	17489	17494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202347
109	NT_187140	TGC	2	6	17532	17537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202347
110	NT_187140	CTG	2	6	17591	17596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202347
111	NT_187140	GAA	2	6	17598	17603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202347
112	NT_187140	GCA	3	9	17629	17637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202347
113	NT_187140	TAA	2	6	17666	17671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202347
114	NT_187140	AAG	2	6	17738	17743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202347
115	NT_187140	CAG	2	6	17750	17755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202347
116	NT_187140	CTA	2	6	17759	17764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202347
117	NT_187140	CAA	2	6	17777	17782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202347
118	NT_187140	TCA	2	6	17790	17795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202347
119	NT_187140	GAA	2	6	19453	19458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
120	NT_187140	AAG	2	6	19614	19619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
121	NT_187140	ATA	2	6	19658	19663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202348
122	NT_187140	CAA	2	6	19664	19669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202348
123	NT_187140	CAA	2	6	19721	19726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202348
124	NT_187140	AAG	2	6	19746	19751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
125	NT_187140	AGA	2	6	19768	19773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
126	NT_187140	AGA	2	6	19795	19800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
127	NT_187140	GAG	2	6	20030	20035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202348
128	NT_187140	GAA	2	6	20111	20116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
129	NT_187140	AAG	2	6	20133	20138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
130	NT_187140	AGA	2	6	20186	20191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202348
131	NT_187140	ACG	2	6	20230	20235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202348
132	NT_187140	TCT	3	9	20267	20275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202348
133	NT_187140	AAT	2	6	20281	20286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202348
134	NT_187140	AGT	2	6	20772	20777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202349
135	NT_187140	TTC	2	6	20800	20805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
136	NT_187140	TTC	2	6	21015	21020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
137	NT_187140	TCT	2	6	21046	21051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
138	NT_187140	TTA	2	6	21064	21069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202349
139	NT_187140	TTC	2	6	21205	21210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
140	NT_187140	CTT	2	6	21266	21271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	426202349
141	NT_187140	GTT	2	6	21339	21344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202349
142	NT_187140	GAT	2	6	21450	21455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202349
143	NT_187140	TGA	2	6	21679	21684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202349
144	NT_187140	TAA	2	6	21797	21802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202349

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.