MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1046T

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187139	ATG	2	6	82	87	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187139	AAG	2	6	89	94	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187139	TAA	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187139	GTA	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187139	GCT	2	6	1616	1621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187139	TAA	2	6	1739	1744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187139	AAT	2	6	1786	1791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187139	GAA	2	6	1845	1850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187139	GTT	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187139	GTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187139	TAA	2	6	1906	1911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187139	CTT	2	6	1921	1926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187139	TAA	2	6	1949	1954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187139	GAT	2	6	1963	1968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187139	ATT	2	6	1985	1990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187139	ATT	2	6	2172	2177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187139	ATG	2	6	2280	2285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187139	AAG	2	6	2287	2292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187139	ATT	2	6	2388	2393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187139	CTG	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187139	CAG	2	6	2448	2453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NT_187139	CAA	2	6	2454	2459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187139	CAT	2	6	2466	2471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187139	AGT	2	6	2557	2562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187139	ATT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187139	CAC	2	6	2604	2609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NT_187139	TGC	2	6	2665	2670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187139	GCT	2	6	2675	2680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187139	CTT	2	6	2683	2688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187139	AGC	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187139	GCC	2	6	2735	2740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NT_187139	ATT	3	9	2755	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187139	TAC	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187139	AGC	2	6	2902	2907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187139	CAC	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NT_187139	AGC	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187139	TAT	2	6	2992	2997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187139	ATG	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187139	ATG	2	6	3269	3274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187139	CTG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187139	AAG	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187139	TAA	2	6	3370	3375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187139	TAA	2	6	3480	3485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187139	AGG	2	6	3486	3491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187139	AGG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187139	GAA	2	6	4704	4709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187139	AAT	3	9	4722	4730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187139	TAA	2	6	4758	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187139	GGA	2	6	4765	4770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187139	CAA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187139	AAG	2	6	4877	4882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187139	TAC	2	6	4956	4961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187139	GTT	2	6	5083	5088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187139	GTT	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187139	GCT	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187139	AGT	2	6	5369	5374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187139	TAT	2	6	5375	5380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187139	CCT	2	6	5413	5418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NT_187139	TTA	2	6	5484	5489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187139	CTT	2	6	5554	5559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187139	TGC	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187139	CAT	2	6	5665	5670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187139	CAG	3	9	5671	5679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187139	ACC	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NT_187139	CCT	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NT_187139	GCA	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187139	AGC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187139	TGC	2	6	5858	5863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187139	ATT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187139	CAG	2	6	5899	5904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187139	CAG	2	6	5914	5919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NT_187139	AAT	2	6	5922	5927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187139	CAG	4	12	5947	5958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187139	ATC	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187139	CAG	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187139	CAG	2	6	6088	6093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NT_187139	AGC	2	6	6101	6106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187139	TAT	2	6	6167	6172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187139	TAT	2	6	6184	6189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187139	TTA	2	6	6264	6269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187139	ATG	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187139	TGC	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NT_187139	TAA	2	6	6460	6465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187139	GCA	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187139	GCT	2	6	6560	6565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187139	ATG	2	6	6582	6587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187139	GGT	2	6	6656	6661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187139	TGC	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187139	ATA	2	6	6707	6712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187139	CTA	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187139	AAG	2	6	6792	6797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187139	ACT	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187139	AAG	2	6	6857	6862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187139	TAA	2	6	6878	6883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187139	GTA	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187139	TAA	2	6	6988	6993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187139	AGG	2	6	6994	6999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187139	GAA	3	9	7015	7023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187139	AAT	3	9	7031	7039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187139	CAT	2	6	7060	7065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187139	TAA	2	6	7067	7072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187139	GGA	2	6	7074	7079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187139	AAG	2	6	7186	7191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187139	TGA	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187139	ATT	2	6	7421	7426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187139	TTA	2	6	7540	7545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187139	GTT	2	6	7568	7573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187139	GCT	2	6	7578	7583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187139	TTA	2	6	7682	7687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187139	GTA	2	6	7688	7693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187139	ATT	2	6	7851	7856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187139	AGC	2	6	7874	7879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187139	ACC	2	6	7901	7906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NT_187139	CCT	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NT_187139	CAG	2	6	7969	7974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NT_187139	CAG	2	6	7978	7983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187139	ATT	2	6	7985	7990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187139	TGC	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187139	CAG	2	6	8104	8109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NT_187139	ATC	2	6	8201	8206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187139	CAG	2	6	8320	8325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187139	GTA	3	9	8406	8414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187139	AAG	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187139	AGC	2	6	8570	8575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NT_187139	TGT	2	6	8654	8659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187139	TTG	2	6	8686	8691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187139	CTA	2	6	8729	8734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187139	TGA	2	6	8742	8747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187139	ATA	2	6	8777	8782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NT_187139	GAT	2	6	8791	8796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187139	GAA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187139	TTC	2	6	8858	8863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187139	GAA	2	6	8881	8886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187139	TGT	2	6	8892	8897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187139	ATA	2	6	8900	8905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187139	AGC	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187139	AGC	2	6	9113	9118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NT_187139	AAG	2	6	9220	9225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187139	CAG	2	6	9232	9237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187139	CAA	2	6	9259	9264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187139	AAT	2	6	9279	9284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187139	AGG	2	6	9390	9395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187139	GAA	2	6	9411	9416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187139	AAT	3	9	9429	9437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NT_187139	TGA	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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178	NT_187139	AGG	2	6	11401	11406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.