MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1029

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187138	CAAT	2	8	212	219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187138	TTAT	2	8	575	582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187138	ATAA	2	8	1461	1468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187138	GCTT	2	8	1662	1669	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NT_187138	CAAG	2	8	2029	2036	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NT_187138	ATTT	2	8	2742	2749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187138	ATTA	2	8	4070	4077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187138	ATAA	2	8	4311	4318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187138	TAAT	2	8	4361	4368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187138	GAAA	2	8	4430	4437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187138	ATTT	2	8	4460	4467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187138	AGTA	2	8	4549	4556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187138	AGTT	2	8	4713	4720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187138	AATA	2	8	5083	5090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187138	TTTC	2	8	5381	5388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NT_187138	CTAA	2	8	5677	5684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NT_187138	CAAT	2	8	6260	6267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187138	TAAA	2	8	7558	7565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187138	TATT	2	8	7713	7720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187138	GTAG	2	8	7806	7813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187138	AGTT	2	8	7846	7853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187138	AGGA	2	8	8281	8288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187138	AAAT	2	8	8642	8649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187138	GATA	2	8	8760	8767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187138	ATTA	2	8	8773	8780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187138	TTCT	2	8	8884	8891	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NT_187138	AGGT	2	8	9006	9013	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187138	CTAA	2	8	9179	9186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NT_187138	ATCA	2	8	9325	9332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NT_187138	TGAT	2	8	9477	9484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187138	CAAT	2	8	9762	9769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NT_187138	TTAA	2	8	10913	10920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187138	ATAA	2	8	11053	11060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187138	TAAA	2	8	11119	11126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187138	GAAG	2	8	11357	11364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187138	AAAG	2	8	11837	11844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187138	TAAA	2	8	12108	12115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187138	TTTA	2	8	12281	12288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187138	GAAA	2	8	12476	12483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187138	AAGA	2	8	12643	12650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187138	AAAG	2	8	14223	14230	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187138	AATC	2	8	14487	14494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187138	AATA	2	8	15766	15773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.