MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1029

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187138	TGT	2	6	71	76	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187138	TTA	2	6	248	253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187138	TCT	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187138	AGT	2	6	294	299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187138	AGT	2	6	403	408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187138	TCA	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187138	TAA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187138	CTT	2	6	483	488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187138	CTA	2	6	541	546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187138	AAT	2	6	592	597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187138	AAT	2	6	603	608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187138	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187138	TCT	2	6	686	691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187138	ATT	3	9	735	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187138	TAG	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187138	CTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NT_187138	ATA	2	6	810	815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187138	AGG	2	6	816	821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187138	AAT	3	9	849	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187138	TAA	2	6	885	890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187138	TGT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187138	AAG	2	6	1004	1009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187138	TGA	2	6	1032	1037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187138	CAA	2	6	1066	1071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187138	TTA	2	6	1211	1216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187138	AAG	2	6	1281	1286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187138	TGA	2	6	1294	1299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187138	TTA	2	6	1355	1360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187138	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187138	CAG	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187138	AGT	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187138	TAT	2	6	1479	1484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187138	ATA	2	6	1537	1542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187138	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187138	TGT	2	6	1572	1577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187138	TAC	2	6	1600	1605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187138	ATT	2	6	1606	1611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187138	TAA	2	6	1739	1744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187138	TAA	2	6	1776	1781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187138	TAA	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187138	TAT	2	6	2015	2020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187138	TGA	2	6	2084	2089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187138	CAG	2	6	2107	2112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NT_187138	ACA	2	6	2246	2251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202329
45	NT_187138	AAT	2	6	2364	2369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202329
46	NT_187138	AGA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202329
47	NT_187138	AGA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202329
48	NT_187138	ATT	2	6	2726	2731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202329
49	NT_187138	ATT	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187138	ATT	2	6	2781	2786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187138	TAG	2	6	2838	2843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187138	GTT	2	6	2848	2853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187138	TTA	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187138	AAT	2	6	2994	2999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202330
55	NT_187138	TAA	2	6	3000	3005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202330
56	NT_187138	ATG	3	9	3022	3030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202330
57	NT_187138	GTT	2	6	3034	3039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202330
58	NT_187138	ACA	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202330
59	NT_187138	GCA	3	9	3088	3096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
60	NT_187138	GAA	2	6	3107	3112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
61	NT_187138	AGA	2	6	3221	3226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
62	NT_187138	GGT	2	6	3256	3261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202330
63	NT_187138	AGA	2	6	3288	3293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
64	NT_187138	ACT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202330
65	NT_187138	TGA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202330
66	NT_187138	AGT	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202330
67	NT_187138	CAA	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202330
68	NT_187138	TGA	2	6	3480	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202330
69	NT_187138	GCA	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
70	NT_187138	ACA	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202330
71	NT_187138	ATA	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202330
72	NT_187138	GCA	2	6	3640	3645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
73	NT_187138	CAT	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202330
74	NT_187138	AAG	2	6	3719	3724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
75	NT_187138	AGC	2	6	3741	3746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
76	NT_187138	AGG	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202330
77	NT_187138	AGC	3	9	3825	3833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
78	NT_187138	AGG	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202330
79	NT_187138	ATA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202330
80	NT_187138	AGC	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
81	NT_187138	GCA	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
82	NT_187138	TTA	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202330
83	NT_187138	AGA	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
84	NT_187138	AAG	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
85	NT_187138	TTG	2	6	4133	4138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NT_187138	AAG	2	6	4150	4155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187138	TTA	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187138	TTA	2	6	4171	4176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187138	GCA	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187138	AAT	3	9	4450	4458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187138	CAG	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187138	AAG	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187138	ATA	2	6	4698	4703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187138	CTG	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187138	GGT	2	6	4946	4951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187138	GTT	2	6	4987	4992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187138	CAA	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NT_187138	AGT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187138	TTA	2	6	5116	5121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187138	AAT	2	6	5277	5282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187138	TAA	2	6	5283	5288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187138	CTT	2	6	5323	5328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187138	TTG	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187138	ACT	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187138	AGC	2	6	5605	5610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NT_187138	AAC	2	6	5660	5665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NT_187138	AAG	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187138	TGC	2	6	5751	5756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187138	TAT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187138	ATT	2	6	5800	5805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187138	AGC	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187138	TAC	2	6	5877	5882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187138	AAT	2	6	5979	5984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187138	GCT	2	6	6007	6012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NT_187138	TAA	3	9	6066	6074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187138	TGC	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187138	TAG	2	6	6113	6118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187138	TGT	2	6	6123	6128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187138	GGT	2	6	6148	6153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187138	TGC	2	6	6162	6167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187138	AGC	3	9	6192	6200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187138	ACT	3	9	6313	6321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187138	AAT	2	6	6379	6384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187138	ATA	2	6	6389	6394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187138	TAA	2	6	6466	6471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187138	TAA	3	9	6499	6507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202331
127	NT_187138	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202331
128	NT_187138	TTA	2	6	6799	6804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202331
129	NT_187138	GCA	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
130	NT_187138	AGC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
131	NT_187138	CTG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202331
132	NT_187138	CTG	2	6	6910	6915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202331
133	NT_187138	TTG	2	6	6958	6963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202331
134	NT_187138	CTA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202331
135	NT_187138	CAG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
136	NT_187138	GAT	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202331
137	NT_187138	GTT	2	6	7037	7042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202331
138	NT_187138	GAT	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202331
139	NT_187138	AGA	2	6	7067	7072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202331
140	NT_187138	GCA	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
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276	NT_187138	TTA	2	6	14187	14192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NT_187138	TTG	2	6	14301	14306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NT_187138	GAA	2	6	14324	14329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NT_187138	GCA	2	6	14339	14344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NT_187138	GTG	2	6	14370	14375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NT_187138	TAA	2	6	14419	14424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NT_187138	TAA	2	6	14457	14462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NT_187138	GAT	3	9	14595	14603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202333
284	NT_187138	GAA	2	6	14848	14853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202333
285	NT_187138	GTT	2	6	14865	14870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202333
286	NT_187138	AAT	2	6	15010	15015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202333
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289	NT_187138	GAA	2	6	15151	15156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202333
290	NT_187138	AAG	2	6	15217	15222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202334
291	NT_187138	AAT	2	6	15298	15303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202334
292	NT_187138	GAT	2	6	15389	15394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202334
293	NT_187138	TAA	2	6	15409	15414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202334
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298	NT_187138	GTT	2	6	15530	15535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202334
299	NT_187138	TGT	2	6	15555	15560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202334
300	NT_187138	AGA	2	6	15594	15599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NT_187138	TAA	2	6	15811	15816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.