MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1029

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187138	ACA	2	6	2246	2251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202329
2	NT_187138	AAT	2	6	2364	2369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202329
3	NT_187138	AGA	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202329
4	NT_187138	AGA	2	6	2426	2431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202329
5	NT_187138	ATT	2	6	2726	2731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202329
6	NT_187138	AAT	2	6	2994	2999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202330
7	NT_187138	TAA	2	6	3000	3005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202330
8	NT_187138	ATG	3	9	3022	3030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202330
9	NT_187138	GTT	2	6	3034	3039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202330
10	NT_187138	ACA	2	6	3057	3062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202330
11	NT_187138	GCA	3	9	3088	3096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
12	NT_187138	GAA	2	6	3107	3112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
13	NT_187138	AGA	2	6	3221	3226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
14	NT_187138	GGT	2	6	3256	3261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202330
15	NT_187138	AGA	2	6	3288	3293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
16	NT_187138	ACT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202330
17	NT_187138	TGA	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202330
18	NT_187138	AGT	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202330
19	NT_187138	CAA	2	6	3460	3465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202330
20	NT_187138	TGA	2	6	3480	3485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202330
21	NT_187138	GCA	2	6	3529	3534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
22	NT_187138	ACA	2	6	3571	3576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	426202330
23	NT_187138	ATA	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202330
24	NT_187138	GCA	2	6	3640	3645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
25	NT_187138	CAT	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202330
26	NT_187138	AAG	2	6	3719	3724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
27	NT_187138	AGC	2	6	3741	3746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
28	NT_187138	AGG	2	6	3783	3788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202330
29	NT_187138	AGC	3	9	3825	3833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
30	NT_187138	AGG	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202330
31	NT_187138	ATA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202330
32	NT_187138	AGC	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
33	NT_187138	GCA	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202330
34	NT_187138	TTA	2	6	3946	3951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202330
35	NT_187138	AGA	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
36	NT_187138	AAG	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202330
37	NT_187138	TAA	3	9	6499	6507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202331
38	NT_187138	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202331
39	NT_187138	TTA	2	6	6799	6804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202331
40	NT_187138	GCA	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
41	NT_187138	AGC	2	6	6842	6847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
42	NT_187138	CTG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202331
43	NT_187138	CTG	2	6	6910	6915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202331
44	NT_187138	TTG	2	6	6958	6963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202331
45	NT_187138	CTA	2	6	6997	7002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202331
46	NT_187138	CAG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
47	NT_187138	GAT	2	6	7014	7019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202331
48	NT_187138	GTT	2	6	7037	7042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202331
49	NT_187138	GAT	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202331
50	NT_187138	AGA	2	6	7067	7072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202331
51	NT_187138	GCA	2	6	7197	7202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
52	NT_187138	AAG	2	6	7257	7262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202331
53	NT_187138	AGC	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
54	NT_187138	AGC	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	426202331
55	NT_187138	AAT	3	9	10007	10015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202332
56	NT_187138	TAG	2	6	10033	10038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202332
57	NT_187138	CAT	2	6	10129	10134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	426202332
58	NT_187138	TAA	2	6	10247	10252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202332
59	NT_187138	GTT	2	6	10431	10436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202332
60	NT_187138	TAG	2	6	10474	10479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202332
61	NT_187138	GTA	2	6	10482	10487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202332
62	NT_187138	ATG	2	6	10555	10560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202332
63	NT_187138	GTT	2	6	10571	10576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202332
64	NT_187138	TGC	2	6	10595	10600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202332
65	NT_187138	AAT	2	6	10605	10610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202332
66	NT_187138	AGG	2	6	10631	10636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	426202332
67	NT_187138	GGT	2	6	10662	10667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	426202332
68	NT_187138	TAG	2	6	10679	10684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202332
69	NT_187138	TGC	3	9	10697	10705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	426202332
70	NT_187138	AAG	2	6	10801	10806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202332
71	NT_187138	TAA	2	6	10868	10873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202332
72	NT_187138	GAT	3	9	14595	14603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202333
73	NT_187138	GAA	2	6	14848	14853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202333
74	NT_187138	GTT	2	6	14865	14870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202333
75	NT_187138	AAT	2	6	15010	15015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202333
76	NT_187138	CCA	2	6	15052	15057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	426202333
77	NT_187138	AAT	2	6	15082	15087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202333
78	NT_187138	GAA	2	6	15151	15156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202333
79	NT_187138	AAG	2	6	15217	15222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	426202334
80	NT_187138	AAT	2	6	15298	15303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202334
81	NT_187138	GAT	2	6	15389	15394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202334
82	NT_187138	TAA	2	6	15409	15414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202334
83	NT_187138	ATG	2	6	15423	15428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202334
84	NT_187138	ATT	3	9	15429	15437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	426202334
85	NT_187138	TGA	2	6	15459	15464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	426202334
86	NT_187138	ATA	2	6	15465	15470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	426202334
87	NT_187138	GTT	2	6	15530	15535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202334
88	NT_187138	TGT	2	6	15555	15560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	426202334

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.