MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1025rc

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187136	CTTA	2	8	87	94	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187136	TTTA	2	8	712	719	25 %	75 %	0 %	0 %	426202318
3	NT_187136	GAAA	2	8	906	913	75 %	0 %	25 %	0 %	426202318
4	NT_187136	AGGG	2	8	1107	1114	25 %	0 %	75 %	0 %	426202318
5	NT_187136	TAAC	2	8	1321	1328	50 %	25 %	0 %	25 %	426202318
6	NT_187136	AATA	2	8	1334	1341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187136	TTAA	2	8	1367	1374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187136	ATAA	2	8	1508	1515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187136	TAAT	2	8	1558	1565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187136	GAAA	2	8	1624	1631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187136	ATTT	2	8	1654	1661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187136	AGTA	2	8	1743	1750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187136	GAAA	2	8	1842	1849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187136	AGTT	2	8	1908	1915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187136	TTAA	2	8	2355	2362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187136	TTAG	2	8	2399	2406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187136	TAGG	2	8	2598	2605	25 %	25 %	50 %	0 %	426202319
18	NT_187136	AAGT	2	8	3541	3548	50 %	25 %	25 %	0 %	426202319
19	NT_187136	TAAC	2	8	4322	4329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NT_187136	AATA	2	8	4335	4342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187136	TTAA	2	8	4368	4375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187136	ATAA	2	8	4509	4516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187136	TAAT	2	8	4559	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187136	AATC	2	8	5898	5905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NT_187136	GGGA	2	8	6055	6062	25 %	0 %	75 %	0 %	426202320
26	NT_187136	AGAA	2	8	6203	6210	75 %	0 %	25 %	0 %	426202320
27	NT_187136	AAAG	2	8	6294	6301	75 %	0 %	25 %	0 %	426202320
28	NT_187136	TGCT	2	8	6367	6374	0 %	50 %	25 %	25 %	426202320
29	NT_187136	TAAG	2	8	7690	7697	50 %	25 %	25 %	0 %	426202322
30	NT_187136	TAAT	2	8	7897	7904	50 %	50 %	0 %	0 %	426202323
31	NT_187136	GTAT	2	8	8053	8060	25 %	50 %	25 %	0 %	426202323
32	NT_187136	CAAG	2	8	8293	8300	50 %	0 %	25 %	25 %	426202323
33	NT_187136	AGAA	2	8	8537	8544	75 %	0 %	25 %	0 %	426202323
34	NT_187136	ATTT	2	8	8559	8566	25 %	75 %	0 %	0 %	426202323

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.