MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH clone fragment 1025rc

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187136	CTTA	2	8	87	94	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187136	AATA	2	8	1334	1341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187136	TTAA	2	8	1367	1374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187136	ATAA	2	8	1508	1515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187136	TAAT	2	8	1558	1565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187136	GAAA	2	8	1624	1631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187136	ATTT	2	8	1654	1661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187136	AGTA	2	8	1743	1750	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187136	GAAA	2	8	1842	1849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187136	AGTT	2	8	1908	1915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187136	TTAA	2	8	2355	2362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187136	TTAG	2	8	2399	2406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187136	TAAC	2	8	4322	4329	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NT_187136	AATA	2	8	4335	4342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187136	TTAA	2	8	4368	4375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187136	ATAA	2	8	4509	4516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187136	TAAT	2	8	4559	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187136	AATC	2	8	5898	5905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.