MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187135	AATCCG	2	12	358	369	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248366
2	NT_187135	TGGCCA	2	12	1157	1168	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248366
3	NT_187135	TTACTT	2	12	4446	4457	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409248374
4	NT_187135	ACTGTT	2	12	4713	4724	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409248375
5	NT_187135	CGGAAA	2	12	5371	5382	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NT_187135	CAGGGC	2	12	9791	9802	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248381
7	NT_187135	GATATT	2	12	10665	10676	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409248382
8	NT_187135	TTTGAG	2	12	11583	11594	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	409248383
9	NT_187135	TTAAAT	2	12	11952	11963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187135	GTGCCG	2	12	12658	12669	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248386
11	NT_187135	TTCAGC	2	12	18287	18298	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248394
12	NT_187135	CTCATT	2	12	22208	22219	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409248398
13	NT_187135	ATGCTC	2	12	23000	23011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248398
14	NT_187135	GGTATA	2	12	29864	29875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248398
15	NT_187135	CCTGGT	2	12	39909	39920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248399
16	NT_187135	CGGCGT	2	12	43953	43964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248403
17	NT_187135	AGTAGC	2	12	44608	44619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248404
18	NT_187135	ACAGTG	2	12	45831	45842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409248405
19	NT_187135	GACAGC	2	12	45843	45854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248405
20	NT_187135	TTTTTC	2	12	48511	48522	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	409248409
21	NT_187135	CAAAAT	2	12	48870	48881	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NT_187135	AAGGAT	2	12	56319	56330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187135	CCTGCT	2	12	56559	56570	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409248424
24	NT_187135	TCGTGG	2	12	60074	60085	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409248436
25	NT_187135	GGCGCT	2	12	60444	60455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248436
26	NT_187135	CAGGTG	2	12	60475	60486	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248436
27	NT_187135	GCAGAA	2	12	64193	64204	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409248440
28	NT_187135	GGCCGT	2	12	65260	65271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NT_187135	GCTGAG	2	12	65923	65934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248444
30	NT_187135	GGCCTC	2	12	66443	66454	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248445
31	NT_187135	ATCGAA	2	12	70409	70420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409248451
32	NT_187135	AAACGG	2	12	74602	74613	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409248454
33	NT_187135	GGTGAT	2	12	75644	75655	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	409248454
34	NT_187135	TTCGCT	2	12	80438	80449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	409248456

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.