MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 233

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187135	AGTG	2	8	34	41	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187135	TGGC	2	8	72	79	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187135	GCAG	2	8	303	310	25 %	0 %	50 %	25 %	409248366
4	NT_187135	TGAC	2	8	314	321	25 %	25 %	25 %	25 %	409248366
5	NT_187135	CGTT	3	12	473	484	0 %	50 %	25 %	25 %	409248366
6	NT_187135	TACC	2	8	708	715	25 %	25 %	0 %	50 %	409248366
7	NT_187135	CCGA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	409248366
8	NT_187135	CTCG	2	8	786	793	0 %	25 %	25 %	50 %	409248366
9	NT_187135	TAAA	2	8	1500	1507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187135	GCCC	2	8	1550	1557	0 %	0 %	25 %	75 %	409248368
11	NT_187135	ATCC	2	8	1970	1977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NT_187135	TCCG	2	8	2547	2554	0 %	25 %	25 %	50 %	409248369
13	NT_187135	TAAA	2	8	3131	3138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187135	TCTT	2	8	3196	3203	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NT_187135	TTTA	2	8	4018	4025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187135	ATGA	2	8	4043	4050	50 %	25 %	25 %	0 %	409248373
17	NT_187135	GAAA	2	8	4394	4401	75 %	0 %	25 %	0 %	409248374
18	NT_187135	AAAT	2	8	4755	4762	75 %	25 %	0 %	0 %	409248375
19	NT_187135	TCAT	2	8	4966	4973	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NT_187135	CAGG	2	8	5052	5059	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187135	TGAA	2	8	5170	5177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187135	AATC	2	8	5283	5290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NT_187135	GAAA	2	8	5306	5313	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187135	ATTA	2	8	5409	5416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187135	GTTT	2	8	5417	5424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187135	AGGC	2	8	5503	5510	25 %	0 %	50 %	25 %	409248377
27	NT_187135	GCTG	2	8	5822	5829	0 %	25 %	50 %	25 %	409248377
28	NT_187135	GGCT	2	8	5968	5975	0 %	25 %	50 %	25 %	409248377
29	NT_187135	GTGA	2	8	6431	6438	25 %	25 %	50 %	0 %	409248377
30	NT_187135	TCAG	2	8	6489	6496	25 %	25 %	25 %	25 %	409248378
31	NT_187135	GGCT	2	8	6632	6639	0 %	25 %	50 %	25 %	409248378
32	NT_187135	GCTT	2	8	6949	6956	0 %	50 %	25 %	25 %	409248379
33	NT_187135	GGCA	2	8	7550	7557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NT_187135	TTAC	2	8	7886	7893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NT_187135	GAGC	2	8	8357	8364	25 %	0 %	50 %	25 %	409248381
36	NT_187135	GAGG	2	8	8900	8907	25 %	0 %	75 %	0 %	409248381
37	NT_187135	TCTG	2	8	9010	9017	0 %	50 %	25 %	25 %	409248381
38	NT_187135	ATGC	2	8	9473	9480	25 %	25 %	25 %	25 %	409248381
39	NT_187135	GTAA	2	8	9884	9891	50 %	25 %	25 %	0 %	409248381
40	NT_187135	TTTA	2	8	10171	10178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187135	ATTA	2	8	10302	10309	50 %	50 %	0 %	0 %	409248382
42	NT_187135	GCTG	2	8	10481	10488	0 %	25 %	50 %	25 %	409248382
43	NT_187135	AATA	2	8	10608	10615	75 %	25 %	0 %	0 %	409248382
44	NT_187135	TATG	2	8	10943	10950	25 %	50 %	25 %	0 %	409248382
45	NT_187135	ATCA	2	8	12201	12208	50 %	25 %	0 %	25 %	409248385
46	NT_187135	GCAG	2	8	12952	12959	25 %	0 %	50 %	25 %	409248386
47	NT_187135	CGGC	2	8	13164	13171	0 %	0 %	50 %	50 %	409248386
48	NT_187135	CAGC	2	8	13220	13227	25 %	0 %	25 %	50 %	409248386
49	NT_187135	GACG	2	8	13389	13396	25 %	0 %	50 %	25 %	409248386
50	NT_187135	GCGT	2	8	13397	13404	0 %	25 %	50 %	25 %	409248386
51	NT_187135	CCTG	2	8	13502	13509	0 %	25 %	25 %	50 %	409248387
52	NT_187135	AAAT	2	8	14023	14030	75 %	25 %	0 %	0 %	409248388
53	NT_187135	TGAT	2	8	14059	14066	25 %	50 %	25 %	0 %	409248388
54	NT_187135	TGAG	2	8	14122	14129	25 %	25 %	50 %	0 %	409248388
55	NT_187135	GATG	2	8	14243	14250	25 %	25 %	50 %	0 %	409248388
56	NT_187135	ATTT	2	8	15029	15036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187135	ATAA	2	8	15096	15103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187135	CAGC	2	8	16076	16083	25 %	0 %	25 %	50 %	409248391
59	NT_187135	ACCC	2	8	16253	16260	25 %	0 %	0 %	75 %	409248391
60	NT_187135	GACG	2	8	16737	16744	25 %	0 %	50 %	25 %	409248392
61	NT_187135	GTCT	2	8	17030	17037	0 %	50 %	25 %	25 %	409248393
62	NT_187135	CTAT	2	8	17084	17091	25 %	50 %	0 %	25 %	409248393
63	NT_187135	AAAG	2	8	17453	17460	75 %	0 %	25 %	0 %	409248393
64	NT_187135	TCAA	2	8	17529	17536	50 %	25 %	0 %	25 %	409248393
65	NT_187135	TTCA	2	8	17848	17855	25 %	50 %	0 %	25 %	409248394
66	NT_187135	AATA	2	8	18303	18310	75 %	25 %	0 %	0 %	409248394
67	NT_187135	CTGC	2	8	18402	18409	0 %	25 %	25 %	50 %	409248394
68	NT_187135	GATT	2	8	18845	18852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187135	AGGT	2	8	19020	19027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187135	ACTT	2	8	20034	20041	25 %	50 %	0 %	25 %	409248397
71	NT_187135	GCCA	2	8	20624	20631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NT_187135	TTAC	2	8	20775	20782	25 %	50 %	0 %	25 %	409248398
73	NT_187135	CAGC	2	8	21247	21254	25 %	0 %	25 %	50 %	409248398
74	NT_187135	GACT	2	8	21537	21544	25 %	25 %	25 %	25 %	409248398
75	NT_187135	GAAT	2	8	21588	21595	50 %	25 %	25 %	0 %	409248398
76	NT_187135	TGGC	2	8	21748	21755	0 %	25 %	50 %	25 %	409248398
77	NT_187135	ACCA	2	8	21916	21923	50 %	0 %	0 %	50 %	409248398
78	NT_187135	ACTG	2	8	22337	22344	25 %	25 %	25 %	25 %	409248398
79	NT_187135	CAAA	2	8	22435	22442	75 %	0 %	0 %	25 %	409248398
80	NT_187135	TCCT	2	8	22769	22776	0 %	50 %	0 %	50 %	409248398
81	NT_187135	TGAA	2	8	23040	23047	50 %	25 %	25 %	0 %	409248398
82	NT_187135	GGTT	2	8	23048	23055	0 %	50 %	50 %	0 %	409248398
83	NT_187135	AACC	2	8	23212	23219	50 %	0 %	0 %	50 %	409248398
84	NT_187135	TTTG	2	8	23225	23232	0 %	75 %	25 %	0 %	409248398
85	NT_187135	AGCA	2	8	23861	23868	50 %	0 %	25 %	25 %	409248398
86	NT_187135	GTAA	2	8	24542	24549	50 %	25 %	25 %	0 %	409248398
87	NT_187135	AAAC	2	8	25154	25161	75 %	0 %	0 %	25 %	409248398
88	NT_187135	AGCA	2	8	25661	25668	50 %	0 %	25 %	25 %	409248398
89	NT_187135	CCAG	2	8	26733	26740	25 %	0 %	25 %	50 %	409248398
90	NT_187135	GAAT	2	8	26964	26971	50 %	25 %	25 %	0 %	409248398
91	NT_187135	TTGA	2	8	27996	28003	25 %	50 %	25 %	0 %	409248398
92	NT_187135	AGCA	2	8	28502	28509	50 %	0 %	25 %	25 %	409248398
93	NT_187135	GTTT	2	8	29299	29306	0 %	75 %	25 %	0 %	409248398
94	NT_187135	CCAG	2	8	29910	29917	25 %	0 %	25 %	50 %	409248398
95	NT_187135	CCTT	2	8	30408	30415	0 %	50 %	0 %	50 %	409248398
96	NT_187135	TTTA	2	8	31511	31518	25 %	75 %	0 %	0 %	409248398
97	NT_187135	TGAC	2	8	32471	32478	25 %	25 %	25 %	25 %	409248398
98	NT_187135	CAAC	2	8	32782	32789	50 %	0 %	0 %	50 %	409248398
99	NT_187135	GCTT	2	8	33081	33088	0 %	50 %	25 %	25 %	409248398
100	NT_187135	ATTA	2	8	33386	33393	50 %	50 %	0 %	0 %	409248398
101	NT_187135	TAGC	2	8	33517	33524	25 %	25 %	25 %	25 %	409248398
102	NT_187135	GAAA	2	8	33770	33777	75 %	0 %	25 %	0 %	409248398
103	NT_187135	CTCG	2	8	33790	33797	0 %	25 %	25 %	50 %	409248398
104	NT_187135	GATA	2	8	33802	33809	50 %	25 %	25 %	0 %	409248398
105	NT_187135	ATTG	2	8	34031	34038	25 %	50 %	25 %	0 %	409248399
106	NT_187135	CAGC	2	8	34621	34628	25 %	0 %	25 %	50 %	409248399
107	NT_187135	TGCA	2	8	34958	34965	25 %	25 %	25 %	25 %	409248399
108	NT_187135	AGAT	2	8	35483	35490	50 %	25 %	25 %	0 %	409248399
109	NT_187135	TGAG	2	8	35495	35502	25 %	25 %	50 %	0 %	409248399
110	NT_187135	AGCT	2	8	35710	35717	25 %	25 %	25 %	25 %	409248399
111	NT_187135	TGAT	2	8	35959	35966	25 %	50 %	25 %	0 %	409248399
112	NT_187135	ATTT	2	8	36430	36437	25 %	75 %	0 %	0 %	409248399
113	NT_187135	TATC	2	8	36480	36487	25 %	50 %	0 %	25 %	409248399
114	NT_187135	CCAA	2	8	36755	36762	50 %	0 %	0 %	50 %	409248399
115	NT_187135	TGGT	2	8	37293	37300	0 %	50 %	50 %	0 %	409248399
116	NT_187135	GTTT	2	8	37758	37765	0 %	75 %	25 %	0 %	409248399
117	NT_187135	CAAT	2	8	38907	38914	50 %	25 %	0 %	25 %	409248399
118	NT_187135	TAAG	2	8	39005	39012	50 %	25 %	25 %	0 %	409248399
119	NT_187135	ATTG	2	8	39163	39170	25 %	50 %	25 %	0 %	409248399
120	NT_187135	TCGG	2	8	39840	39847	0 %	25 %	50 %	25 %	409248399
121	NT_187135	CCAG	2	8	39881	39888	25 %	0 %	25 %	50 %	409248399
122	NT_187135	CTTG	2	8	39999	40006	0 %	50 %	25 %	25 %	409248399
123	NT_187135	CTCA	2	8	40582	40589	25 %	25 %	0 %	50 %	409248399
124	NT_187135	CAGG	2	8	40758	40765	25 %	0 %	50 %	25 %	409248399
125	NT_187135	TATT	2	8	40925	40932	25 %	75 %	0 %	0 %	409248399
126	NT_187135	AATA	2	8	41323	41330	75 %	25 %	0 %	0 %	409248399
127	NT_187135	ATTG	2	8	41450	41457	25 %	50 %	25 %	0 %	409248399
128	NT_187135	ATTT	2	8	41493	41500	25 %	75 %	0 %	0 %	409248399
129	NT_187135	ATTC	2	8	42004	42011	25 %	50 %	0 %	25 %	409248399
130	NT_187135	CGCT	2	8	42640	42647	0 %	25 %	25 %	50 %	409248400
131	NT_187135	TATC	2	8	43059	43066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NT_187135	CCAT	2	8	43392	43399	25 %	25 %	0 %	50 %	409248402
133	NT_187135	GAAA	2	8	43697	43704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187135	TATG	2	8	43716	43723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187135	GTTT	2	8	43759	43766	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187135	CAAA	2	8	43769	43776	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NT_187135	TCGG	2	8	44236	44243	0 %	25 %	50 %	25 %	409248403
138	NT_187135	GCCT	2	8	44499	44506	0 %	25 %	25 %	50 %	409248404
139	NT_187135	GCAG	2	8	45694	45701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NT_187135	AGTC	2	8	46653	46660	25 %	25 %	25 %	25 %	409248408
141	NT_187135	GCGG	2	8	46955	46962	0 %	0 %	75 %	25 %	409248408
142	NT_187135	ACCG	2	8	47142	47149	25 %	0 %	25 %	50 %	409248408
143	NT_187135	GCCT	2	8	47862	47869	0 %	25 %	25 %	50 %	409248409
144	NT_187135	TGCC	2	8	48080	48087	0 %	25 %	25 %	50 %	409248409
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233	NT_187135	AAAG	2	8	81863	81870	75 %	0 %	25 %	0 %	409248458

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.