MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187135	GGT	2	6	90	95	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187135	TGA	2	6	109	114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187135	TCT	2	6	154	159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187135	CCA	2	6	210	215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187135	CGC	2	6	377	382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248366
6	NT_187135	GCC	2	6	507	512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248366
7	NT_187135	TGC	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248366
8	NT_187135	CGT	2	6	523	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248366
9	NT_187135	GCT	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248366
10	NT_187135	TGT	2	6	810	815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248366
11	NT_187135	GCC	2	6	817	822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248366
12	NT_187135	CGC	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248366
13	NT_187135	CAG	2	6	850	855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248366
14	NT_187135	GCG	2	6	984	989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248366
15	NT_187135	CAG	2	6	1033	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248366
16	NT_187135	CGG	2	6	1071	1076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248366
17	NT_187135	GCG	2	6	1104	1109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248366
18	NT_187135	ATG	3	9	1123	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248366
19	NT_187135	CCA	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NT_187135	GGA	2	6	1214	1219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248367
21	NT_187135	GCC	2	6	1242	1247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248367
22	NT_187135	TTC	2	6	1270	1275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248367
23	NT_187135	CTG	2	6	1296	1301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248367
24	NT_187135	CTT	2	6	1469	1474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NT_187135	TCA	2	6	1516	1521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187135	ACA	2	6	1645	1650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248368
27	NT_187135	CAC	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248368
28	NT_187135	GCC	3	9	1719	1727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248368
29	NT_187135	ATG	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248368
30	NT_187135	ATG	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248368
31	NT_187135	CAG	2	6	1851	1856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248368
32	NT_187135	CGC	2	6	1898	1903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NT_187135	CAG	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187135	AGC	2	6	2013	2018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187135	ATA	2	6	2158	2163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187135	TAT	2	6	2175	2180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187135	ATG	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187135	GAC	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248369
39	NT_187135	GCC	2	6	2354	2359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248369
40	NT_187135	GCG	2	6	2418	2423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248369
41	NT_187135	GCG	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248369
42	NT_187135	CGA	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248369
43	NT_187135	CGG	2	6	2842	2847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248369
44	NT_187135	TAT	2	6	2962	2967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187135	TAA	2	6	3166	3171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187135	GGC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248370
47	NT_187135	ATT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248370
48	NT_187135	CAT	2	6	3462	3467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248370
49	NT_187135	GAT	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248370
50	NT_187135	ATC	2	6	3582	3587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NT_187135	AGC	2	6	3629	3634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248371
52	NT_187135	AGC	2	6	3672	3677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248371
53	NT_187135	GAA	2	6	3685	3690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248371
54	NT_187135	GCA	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248371
55	NT_187135	AAT	2	6	3742	3747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248372
56	NT_187135	CGT	2	6	3751	3756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248372
57	NT_187135	TAA	2	6	3777	3782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248372
58	NT_187135	GCA	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248372
59	NT_187135	GAT	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248372
60	NT_187135	ATA	2	6	3842	3847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248372
61	NT_187135	TAT	2	6	3986	3991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187135	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248373
63	NT_187135	ATA	2	6	4107	4112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248373
64	NT_187135	TGT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248373
65	NT_187135	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248373
66	NT_187135	ATA	2	6	4485	4490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248374
67	NT_187135	TAA	2	6	4525	4530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187135	TTC	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187135	TTG	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248375
70	NT_187135	CGT	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248376
71	NT_187135	GAA	2	6	4893	4898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248376
72	NT_187135	TTA	2	6	4916	4921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248376
73	NT_187135	TCA	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187135	GAA	2	6	4936	4941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187135	CTT	2	6	4948	4953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187135	ATT	2	6	5025	5030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187135	AAC	2	6	5060	5065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187135	GCA	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187135	TCT	2	6	5154	5159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187135	AAT	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187135	ACA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187135	CAT	2	6	5462	5467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248377
83	NT_187135	GGC	2	6	5568	5573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248377
84	NT_187135	GTT	2	6	5745	5750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248377
85	NT_187135	GGC	2	6	5753	5758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248377
86	NT_187135	GAC	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
87	NT_187135	GAA	2	6	5793	5798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248377
88	NT_187135	GAC	2	6	5876	5881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
89	NT_187135	TTG	2	6	5941	5946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248377
90	NT_187135	GAA	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248377
91	NT_187135	GGC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248377
92	NT_187135	GCA	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
93	NT_187135	GCA	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
94	NT_187135	GAC	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
95	NT_187135	AGC	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248377
96	NT_187135	GGA	2	6	6185	6190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248377
97	NT_187135	CTG	2	6	6195	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248377
98	NT_187135	CTG	2	6	6258	6263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248377
99	NT_187135	GTT	2	6	6308	6313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248377
100	NT_187135	TGA	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248377
101	NT_187135	TCT	2	6	6384	6389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248377
102	NT_187135	GTC	2	6	6390	6395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248377
103	NT_187135	TGA	3	9	6436	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187135	GCG	2	6	6464	6469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187135	GGT	2	6	6538	6543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248378
106	NT_187135	AGC	2	6	6608	6613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248378
107	NT_187135	TCA	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248378
108	NT_187135	TTC	2	6	6714	6719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248378
109	NT_187135	TCA	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248379
110	NT_187135	GCA	2	6	6999	7004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248379
111	NT_187135	ATT	2	6	7171	7176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248379
112	NT_187135	AGA	2	6	7232	7237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248379
113	NT_187135	CAC	2	6	7450	7455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248379
114	NT_187135	AAG	2	6	7478	7483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187135	TGA	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187135	GAT	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187135	ACG	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NT_187135	AAT	2	6	7731	7736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187135	TAA	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187135	CAT	2	6	7760	7765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187135	TAT	2	6	7795	7800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187135	ATA	2	6	7826	7831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187135	ATT	2	6	7921	7926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187135	GAA	2	6	7944	7949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187135	ATC	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187135	TCA	2	6	8073	8078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NT_187135	ATT	2	6	8273	8278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248381
128	NT_187135	TGC	2	6	8296	8301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248381
129	NT_187135	CAG	2	6	8493	8498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248381
130	NT_187135	GAA	2	6	9066	9071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248381
131	NT_187135	CAT	2	6	9191	9196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248381
132	NT_187135	GAT	2	6	9233	9238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248381
133	NT_187135	GTT	2	6	9322	9327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248381
134	NT_187135	TAT	2	6	9328	9333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248381
135	NT_187135	CTG	2	6	9404	9409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248381
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141	NT_187135	TAA	2	6	9855	9860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248381
142	NT_187135	TGG	2	6	10113	10118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187135	ATT	2	6	10185	10190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NT_187135	GGA	2	6	18858	18863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
243	NT_187135	TGA	2	6	19156	19161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248396
244	NT_187135	AAT	2	6	19187	19192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NT_187135	AAG	2	6	19293	19298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248397
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251	NT_187135	ACA	2	6	19566	19571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248397
252	NT_187135	TGA	2	6	19661	19666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248397
253	NT_187135	AGC	3	9	19754	19762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248397
254	NT_187135	AAG	2	6	19803	19808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248397
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256	NT_187135	TCA	2	6	19862	19867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248397
257	NT_187135	CAA	2	6	19903	19908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248397
258	NT_187135	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248397
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