MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187130	AGAATA	2	12	1026	1037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409248217
2	NT_187130	GGAATG	2	12	2604	2615	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409248218
3	NT_187130	GAAGGT	2	12	6622	6633	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409248221
4	NT_187130	GCCATT	2	12	9643	9654	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248225
5	NT_187130	TCCGGC	2	12	10439	10450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248226
6	NT_187130	AACTGC	2	12	11678	11689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248226
7	NT_187130	TACCGG	2	12	14164	14175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248227
8	NT_187130	CTGGTG	2	12	16591	16602	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409248228
9	NT_187130	ACGGAA	2	12	20899	20910	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409248233
10	NT_187130	CAACAG	2	12	22953	22964	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409248234
11	NT_187130	CACCAG	2	12	29398	29409	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409248241
12	NT_187130	GAATAT	2	12	30294	30305	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	409248242
13	NT_187130	CTCCCG	2	12	33093	33104	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	409248243
14	NT_187130	TCCTGC	2	12	33746	33757	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409248244
15	NT_187130	AGCAGG	2	12	36330	36341	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409248248
16	NT_187130	CCGCTG	2	12	38437	38448	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248250
17	NT_187130	ACCGCG	2	12	46105	46116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248258
18	NT_187130	AAGCAG	2	12	46395	46406	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409248258
19	NT_187130	AACCTG	2	12	46701	46712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248258
20	NT_187130	AAAGTG	2	12	47641	47652	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409248259
21	NT_187130	GCTGGC	2	12	49411	49422	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248262
22	NT_187130	TCGGCG	2	12	49788	49799	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248262
23	NT_187130	TTCCAG	2	12	52187	52198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248264
24	NT_187130	ATGGAT	2	12	60713	60724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248273
25	NT_187130	TTGAAG	2	12	64673	64684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248276
26	NT_187130	GAAAGA	2	12	67207	67218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248277
27	NT_187130	CAACAT	2	12	67837	67848	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	409248277
28	NT_187130	ATCTGC	2	12	68274	68285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248278
29	NT_187130	GCAGCG	2	12	68802	68813	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248279
30	NT_187130	CGACGG	2	12	69009	69020	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409248279
31	NT_187130	GTCGCC	2	12	72111	72122	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409248284
32	NT_187130	GCTGGC	2	12	84232	84243	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248295
33	NT_187130	AATATC	2	12	86180	86191	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	409248296
34	NT_187130	AATCAG	2	12	90447	90458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409248299
35	NT_187130	CTGGGC	2	12	103796	103807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248314
36	NT_187130	AACCGG	2	12	104271	104282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248314
37	NT_187130	AAGAGG	3	18	104283	104300	50 %	0 %	50 %	0 %	409248314
38	NT_187130	GACCAT	2	12	104643	104654	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409248315
39	NT_187130	AGCGAC	2	12	111099	111110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248319
40	NT_187130	ACGGTG	2	12	112824	112835	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	409248319
41	NT_187130	TGTTTG	2	12	118476	118487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248327
42	NT_187130	TCTTTC	2	12	123036	123047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248330
43	NT_187130	GTCGTA	2	12	133799	133810	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409248338
44	NT_187130	GCGGAA	2	12	139029	139040	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	409248344
45	NT_187130	TCTAAC	2	12	143060	143071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248348
46	NT_187130	CACGAA	2	12	143939	143950	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409248349
47	NT_187130	TGGCGC	2	12	145606	145617	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409248350
48	NT_187130	TCAGCG	2	12	148898	148909	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248353
49	NT_187130	CAGCGC	2	12	149133	149144	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409248353
50	NT_187130	CACCGC	2	12	149478	149489	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409248354

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.