MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187130	CCGCG	2	10	3537	3546	0 %	0 %	40 %	60 %	409248219
2	NT_187130	TTATG	2	10	7555	7564	20 %	60 %	20 %	0 %	409248223
3	NT_187130	CTTGG	2	10	10018	10027	0 %	40 %	40 %	20 %	409248225
4	NT_187130	AACCG	2	10	10055	10064	40 %	0 %	20 %	40 %	409248225
5	NT_187130	TCACC	2	10	10305	10314	20 %	20 %	0 %	60 %	409248226
6	NT_187130	CCAGT	2	10	11542	11551	20 %	20 %	20 %	40 %	409248226
7	NT_187130	TGGCG	2	10	13730	13739	0 %	20 %	60 %	20 %	409248227
8	NT_187130	GTTCG	2	10	17168	17177	0 %	40 %	40 %	20 %	409248229
9	NT_187130	CTGAA	2	10	17302	17311	40 %	20 %	20 %	20 %	409248230
10	NT_187130	CCCGT	2	10	23564	23573	0 %	20 %	20 %	60 %	409248236
11	NT_187130	GTTTT	2	10	27802	27811	0 %	80 %	20 %	0 %	409248239
12	NT_187130	CTGGT	2	10	27983	27992	0 %	40 %	40 %	20 %	409248240
13	NT_187130	GGGAA	2	10	30643	30652	40 %	0 %	60 %	0 %	409248242
14	NT_187130	AGCGG	2	10	31706	31715	20 %	0 %	60 %	20 %	409248243
15	NT_187130	GCCAG	2	10	34752	34761	20 %	0 %	40 %	40 %	409248245
16	NT_187130	ACCTT	2	10	34990	34999	20 %	40 %	0 %	40 %	409248246
17	NT_187130	CAGCA	2	10	35319	35328	40 %	0 %	20 %	40 %	409248246
18	NT_187130	ATGGA	2	10	38117	38126	40 %	20 %	40 %	0 %	409248249
19	NT_187130	CGGCG	2	10	47993	48002	0 %	0 %	60 %	40 %	409248260
20	NT_187130	ACAAA	2	10	48648	48657	80 %	0 %	0 %	20 %	409248261
21	NT_187130	TACCG	2	10	48702	48711	20 %	20 %	20 %	40 %	409248261
22	NT_187130	CGTTA	2	10	48713	48722	20 %	40 %	20 %	20 %	409248261
23	NT_187130	TGCCG	2	10	49148	49157	0 %	20 %	40 %	40 %	409248261
24	NT_187130	TTCGC	2	10	50171	50180	0 %	40 %	20 %	40 %	409248263
25	NT_187130	GCGCT	2	10	53514	53523	0 %	20 %	40 %	40 %	409248266
26	NT_187130	GACGT	2	10	53892	53901	20 %	20 %	40 %	20 %	409248267
27	NT_187130	CTGAT	2	10	54949	54958	20 %	40 %	20 %	20 %	409248267
28	NT_187130	GGGCA	2	10	58172	58181	20 %	0 %	60 %	20 %	409248270
29	NT_187130	TTGCC	2	10	58419	58428	0 %	40 %	20 %	40 %	409248270
30	NT_187130	TGCTT	2	10	59785	59794	0 %	60 %	20 %	20 %	409248272
31	NT_187130	ACAAT	2	10	60203	60212	60 %	20 %	0 %	20 %	409248272
32	NT_187130	GCCAA	2	10	61241	61250	40 %	0 %	20 %	40 %	409248273
33	NT_187130	ACCTT	2	10	64415	64424	20 %	40 %	0 %	40 %	409248276
34	NT_187130	TCGCG	2	10	64782	64791	0 %	20 %	40 %	40 %	409248276
35	NT_187130	GCCGG	2	10	67922	67931	0 %	0 %	60 %	40 %	409248277
36	NT_187130	GTTAT	2	10	68129	68138	20 %	60 %	20 %	0 %	409248277
37	NT_187130	CGCAG	2	10	69839	69848	20 %	0 %	40 %	40 %	409248280
38	NT_187130	ACGTG	2	10	71048	71057	20 %	20 %	40 %	20 %	409248282
39	NT_187130	GTCTG	2	10	71926	71935	0 %	40 %	40 %	20 %	409248283
40	NT_187130	TGGGA	2	10	72039	72048	20 %	20 %	60 %	0 %	409248283
41	NT_187130	CGCGG	2	10	72886	72895	0 %	0 %	60 %	40 %	409248285
42	NT_187130	GGTGA	2	10	73414	73423	20 %	20 %	60 %	0 %	409248285
43	NT_187130	AGACG	2	10	76846	76855	40 %	0 %	40 %	20 %	409248289
44	NT_187130	AAAGT	2	10	79213	79222	60 %	20 %	20 %	0 %	409248289
45	NT_187130	AGGTA	2	10	87127	87136	40 %	20 %	40 %	0 %	409248296
46	NT_187130	CGCTG	2	10	87686	87695	0 %	20 %	40 %	40 %	409248297
47	NT_187130	ATTGC	2	10	87970	87979	20 %	40 %	20 %	20 %	409248297
48	NT_187130	CGGCG	2	10	88718	88727	0 %	0 %	60 %	40 %	409248298
49	NT_187130	CCGCG	2	10	91758	91767	0 %	0 %	40 %	60 %	409248300
50	NT_187130	TCTTT	2	10	95897	95906	0 %	80 %	0 %	20 %	409248305
51	NT_187130	ATTTA	2	10	95939	95948	40 %	60 %	0 %	0 %	409248306
52	NT_187130	GCGTG	2	10	98565	98574	0 %	20 %	60 %	20 %	409248308
53	NT_187130	GTGAT	2	10	99488	99497	20 %	40 %	40 %	0 %	409248309
54	NT_187130	GGCTG	2	10	103427	103436	0 %	20 %	60 %	20 %	409248314
55	NT_187130	AGAGC	2	10	103948	103957	40 %	0 %	40 %	20 %	409248314
56	NT_187130	CCTGA	2	10	104501	104510	20 %	20 %	20 %	40 %	409248314
57	NT_187130	TACCG	2	10	105639	105648	20 %	20 %	20 %	40 %	409248315
58	NT_187130	GGCCG	2	10	106263	106272	0 %	0 %	60 %	40 %	409248315
59	NT_187130	CTTTT	2	10	107984	107993	0 %	80 %	0 %	20 %	409248316
60	NT_187130	CGGTA	2	10	109152	109161	20 %	20 %	40 %	20 %	409248317
61	NT_187130	CTGTT	2	10	109191	109200	0 %	60 %	20 %	20 %	409248317
62	NT_187130	TATTT	2	10	110025	110034	20 %	80 %	0 %	0 %	409248318
63	NT_187130	GCGTC	2	10	112948	112957	0 %	20 %	40 %	40 %	409248319
64	NT_187130	ATCTG	2	10	115556	115565	20 %	40 %	20 %	20 %	409248323
65	NT_187130	TTACG	2	10	115611	115620	20 %	40 %	20 %	20 %	409248323
66	NT_187130	GGGCG	2	10	116380	116389	0 %	0 %	80 %	20 %	409248324
67	NT_187130	TATAA	2	10	118756	118765	60 %	40 %	0 %	0 %	409248327
68	NT_187130	AGCGA	2	10	120182	120191	40 %	0 %	40 %	20 %	409248329
69	NT_187130	TCCTG	2	10	120392	120401	0 %	40 %	20 %	40 %	409248329
70	NT_187130	GGTCA	2	10	122627	122636	20 %	20 %	40 %	20 %	409248330
71	NT_187130	TTCAT	2	10	123899	123908	20 %	60 %	0 %	20 %	409248331
72	NT_187130	TAAAA	2	10	128781	128790	80 %	20 %	0 %	0 %	409248334
73	NT_187130	ACGGC	2	10	129077	129086	20 %	0 %	40 %	40 %	409248335
74	NT_187130	TTTTA	2	10	129403	129412	20 %	80 %	0 %	0 %	409248335
75	NT_187130	GGGCT	2	10	131151	131160	0 %	20 %	60 %	20 %	409248336
76	NT_187130	GCGTA	2	10	133027	133036	20 %	20 %	40 %	20 %	409248338
77	NT_187130	GACCA	2	10	133632	133641	40 %	0 %	20 %	40 %	409248338
78	NT_187130	CCGGC	2	10	133774	133783	0 %	0 %	40 %	60 %	409248338
79	NT_187130	CAGAC	2	10	134964	134973	40 %	0 %	20 %	40 %	409248338
80	NT_187130	TGTGC	2	10	137724	137733	0 %	40 %	40 %	20 %	409248343
81	NT_187130	GTTTG	2	10	140046	140055	0 %	60 %	40 %	0 %	409248344
82	NT_187130	CACTA	2	10	141177	141186	40 %	20 %	0 %	40 %	409248344
83	NT_187130	CGGCG	2	10	141715	141724	0 %	0 %	60 %	40 %	409248345
84	NT_187130	TTCAC	2	10	141970	141979	20 %	40 %	0 %	40 %	409248346
85	NT_187130	ACGCT	2	10	143365	143374	20 %	20 %	20 %	40 %	409248348
86	NT_187130	GGAAA	2	10	144328	144337	60 %	0 %	40 %	0 %	409248349
87	NT_187130	CGCTG	2	10	144818	144827	0 %	20 %	40 %	40 %	409248350
88	NT_187130	CGGCG	2	10	148584	148593	0 %	0 %	60 %	40 %	409248353
89	NT_187130	GCGCG	2	10	149531	149540	0 %	0 %	60 %	40 %	409248354

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.