MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 321

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187130	CAGC	2	8	521	528	25 %	0 %	25 %	50 %	409248217
2	NT_187130	CTTC	2	8	1933	1940	0 %	50 %	0 %	50 %	409248218
3	NT_187130	TCGG	2	8	2124	2131	0 %	25 %	50 %	25 %	409248218
4	NT_187130	CCAG	2	8	2164	2171	25 %	0 %	25 %	50 %	409248218
5	NT_187130	TCTG	2	8	2179	2186	0 %	50 %	25 %	25 %	409248218
6	NT_187130	CGCT	2	8	2342	2349	0 %	25 %	25 %	50 %	409248218
7	NT_187130	GGCT	2	8	2442	2449	0 %	25 %	50 %	25 %	409248218
8	NT_187130	CAGC	2	8	3025	3032	25 %	0 %	25 %	50 %	409248219
9	NT_187130	CGAC	2	8	3042	3049	25 %	0 %	25 %	50 %	409248219
10	NT_187130	CAGG	2	8	4203	4210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NT_187130	ACAG	2	8	4275	4282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NT_187130	CCGC	2	8	4680	4687	0 %	0 %	25 %	75 %	409248220
13	NT_187130	GCTG	2	8	5016	5023	0 %	25 %	50 %	25 %	409248220
14	NT_187130	GTTA	2	8	5206	5213	25 %	50 %	25 %	0 %	409248220
15	NT_187130	CAGA	2	8	5488	5495	50 %	0 %	25 %	25 %	409248220
16	NT_187130	CGGA	2	8	5502	5509	25 %	0 %	50 %	25 %	409248220
17	NT_187130	GCCA	2	8	5680	5687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NT_187130	GCTG	2	8	5920	5927	0 %	25 %	50 %	25 %	409248221
19	NT_187130	GCCA	2	8	5966	5973	25 %	0 %	25 %	50 %	409248221
20	NT_187130	TCGC	2	8	6030	6037	0 %	25 %	25 %	50 %	409248221
21	NT_187130	ATGT	2	8	6860	6867	25 %	50 %	25 %	0 %	409248221
22	NT_187130	TTAT	2	8	7237	7244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187130	TTGT	2	8	7279	7286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187130	AGGA	2	8	7481	7488	50 %	0 %	50 %	0 %	409248222
25	NT_187130	GCAA	2	8	7858	7865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NT_187130	AAGC	2	8	8085	8092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NT_187130	TAAA	2	8	8654	8661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187130	AGGA	2	8	8702	8709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187130	ATGG	2	8	9664	9671	25 %	25 %	50 %	0 %	409248225
30	NT_187130	CACC	2	8	10268	10275	25 %	0 %	0 %	75 %	409248225
31	NT_187130	TTCA	2	8	10321	10328	25 %	50 %	0 %	25 %	409248226
32	NT_187130	GCTC	2	8	10410	10417	0 %	25 %	25 %	50 %	409248226
33	NT_187130	TGTT	2	8	11021	11028	0 %	75 %	25 %	0 %	409248226
34	NT_187130	TCAA	2	8	11336	11343	50 %	25 %	0 %	25 %	409248226
35	NT_187130	GAAT	2	8	11988	11995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187130	GGCG	2	8	12376	12383	0 %	0 %	75 %	25 %	409248227
37	NT_187130	GGCG	2	8	12691	12698	0 %	0 %	75 %	25 %	409248227
38	NT_187130	AGCC	2	8	12764	12771	25 %	0 %	25 %	50 %	409248227
39	NT_187130	GATC	2	8	13645	13652	25 %	25 %	25 %	25 %	409248227
40	NT_187130	CGAG	2	8	14074	14081	25 %	0 %	50 %	25 %	409248227
41	NT_187130	GCTC	2	8	14266	14273	0 %	25 %	25 %	50 %	409248227
42	NT_187130	AACA	2	8	15191	15198	75 %	0 %	0 %	25 %	409248227
43	NT_187130	TATC	2	8	15593	15600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187130	GGAT	2	8	15777	15784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187130	TGTA	2	8	16946	16953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187130	CAGA	2	8	17220	17227	50 %	0 %	25 %	25 %	409248229
47	NT_187130	GATT	2	8	17339	17346	25 %	50 %	25 %	0 %	409248230
48	NT_187130	TGCT	2	8	18629	18636	0 %	50 %	25 %	25 %	409248232
49	NT_187130	TGGT	2	8	18684	18691	0 %	50 %	50 %	0 %	409248232
50	NT_187130	AGTG	2	8	21168	21175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187130	AGCC	2	8	22913	22920	25 %	0 %	25 %	50 %	409248234
52	NT_187130	TGCT	2	8	23402	23409	0 %	50 %	25 %	25 %	409248236
53	NT_187130	GCCA	2	8	23509	23516	25 %	0 %	25 %	50 %	409248236
54	NT_187130	TGTA	2	8	25352	25359	25 %	50 %	25 %	0 %	409248236
55	NT_187130	GGCG	2	8	25890	25897	0 %	0 %	75 %	25 %	409248236
56	NT_187130	GAAA	2	8	25912	25919	75 %	0 %	25 %	0 %	409248236
57	NT_187130	GCCA	2	8	26274	26281	25 %	0 %	25 %	50 %	409248237
58	NT_187130	TTAT	2	8	26486	26493	25 %	75 %	0 %	0 %	409248237
59	NT_187130	CTTT	2	8	28160	28167	0 %	75 %	0 %	25 %	409248240
60	NT_187130	TGAT	2	8	28574	28581	25 %	50 %	25 %	0 %	409248240
61	NT_187130	ACCA	2	8	28800	28807	50 %	0 %	0 %	50 %	409248241
62	NT_187130	GCCA	2	8	28894	28901	25 %	0 %	25 %	50 %	409248241
63	NT_187130	AATT	2	8	30088	30095	50 %	50 %	0 %	0 %	409248242
64	NT_187130	GCCA	2	8	30375	30382	25 %	0 %	25 %	50 %	409248242
65	NT_187130	TGAT	2	8	30715	30722	25 %	50 %	25 %	0 %	409248242
66	NT_187130	GCGG	2	8	31115	31122	0 %	0 %	75 %	25 %	409248243
67	NT_187130	CGTC	2	8	31143	31150	0 %	25 %	25 %	50 %	409248243
68	NT_187130	CCGG	2	8	31362	31369	0 %	0 %	50 %	50 %	409248243
69	NT_187130	GATC	2	8	31653	31660	25 %	25 %	25 %	25 %	409248243
70	NT_187130	TAGT	2	8	33737	33744	25 %	50 %	25 %	0 %	409248244
71	NT_187130	ACTG	2	8	33972	33979	25 %	25 %	25 %	25 %	409248244
72	NT_187130	TGCC	2	8	34071	34078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NT_187130	TGAT	2	8	34292	34299	25 %	50 %	25 %	0 %	409248245
74	NT_187130	AGGC	2	8	35267	35274	25 %	0 %	50 %	25 %	409248246
75	NT_187130	GACC	2	8	36345	36352	25 %	0 %	25 %	50 %	409248248
76	NT_187130	GCGG	2	8	36384	36391	0 %	0 %	75 %	25 %	409248248
77	NT_187130	ATTG	2	8	36704	36711	25 %	50 %	25 %	0 %	409248248
78	NT_187130	CTTT	2	8	36774	36781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NT_187130	CAGG	2	8	36891	36898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NT_187130	ATGG	2	8	37096	37103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187130	ATGA	2	8	37144	37151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187130	CAAT	2	8	37304	37311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NT_187130	TAAT	2	8	37339	37346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187130	ACAT	2	8	37680	37687	50 %	25 %	0 %	25 %	409248249
85	NT_187130	CGCT	2	8	37813	37820	0 %	25 %	25 %	50 %	409248249
86	NT_187130	AGAA	2	8	37822	37829	75 %	0 %	25 %	0 %	409248249
87	NT_187130	ACCT	2	8	38091	38098	25 %	25 %	0 %	50 %	409248249
88	NT_187130	GGCA	2	8	38934	38941	25 %	0 %	50 %	25 %	409248251
89	NT_187130	TCAG	2	8	39655	39662	25 %	25 %	25 %	25 %	409248252
90	NT_187130	GATA	2	8	40010	40017	50 %	25 %	25 %	0 %	409248252
91	NT_187130	TTAT	2	8	41439	41446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187130	AGGA	2	8	41921	41928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187130	GATT	2	8	42344	42351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NT_187130	GGCT	2	8	42760	42767	0 %	25 %	50 %	25 %	409248255
95	NT_187130	TGGC	2	8	42818	42825	0 %	25 %	50 %	25 %	409248255
96	NT_187130	ACGC	2	8	43109	43116	25 %	0 %	25 %	50 %	409248255
97	NT_187130	TGAT	2	8	44199	44206	25 %	50 %	25 %	0 %	409248256
98	NT_187130	ATCC	2	8	45020	45027	25 %	25 %	0 %	50 %	409248257
99	NT_187130	TGGA	2	8	45348	45355	25 %	25 %	50 %	0 %	409248258
100	NT_187130	TACC	2	8	45467	45474	25 %	25 %	0 %	50 %	409248258
101	NT_187130	GGCG	2	8	46220	46227	0 %	0 %	75 %	25 %	409248258
102	NT_187130	CTGG	2	8	47976	47983	0 %	25 %	50 %	25 %	409248260
103	NT_187130	TGCG	2	8	48334	48341	0 %	25 %	50 %	25 %	409248261
104	NT_187130	CTGG	2	8	48515	48522	0 %	25 %	50 %	25 %	409248261
105	NT_187130	GCTG	2	8	48868	48875	0 %	25 %	50 %	25 %	409248261
106	NT_187130	GGCG	2	8	49354	49361	0 %	0 %	75 %	25 %	409248262
107	NT_187130	CAGG	2	8	50686	50693	25 %	0 %	50 %	25 %	409248263
108	NT_187130	GATC	2	8	51529	51536	25 %	25 %	25 %	25 %	409248264
109	NT_187130	GCAT	2	8	51978	51985	25 %	25 %	25 %	25 %	409248264
110	NT_187130	ATCG	2	8	52040	52047	25 %	25 %	25 %	25 %	409248264
111	NT_187130	GGAA	2	8	52124	52131	50 %	0 %	50 %	0 %	409248264
112	NT_187130	AGGC	2	8	52447	52454	25 %	0 %	50 %	25 %	409248264
113	NT_187130	AGCA	2	8	52730	52737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NT_187130	TGCG	2	8	52741	52748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NT_187130	TACG	2	8	53332	53339	25 %	25 %	25 %	25 %	409248266
116	NT_187130	AGCA	2	8	54902	54909	50 %	0 %	25 %	25 %	409248267
117	NT_187130	TGCC	2	8	55526	55533	0 %	25 %	25 %	50 %	409248268
118	NT_187130	TGCG	2	8	56399	56406	0 %	25 %	50 %	25 %	409248269
119	NT_187130	CTTT	2	8	57149	57156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NT_187130	GCGG	2	8	57686	57693	0 %	0 %	75 %	25 %	409248270
121	NT_187130	GAGG	2	8	58028	58035	25 %	0 %	75 %	0 %	409248270
122	NT_187130	ATGC	2	8	58253	58260	25 %	25 %	25 %	25 %	409248270
123	NT_187130	GACG	2	8	59375	59382	25 %	0 %	50 %	25 %	409248271
124	NT_187130	CTTT	2	8	60431	60438	0 %	75 %	0 %	25 %	409248273
125	NT_187130	TTTG	2	8	61447	61454	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187130	AATG	2	8	61456	61463	50 %	25 %	25 %	0 %	409248274
127	NT_187130	AACG	2	8	61564	61571	50 %	0 %	25 %	25 %	409248274
128	NT_187130	TCCG	2	8	62268	62275	0 %	25 %	25 %	50 %	409248274
129	NT_187130	CGGT	2	8	62411	62418	0 %	25 %	50 %	25 %	409248274
130	NT_187130	TGCC	2	8	62708	62715	0 %	25 %	25 %	50 %	409248274
131	NT_187130	GGAA	2	8	62739	62746	50 %	0 %	50 %	0 %	409248274
132	NT_187130	TGTA	2	8	62811	62818	25 %	50 %	25 %	0 %	409248274
133	NT_187130	GAAA	2	8	64083	64090	75 %	0 %	25 %	0 %	409248275
134	NT_187130	GTTC	2	8	64101	64108	0 %	50 %	25 %	25 %	409248275
135	NT_187130	ATTT	2	8	64304	64311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187130	GCGT	2	8	64362	64369	0 %	25 %	50 %	25 %	409248276
137	NT_187130	TCGT	2	8	64553	64560	0 %	50 %	25 %	25 %	409248276
138	NT_187130	CCAG	2	8	65229	65236	25 %	0 %	25 %	50 %	409248276
139	NT_187130	CAGC	2	8	66053	66060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NT_187130	GATG	2	8	66325	66332	25 %	25 %	50 %	0 %	409248277
141	NT_187130	GCAA	2	8	66711	66718	50 %	0 %	25 %	25 %	409248277
142	NT_187130	GGTT	2	8	66774	66781	0 %	50 %	50 %	0 %	409248277
143	NT_187130	CGCA	2	8	66874	66881	25 %	0 %	25 %	50 %	409248277
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321	NT_187130	GCTG	2	8	149714	149721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.