MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187130	CAGG	2	8	4203	4210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NT_187130	ACAG	2	8	4275	4282	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187130	GCCA	2	8	5680	5687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187130	TTAT	2	8	7237	7244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187130	TTGT	2	8	7279	7286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187130	GCAA	2	8	7858	7865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NT_187130	AAGC	2	8	8085	8092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NT_187130	TAAA	2	8	8654	8661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187130	AGGA	2	8	8702	8709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187130	GAAT	2	8	11988	11995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187130	TATC	2	8	15593	15600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NT_187130	GGAT	2	8	15777	15784	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187130	TGTA	2	8	16946	16953	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187130	AGTG	2	8	21168	21175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187130	TGCC	2	8	34071	34078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NT_187130	CTTT	2	8	36774	36781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NT_187130	CAGG	2	8	36891	36898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187130	ATGG	2	8	37096	37103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187130	ATGA	2	8	37144	37151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187130	CAAT	2	8	37304	37311	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NT_187130	TAAT	2	8	37339	37346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187130	TTAT	2	8	41439	41446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187130	AGGA	2	8	41921	41928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187130	GATT	2	8	42344	42351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187130	AGCA	2	8	52730	52737	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NT_187130	TGCG	2	8	52741	52748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NT_187130	CTTT	2	8	57149	57156	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NT_187130	TTTG	2	8	61447	61454	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187130	ATTT	2	8	64304	64311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187130	CAGC	2	8	66053	66060	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NT_187130	GTTA	2	8	74952	74959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187130	CCTG	2	8	79961	79968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187130	TAAA	2	8	81632	81639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187130	GGCG	2	8	81863	81870	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NT_187130	CCTG	2	8	83283	83290	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NT_187130	TAAA	2	8	83671	83678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187130	AGAC	2	8	84727	84734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NT_187130	CTGT	2	8	93240	93247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NT_187130	TGCA	2	8	98140	98147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NT_187130	TTAT	2	8	107854	107861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187130	TGAA	2	8	109057	109064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187130	CCAG	2	8	117937	117944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NT_187130	TGAT	2	8	119623	119630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187130	ATTA	2	8	123356	123363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NT_187130	AATT	2	8	124637	124644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187130	TTTG	2	8	127495	127502	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187130	AGTA	2	8	136526	136533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187130	ATCA	2	8	136566	136573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NT_187130	GAAA	2	8	136686	136693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187130	AGGG	2	8	136719	136726	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187130	GCTG	2	8	149714	149721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.